BLASTN 2.2.24 [Aug-08-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= DPGLEAN00566 (UTR included)
(2326 letters)
Database: est
9484 sequences; 8,280,457 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
BF14_2292_C1 3207 0.0
>BF14_2292_C1
Length = 1693
Score = 3207 bits (1618), Expect = 0.0
Identities = 1672/1692 (98%)
Strand = Plus / Plus
Query: 404 tcttattatagtgtgtttctaagttcctattgagaaaaggttaccgatatatttgcgaat 463
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Sbjct: 2 tcttattatagtgtgtttctaagttcctattgagaaaaggttaccgatatatttgcgaat 61
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Query: 524 tcttatattaagcttctcatggattgaatatttatgggaactatatctctccttacggca 583
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Query: 584 gcgtaaaatatataaaactaacaaaaacatcccagaggaccttaaaacaatgctaaatga 643
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Sbjct: 182 gcgtaaaatatataaaactaacaaaaacatcccagaggaccttaaaacgatgctaaatga 241
Query: 644 agagcaatttgaaaaagctcgtatatatggaattgataagacaaacctcaaaatagctaa 703
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Sbjct: 242 agagcaattcgaaaaagctcgtatatatggaattgataagacaaacctcaaaatagctaa 301
Query: 704 ggaattttacagtatgacaataacatcaataattctttataagagatggatatctgttgc 763
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Query: 764 atggcataagtcagaaggcattgctgagattttcaatgttagtcccaaacaagaaatttt 823
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Query: 824 aataagttgtacttttatgacatttgtaacattattcaactttgttactaatatgccttt 883
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Sbjct: 422 aataagttgtacttttatgacatttgtaacattattcaactttgttactaatatgccttt 481
Query: 884 ctcaatctatggcacttttgtactcgaacagaaacatggtttcaacaagcaaactgttgg 943
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Sbjct: 482 ctcaatctatggcacttttgtactcgaacagaaacatggtttcaacaagcaaactgttgg 541
Query: 944 ctttttcataaaagaccaattgaaatctttagtactcagtcttgttataacattaccagt 1003
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Query: 1004 ggtttcaatggcaatatacataataatgcttggtggtaaaatgtttgtagtttggttatg 1063
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Sbjct: 602 ggtttcaatggcaatatacataataatgcttggtggtaaaatgtttgtagtttggttatg 661
Query: 1064 gctatttaccactgtgactactttgttattgctaatgctttacccttcagtaatagcacc 1123
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Query: 1124 tttgtttgataaatttgttcctctatctgatggttctctgagaaccgcgatagagaatct 1183
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Query: 1184 agcatcaaaacttaaatttcctcttactcagatatacattgtggaaggttccaagagatc 1243
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Query: 1244 ggctcatagtaatgcatatttcagtggtctgtttggtgctaaaagaattgttttatttga 1303
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Query: 1304 tactttactagagaaagtagatgaagatacaaaagttacaacgggctgtacggaaagtga 1363
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Query: 1364 aattttgggtgttttagcacatgaacttggtcactggagttgtagccacatttataaatc 1423
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Query: 1424 catagctctaactgaagttaacttacttcttctatttacagcatttggggctcttttcag 1483
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Sbjct: 1022 catagctctaactgaagttaacttacttcttctatttacagcatttggggctcttttcag 1081
Query: 1484 atattccatgttatatatggctttaggattccctcaaggccaggaaccaattattattgg 1543
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Sbjct: 1082 atattccatgttatatatggctttaggattccctcaaggacaggaaccaattattattgg 1141
Query: 1544 actgattgttgtcttacaacttattcttgcaccgtacaattcacttttgtcattctttgc 1603
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Sbjct: 1142 actgattgttgtcttacaacttattcttgcaccgtacaattcacttttgtcattctttgc 1201
Query: 1604 aacagctttatctagaaaatttgagtttgaagctgataactttgcagtttcccttaatta 1663
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Sbjct: 1202 aacagctttatctagaaaatttgagtttgaagctgataactttgcagtttcccttaatta 1261
Query: 1664 ttctaaggaactgagatctgctctcattaagttagggaaagataatttggatttcccgat 1723
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Sbjct: 1262 ttctaaagaactgagatctgctctcattaagttagggaaagataatttggatttcccgat 1321
Query: 1724 ctacgacaaactttactcagcctggtaccattcacatccaactttgttgcatagaattga 1783
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Query: 1784 aaatattcagaatttaatcaaagagcaaaagaaagaattgtaaattatgcataaaaataa 1843
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Sbjct: 1382 aaatattcagaatttaatcaaagagcaaaagaaagatttgtaaattatgcataaaaataa 1441
Query: 1844 tagtaatacagtgagttgactacttatatcagtacaattaataattaagtggttttgcat 1903
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Sbjct: 1442 tagtaatacagtgagttgactacttatatcagtacaattaataattaagtggttttgcat 1501
Query: 1904 ttaaatgtgctactataagatctattttatgataatgcagcataattaatgtattttccc 1963
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Sbjct: 1502 ttaaatgtgctactataagatctattttatgataatgcagcataattaatgtattttccc 1561
Query: 1964 ctataaaatacatgcacaaagtgaaaatcgcatttaaaacatgcactcggattaggctta 2023
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Query: 2024 gaaagtgaaccataatgttttgaaagcatttaaaatataatgaacaccaatattttttat 2083
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Sbjct: 1622 aaaagtgaacccntatgttttgaaagcatttaaaatataatgaacaccaatattttttat 1681
Query: 2084 actatattttat 2095
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Sbjct: 1682 actatattttat 1693
Database: est
Posted date: Jul 14, 2011 2:25 PM
Number of letters in database: 8,280,457
Number of sequences in database: 9484
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Sequences: 9484
Number of Hits to DB: 342,108
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Number of successful extensions: 7430
Number of sequences better than 1.0e-10: 1
Number of HSP's gapped: 7430
Number of HSP's successfully gapped: 1
Length of query: 2326
Length of database: 8,280,457
Length adjustment: 17
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Effective length of database: 8,119,229
Effective search space: 18747299761
Effective search space used: 18747299761
X1: 11 (21.8 bits)
X2: 15 (29.7 bits)
X3: 50 (99.1 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 34 (67.9 bits)