BLASTN 2.2.24 [Aug-08-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= DPGLEAN00225 (UTR included)
(2706 letters)
Database: est
9484 sequences; 8,280,457 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
BF14_419_C2 1863 0.0
BF14_1469_C1 1826 0.0
BF14_419_C1 1344 0.0
>BF14_419_C2
Length = 1026
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Identities = 1004/1026 (97%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1264 aaacaaatacatggaaactaaacaaaaaagttttaaaaatggaggaacaaaagcttcaaa 1323
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Sbjct: 1 aaacaaatacatggaaactaaacaaaaaagttttaaaaatggaggaacaaaagctttaaa 60
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Query: 1384 aattactagcaccgtgggttctatcacagaacatacgcaaggatatccaaccaaaccaca 1443
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Sbjct: 121 aattactagcaccgtgggttctatcacagaacatacgcaaggatatccaaccaaaccaca 180
Query: 1444 atcgatagaagaaacatcgctggaacttacagtaattttaagggaaccaaatgaaaatac 1503
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Sbjct: 301 acaaaataatatggcagataatgaaacagaaataccaaccacgtcatcacatgtatttcc 360
Query: 1624 aacgtctacacaagagaataacctgaatgaagataaatttagagatatgaatgtttctaa 1683
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Query: 1744 tgataatgtccaaaccaaagctaatgacgaaagtaaagacttagcgatgacaaactctct 1803
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Sbjct: 481 tgataatgtccaaaccaaggctaatgacgaaagtaaagatttaccgatgacaaaccatct 540
Query: 1804 gtcagtattatctcttattaaaaagtataacaatagtgctactaatataaacttgacgtc 1863
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Query: 1864 agaaaacagtactatagatgcatctgtcacaatcgaagtaattgaggatgcaaaagctac 1923
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Query: 1924 aaataaaactgttgaaccggagagtgaattgaaaattaacgatacaagaaataatttttt 1983
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Sbjct: 661 aaataaaactgttgaaccggagagtgaattgaaaattaacgatacaagaaataatttttt 720
Query: 1984 taacttttccgaaaacgagccttttaacgtaacagtaaaagaaggatttgacagcatcat 2043
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Query: 2044 agattccaattttgatttagacaggaacatgacttcagatacagatgatttccaatctcc 2103
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Sbjct: 781 agattccaattttgatttagacaggaacatgacttcagatacagatgatttccaatctcc 840
Query: 2104 tctcttgtctgctgctagtgaaccgcttccaaaaccaaatagatccaggcgaattcaaca 2163
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Sbjct: 841 tctcttgtcagctgctagtgaaccgcttccaaaaccaaatagatccaggcgaattcaaca 900
Query: 2164 acaaacacgaaataagtttaatccgtttcgtattttaggctaaattcatatccatatatc 2223
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Sbjct: 901 acaaacacgaaataagtttaatccgtttcgtattttaggctaaattcatatccatatatc 960
Query: 2224 cgatgccgatctctgaagtcatgactgataaaaaacatcaacgtaatcttattataggat 2283
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Sbjct: 961 ctatgccgatctctgaagtcatgactgatnnaaaacatcaacgtaatcttattataggat 1020
Query: 2284 gtattt 2289
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Sbjct: 1021 gtattt 1026
>BF14_1469_C1
Length = 1123
Score = 1826 bits (921), Expect = 0.0
Identities = 942/949 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 54 tcacagtggatacgactgctcaatacgatgctgtcagggcatatcttaaagagcttgata 113
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Sbjct: 175 tcactgtggatacgactgctcaatacgacgctgtcagggcatatcttaaagagcttgata 234
Query: 114 tatccagtgctgtatgggttggactcatccgaagcaacccagatggagattttacctgga 173
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Sbjct: 235 tatccagtgctgtatgggttggactcatccgaagcaacccagatggagattttacctgga 294
Query: 174 cggactaccgaggtttaagtggtgatggatattggagtgctgcacctgatactcgttctg 233
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Sbjct: 295 cggactaccgaggtttaagtggtgatggatattggagtgctgcacctgatactcgttctg 354
Query: 234 ctcctttgtgtgctgctgccgatcctgctgctgactatcgttgggaagctcgagcttgtg 293
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Sbjct: 355 ctcctttgtgtgctgctgccgatcctgctgctgactatcgttgggaagctcgagcttgtg 414
Query: 294 gtggaccctccgttgcatctttcatttgtgaactacctgtaccgcaatgggcacttggta 353
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Sbjct: 415 gtggaccccctgttgcatctttcatttgtgaactacctgtaccgcaatgggcacttggta 474
Query: 354 atgaaggctgcatggtacgggcattgccagcacttacgattctttatttacctgagagcg 413
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Sbjct: 475 atgaaggctgcatggtacgggcattgccagcacttacgattctttatttacctgagagcg 534
Query: 414 ccgcggtacaactaactgcggattgcggtttggctggagttaaacgggttcaatgcactg 473
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Sbjct: 535 ccgcggtacaactaactgcggattgcggtttggctggagttaaacgggttcaatgcactg 594
Query: 474 gaaacgtgaaacgggaggacttgcttaaagagctagcatgtactgaggaagatcaaacaa 533
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Sbjct: 595 gaaacgtgaaacgggaggacttgcttaaagagctagcatgtactgaggaagatcaaacaa 654
Query: 534 ctttaacttcaattggaacgtctccaattacatcgtggcaaatgaccacagattcgatat 593
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Sbjct: 655 ctttaacttcaaatggaacgtctccaattacatcgtggcaaatgaccacagattcgatat 714
Query: 594 ttaacaatcaatattttaataatgaaggtactggcacagaagaaaatgttaccacagaac 653
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Sbjct: 715 ttaacaatcaatattttaataatgaaggtactggcacagaagaaaatgttaccacagaac 774
Query: 654 acgaggatgatataaatcaatcaagtcctattaaagttatatctacctcgtttaccatca 713
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Sbjct: 775 acgaggatgatataaatcaatcaagtcctattaaagttatatctacctcgtttaccatca 834
Query: 714 ttcctgatacttctaataaagtttccttaaaaccttctgtcacagaacaattgttcaaaa 773
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Sbjct: 835 ttcctgatacttctaataaagtttccttaaaaccttctgtcacagaacaattgttcaaaa 894
Query: 774 cacctttgcagaaacatattgatattataaataataattatattcaacaaaatgaaacac 833
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Sbjct: 895 cacctttgcagaaacatattgatattataaataataattatattcaacaaaatgaaacac 954
Query: 834 cgaaattagttcacgatgatgacttgttcactaatgaacaaaataatcaacagggaaatg 893
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Sbjct: 955 cgaaattagttcacgatgatgacttgttcactaatgaacaaaataatcaacagggaaatg 1014
Query: 894 ataaaatgttacaatatacaaaattgcatgatgaacttgcacgcctaggtaattcagata 953
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Sbjct: 1015 ataaaatattacaatatacaaaattgcatgatgaacttacacgcctaggtaattcagata 1074
Query: 954 ctgtatttagtcaacccactgaccattttgttcctcctttggttatggc 1002
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Sbjct: 1075 ctgtatttagtcaacccactgaccattttgttcctcctttggttatggc 1123
>BF14_419_C1
Length = 824
Score = 1344 bits (678), Expect = 0.0
Identities = 740/758 (97%), Gaps = 10/758 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1951 attgaaaattaacgatacaagaaataatttttttaacttttccgaaaacgagccttttaa 2010
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Sbjct: 3 attgaaaattaacgatacannaaataatttttttaacttttccgaaaacgagccttttaa 62
Query: 2011 cgtaacagtaaaagaaggatttgacagcatcatagattccaat-tttgatttagacagga 2069
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Sbjct: 63 cgtaacagtaaaagaaggatttgacagcatcatagattccaatctttgatttaaacagga 122
Query: 2070 acatgacttcagatacagatgatttccaatctcctctcttgtctgctgctagtgaaccgc 2129
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Sbjct: 123 acatgacttcagatacagatgatttccaatctcctctcttgtctgctgctagtgaaccgc 182
Query: 2130 ttccaaaaccaaatagatccaggcgaattcaacaacaaacacgaaataagtttaatccgt 2189
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Sbjct: 183 ttccaaaaccaaatagatccaggcgaattcaacaacaggcacgaaataagtttaatccgt 242
Query: 2190 ttcgtattttaggctaaattcatatccatatatccgatgccgatctctgaagtcatgact 2249
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Sbjct: 243 ttcgtattttaggctaaattcatatccatatatcccatgccgatctctgaagtcatgact 302
Query: 2250 gataaaa-aacatcaacgtaatcttattataggatgtattttataatcacaaattgtgat 2308
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Sbjct: 303 gataaaaaaacatcaacgtaatcttattataggatgtattttataatcacaaattgtgat 362
Query: 2309 agcaccgtgcacttaggtgatattcattattcaatattaaaaagtttcttagcagttgta 2368
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Sbjct: 363 agcaccgtgcacttaggtgatattcattattcaatattaaaaagtttcttagcagttgta 422
Query: 2369 ggtcaaggttcatatttaagtaacatcaaagcactacattctttaacattattataaaaa 2428
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Sbjct: 423 ggtcaaggttcatattgaagtaacatcaaagcactacattctttaacattattataaaaa 482
Query: 2429 tcattcataatcttataatgtagtcaattcttaaatatagcatagctatcaattattatt 2488
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Sbjct: 483 tcattcataatcttataatgtagtcaattcttaaatatagcatagctatcaattattatt 542
Query: 2489 atattctatattaaagagtttcgggtagcgaagagggaaaattatagttggtttatagat 2548
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Sbjct: 543 atattctatattaaagagtttcgggtagcgaagagggaaaattatagttgg-ttatagat 601
Query: 2549 tagcttataaataaacataactgtgtttaagaatttcgcccctcaaatcttttacaacgt 2608
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Sbjct: 602 tagcttataaataaacat-------tataagaatttcgcccctcaaatcttttacaacgt 654
Query: 2609 taatattaactcacagtcatatcactctagttaagtccttttaacgttttataaagtcaa 2668
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Sbjct: 655 taatattaactcacagtcatatcactctagttaagtccttttaacgttttataaagtcaa 714
Query: 2669 aatatttatgacgacaaatatgtttgcagaattcatct 2706
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Sbjct: 715 aatatttatgacgacaaatatgtttgcagaattcatct 752
Database: est
Posted date: Jul 14, 2011 2:25 PM
Number of letters in database: 8,280,457
Number of sequences in database: 9484
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Sequences: 9484
Number of Hits to DB: 355,092
Number of extensions: 7064
Number of successful extensions: 7064
Number of sequences better than 1.0e-10: 3
Number of HSP's gapped: 7058
Number of HSP's successfully gapped: 4
Length of query: 2706
Length of database: 8,280,457
Length adjustment: 17
Effective length of query: 2689
Effective length of database: 8,119,229
Effective search space: 21832606781
Effective search space used: 21832606781
X1: 11 (21.8 bits)
X2: 15 (29.7 bits)
X3: 50 (99.1 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 34 (67.9 bits)