BLASTN 2.2.24 [Aug-08-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= DPGLEAN00174 (UTR included)
(1777 letters)
Database: est
9484 sequences; 8,280,457 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
BF01012A2C08 1368 0.0
BF14_462_C1 1003 0.0
>BF01012A2C08
Length = 774
Score = 1368 bits (690), Expect = 0.0
Identities = 696/698 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 cttctattttagattgaaaatatttacattttaaactattttatcaatatttttcaatta 60
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Sbjct: 77 cttctattttagattgaaaatatttacattttaaactattttatcaatatttttcaatta 136
Query: 61 caactttcatctctagatcctcttagaatatgaacaatgtttgtctgttatgacatgtaa 120
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Sbjct: 137 caactttcatctctagatcctcttagaatatgaacaatgtttgtctgttatgacatgtaa 196
Query: 121 aagtcaataattatagaaatttggtaaatatttgtgctagaattccatttatgtttatta 180
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Sbjct: 197 aagtcaataattatagaaatttggtaaatatttgtgctagaattccatttatgtttatta 256
Query: 181 aacataaatcaaaaaaatttgagtctttgttaatactactcaatccattctttaaactat 240
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Sbjct: 257 aacataaatcaaaaaattttgagtctttgttaatactactcaatccattctttaaactat 316
Query: 241 atgacacctgaaaatatacattataactaagaaaaatgtcggaagtaaagaaaagaagca 300
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Sbjct: 317 atgacacctgaaaatatacattataactaagaaaaatgtcggaagtaaagaaaagaagca 376
Query: 301 aacaaagtattagcaccgacaaaatcttagagtctgaagaaaaaaaagctaaagaaaaag 360
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Sbjct: 377 aacaaagtattagcaccgacaaaatcttagagtctgaagaaaaaaaagctaaagaaaaag 436
Query: 361 cgtaagtaaataaaacagaattattaaatatcaatacaaatattaagaaatgtttttctt 420
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Sbjct: 437 cgtaagtaaataaaacagaattattaaatatcaatacaaatattaagaaatgtttttctt 496
Query: 421 gcagctcaccaaataaaaatttacctctaaggattctttctcgaactgtagttatatttt 480
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Sbjct: 497 gcagctcaccaaataaaaatttacctctaaggattctttctcgaactgtagttatatttt 556
Query: 481 cactattgataattgtttatatgtcagcaaaagatagaacaaaaatttttgccaaacaaa 540
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Sbjct: 557 cactattgataattgtttatatgtcagcaaaagataaaacaaaaatttttgccaaacaaa 616
Query: 541 cggaagtaattccagggaaaggattgattattgagtgttcctctgaatatatgaaagaat 600
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Sbjct: 617 cggaagtaattccagggaaaggattgattattgagtgttcctctgaatatatgaaagaat 676
Query: 601 tagatgaatatgaaggctgtgcaccaaaaaattgtaaaagatatgttaccgatactgtta 660
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Sbjct: 677 tagatgaatatgaaggctgtgcaccaaaaaattgtaaaagatatgttaccgatactgtta 736
Query: 661 tatctacaaaagaagctgacgagcttctgaatatggcg 698
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Sbjct: 737 tatctacaaaagaagctgacgagcttctgaatatggcg 774
>BF14_462_C1
Length = 879
Score = 1003 bits (506), Expect = 0.0
Identities = 512/514 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 425 ctcaccaaataaaaatttacctctaaggattctttctcgaactgtagttatattttcact 484
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Sbjct: 366 ctcaccaaataaaaatttacctctaaggattctttctcgaactgtagttatattttcact 425
Query: 485 attgataattgtttatatgtcagcaaaagatagaacaaaaatttttgccaaacaaacgga 544
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Sbjct: 426 attgataattgtttatatgtcagcaaaagataaaacaaaaatttttgccaaacaaacgga 485
Query: 545 agtaattccagggaaaggattgattattgagtgttcctctgaatatatgaaagaattaga 604
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Sbjct: 486 agtaattccagggaaaggattgattattgagtgttcctctgaatatatgaaagaattaga 545
Query: 605 tgaatatgaaggctgtgcaccaaaaaattgtaaaagatatgttaccgatactgttatatc 664
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Sbjct: 546 tgaatatgaaggctgtgcaccaaaaaattgtaaaagatatgttaccgatactgttatatc 605
Query: 665 tacaaaagaagctgacgagcttctgaatatggcgaagagaggtttaaaacatggaggttc 724
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Sbjct: 606 tacaaaagaagctgacgagcttctgaatatggcgaagagaggtttaaaacatggaggttc 665
Query: 725 tctaggaggggcatcaatattagacctacatagtggtgccttatcgaagggctcaaattt 784
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Sbjct: 666 tctaggaggggcatcaatattagacctacatagtggtgccttatcgaagggctcaaattt 725
Query: 785 tgtaaatttctataaattgaaagaaatgaaaaacatctttgatcagaatgattttaacac 844
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Sbjct: 726 tgtaaatttctataaattgaaagaaatgaaaaatatctttgatcagaatgattttaacac 785
Query: 845 ttttagggtggtgaaggacaaaattaaatatgctattgctcatcactttggagttcagcc 904
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Sbjct: 786 ttttagggtggtgaaggacaaaattaaatatgctattgctcatcactttggagttcagcc 845
Query: 905 aactaaaatatatttgacatatcccacattcttt 938
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Sbjct: 846 aactaaaatatatttgacatatcccacattcttt 879
Score = 676 bits (341), Expect = 0.0
Identities = 356/361 (98%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 cttctattttagattgaaaatatttacattttaaactattttatcaatatttttcaatta 60
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Sbjct: 5 cttctattttagattgaaaatatttacattttaaactattttatcaatatttttcaatta 64
Query: 61 caactttcatctctagatcctcttagaatatgaacaatgtttgtctgttatgacatgtaa 120
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Sbjct: 65 caactttcatctctagatcctcttagaatatgaacaatgtttgtctgttatgacatgtaa 124
Query: 121 aagtcaataattatagaaatttggtaaatatttgtgctagaattccatttatgtttatta 180
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Sbjct: 125 aagtcaataattatagagatttggtaaatatttgtgctagaattccatttatgtttatta 184
Query: 181 aacataaatcaaaaaaatttgagtctttgttaatactactcaatccattctttaaactat 240
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Sbjct: 185 aacataaatcaaaaaattttgagtctttgttaatactaatcaatccattctttaaactat 244
Query: 241 atgacacctgaaaatatacattataactaagaaaaatgtcggaagtaaagaaaagaagca 300
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Sbjct: 245 atgacacctgaaaatatacattataactaagaaaaatgtcggaagtaaagagaagaaaca 304
Query: 301 aacaaagtattagcaccgacaaaatcttagagtctgaagaaaaaaaagctaaagaaaaag 360
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Sbjct: 305 aacaaagtattagcaccgacaaaatcttagagtctgaagaaaaaaaagctaaagaaaaag 364
Query: 361 c 361
|
Sbjct: 365 c 365
Database: est
Posted date: Jul 14, 2011 2:25 PM
Number of letters in database: 8,280,457
Number of sequences in database: 9484
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Sequences: 9484
Number of Hits to DB: 298,127
Number of extensions: 6114
Number of successful extensions: 6114
Number of sequences better than 1.0e-10: 2
Number of HSP's gapped: 6114
Number of HSP's successfully gapped: 3
Length of query: 1777
Length of database: 8,280,457
Length adjustment: 17
Effective length of query: 1760
Effective length of database: 8,119,229
Effective search space: 14289843040
Effective search space used: 14289843040
X1: 11 (21.8 bits)
X2: 15 (29.7 bits)
X3: 50 (99.1 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 34 (67.9 bits)