BLASTN 2.2.24 [Aug-08-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= DPGLEAN00859 (UTR included)
(2002 letters)
Database: est
9484 sequences; 8,280,457 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
BF01026A1E10 971 0.0
BF14_2238_C1 708 0.0
BF01014B2D12 335 2e-91
BF14_314_C1 103 1e-21
BF01019A1H08 101 4e-21
BF01030A1C12 100 2e-20
BF01015A2C08 86 3e-16
BF14_335_C4 78 6e-14
BF01049B1F01 72 4e-12
>BF01026A1E10
Length = 717
Score = 971 bits (490), Expect = 0.0
Identities = 505/510 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 559 gttgctgtggttgttgctctgctcttcgtcctcgatacaagcgcctggtcgacaacatct 618
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Query: 619 tccccgcttcccctcaggatgggctggtcaagtcgaatatggaaaaactcaccttctact 678
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Query: 679 cgctctccagtccagagaagcttgacaggatcggggagtacctgttccagaaagccgcca 738
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Sbjct: 230 cgctctccagtccagagaagcttgacaggatcggggagtacctgttccagaaagccgcca 289
Query: 739 gggatatttatagacgacggcatggtttcgtgataatcgctatggaggctatggaccagt 798
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Sbjct: 290 gggatatttatagacgacggcatggttttgtgataatcgctatggaggctatggaccagt 349
Query: 799 tgttgttggcctgtcactcgcagactctcaacctgttcgttgagagtttccttaaaatgg 858
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Sbjct: 350 tgttgttggcctgtcactcgcagactctcaacctgttcgtggagagcttccttaaaatgg 409
Query: 859 tgcagaagttattggagtccaccgaccctcagctgcagatcctggccacacagagtttcg 918
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Sbjct: 410 tgcagaagctattggagtccaccgaccctcagctgcagatcctggccacacagagtttcg 469
Query: 919 tcagattcgcgaacatagaggaggatactccgtcgtatcatcgcagatacgacttcttcg 978
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Sbjct: 470 tcagattcgcgaacatagaggaggatactccgtcgtatcatcgcagatacgacttcttcg 529
Query: 979 tgtccaagttctccgccatgtgtcacagtaaccacaacgaccaggcggtcagagacaaca 1038
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Sbjct: 530 tgtccaagttctccgccatgtgtcacagtaaccacaacgaccaggcggtcagagacaaca 589
Query: 1039 tccggctcgctgggatacaggggctccagg 1068
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Sbjct: 590 tccggctcgctgggatacaggggctccagg 619
Score = 168 bits (85), Expect = 2e-41
Identities = 97/103 (94%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1139 ccagggcgtgataaggaagacggtgtccgacgacctcgtggagaacatctgggaggccca 1198
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Sbjct: 615 ccagggcgtgataaggaagacggtgtccgacgacctcgtggannacatctgggnnnncca 674
Query: 1199 gcacatggacaagatcgtaccctcgctgctctataacatgcag 1241
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Sbjct: 675 gcacatggacaagatcgtaccctcgctgctctataacatgcag 717
>BF14_2238_C1
Length = 790
Score = 708 bits (357), Expect = 0.0
Identities = 374/380 (98%)
Strand = Plus / Plus
Query: 557 atgttgctgtggttgttgctctgctcttcgtcctcgatacaagcgcctggtcgacaacat 616
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Sbjct: 411 atgttgctgtggttgttgctccgctcttcgtcctcgatacaagcgcctggtcgacaacat 470
Query: 617 cttccccgcttcccctcaggatgggctggtcaagtcgaatatggaaaaactcaccttcta 676
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Sbjct: 471 cttccccgcttcccctcaggatgggctggtcaagtcgaatatggaaaaactcaccttcta 530
Query: 677 ctcgctctccagtccagagaagcttgacaggatcggggagtacctgttccagaaagccgc 736
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Sbjct: 531 ctcgctctccagtccagagaagcttgacaggatcggggagtacctgttccagaaagccgc 590
Query: 737 cagggatatttatagacgacggcatggtttcgtgataatcgctatggaggctatggacca 796
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Sbjct: 591 ccgggatatttatagacgacggcatggtttcgtgataatcgctatggaggctatggacca 650
Query: 797 gttgttgttggcctgtcactcgcagactctcaacctgttcgttgagagtttccttaaaat 856
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Sbjct: 651 gttgttgttggcctgtcactcgcagactctcaacctgttcgtggagagcttccttaaaat 710
Query: 857 ggtgcagaagttattggagtccaccgaccctcagctgcagatcctggccacacagagttt 916
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Sbjct: 711 ggtgcagaagctattggagtccaccgaccctcagctgcagatcctggccacacagngttt 770
Query: 917 cgtcagattcgcgaacatag 936
||||||||||||||||||||
Sbjct: 771 cgtcagattcgcgaacatag 790
>BF01014B2D12
Length = 734
Score = 335 bits (169), Expect = 2e-91
Identities = 224/241 (92%), Gaps = 1/241 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1573 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacac 1632
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Query: 1633 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacac 1692
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Sbjct: 102 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacactcac 161
Query: 1693 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacac 1752
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Sbjct: 162 aaacacagacacacacacaaacacacacacacacacacacacactcacaaacacagacac 221
Query: 1753 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacac 1812
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Sbjct: 222 acacacaaacacacaaacacagacacaaacacaca-acatactcacacacaaacacacac 280
Query: 1813 a 1813
|
Sbjct: 281 a 281
Score = 335 bits (169), Expect = 2e-91
Identities = 224/241 (92%), Gaps = 1/241 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1601 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacac 1660
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Query: 1661 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacac 1720
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Query: 1721 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacac 1780
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Query: 1781 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacac 1840
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Sbjct: 222 acacacaaacacacaaacacagacacaaacacaca-acatactcacacacaaacacacac 280
Query: 1841 a 1841
|
Sbjct: 281 a 281
Score = 335 bits (169), Expect = 2e-91
Identities = 224/241 (92%), Gaps = 1/241 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1629 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacac 1688
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Query: 1689 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacac 1748
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Sbjct: 102 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacactcac 161
Query: 1749 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacac 1808
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Sbjct: 162 aaacacagacacacacacaaacacacacacacacacacacacactcacaaacacagacac 221
Query: 1809 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacac 1868
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Sbjct: 222 acacacaaacacacaaacacagacacaaacacaca-acatactcacacacaaacacacac 280
Query: 1869 a 1869
|
Sbjct: 281 a 281
Score = 335 bits (169), Expect = 2e-91
Identities = 224/241 (92%), Gaps = 1/241 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1657 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacac 1716
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Query: 1717 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacac 1776
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Query: 1777 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacac 1836
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Sbjct: 162 aaacacagacacacacacaaacacacacacacacacacacacactcacaaacacagacac 221
Query: 1837 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacac 1896
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Sbjct: 222 acacacaaacacacaaacacagacacaaacacaca-acatactcacacacaaacacacac 280
Query: 1897 a 1897
|
Sbjct: 281 a 281
Score = 335 bits (169), Expect = 2e-91
Identities = 224/241 (92%), Gaps = 1/241 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1685 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacac 1744
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Query: 1745 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacac 1804
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Sbjct: 102 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacactcac 161
Query: 1805 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacac 1864
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Sbjct: 162 aaacacagacacacacacaaacacacacacacacacacacacactcacaaacacagacac 221
Query: 1865 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacac 1924
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Sbjct: 222 acacacaaacacacaaacacagacacaaacacaca-acatactcacacacaaacacacac 280
Query: 1925 a 1925
|
Sbjct: 281 a 281
Score = 335 bits (169), Expect = 2e-91
Identities = 224/241 (92%), Gaps = 1/241 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1713 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacac 1772
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Query: 1773 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacac 1832
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Query: 1833 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacac 1892
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Sbjct: 162 aaacacagacacacacacaaacacacacacacacacacacacactcacaaacacagacac 221
Query: 1893 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacac 1952
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Sbjct: 222 acacacaaacacacaaacacagacacaaacacaca-acatactcacacacaaacacacac 280
Query: 1953 a 1953
|
Sbjct: 281 a 281
Score = 335 bits (169), Expect = 2e-91
Identities = 224/241 (92%), Gaps = 1/241 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1741 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacac 1800
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Query: 1801 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacac 1860
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Query: 1861 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacac 1920
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Query: 1921 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacac 1980
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Sbjct: 222 acacacaaacacacaaacacagacacaaacacaca-acatactcacacacaaacacacac 280
Query: 1981 a 1981
|
Sbjct: 281 a 281
Score = 323 bits (163), Expect = 6e-88
Identities = 202/215 (93%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1769 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacac 1828
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 42 acacacacacacacacacacacacaaacacacacacacacacacaaacacacacacacac 101
Query: 1829 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacac 1888
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Sbjct: 102 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacactcac 161
Query: 1889 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacac 1948
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Sbjct: 162 aaacacagacacacacacaaacacacacacacacacacacacactcacaaacacagacac 221
Query: 1949 acacacacacacacacacacacacacacacacaca 1983
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Sbjct: 222 acacacaaacacacaaacacagacacaaacacaca 256
Score = 323 bits (163), Expect = 6e-88
Identities = 202/215 (93%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1771 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacac 1830
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Sbjct: 42 acacacacacacacacacacacacaaacacacacacacacacacaaacacacacacacac 101
Query: 1831 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacac 1890
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Sbjct: 102 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacactcac 161
Query: 1891 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacac 1950
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Sbjct: 162 aaacacagacacacacacaaacacacacacacacacacacacactcacaaacacagacac 221
Query: 1951 acacacacacacacacacacacacacacacacaca 1985
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Score = 323 bits (163), Expect = 6e-88
Identities = 202/215 (93%)
Strand = Plus / Plus
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Sbjct: 42 acacacacacacacacacacacacaaacacacacacacacacacaaacacacacacacac 101
Query: 1833 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacac 1892
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Sbjct: 102 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacactcac 161
Query: 1893 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacac 1952
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Sbjct: 162 aaacacagacacacacacaaacacacacacacacacacacacactcacaaacacagacac 221
Query: 1953 acacacacacacacacacacacacacacacacaca 1987
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Sbjct: 222 acacacaaacacacaaacacagacacaaacacaca 256
Score = 323 bits (163), Expect = 6e-88
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Strand = Plus / Plus
Query: 1775 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacac 1834
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Sbjct: 42 acacacacacacacacacacacacaaacacacacacacacacacaaacacacacacacac 101
Query: 1835 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacac 1894
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Sbjct: 102 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacactcac 161
Query: 1895 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacac 1954
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Sbjct: 162 aaacacagacacacacacaaacacacacacacacacacacacactcacaaacacagacac 221
Query: 1955 acacacacacacacacacacacacacacacacaca 1989
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Sbjct: 222 acacacaaacacacaaacacagacacaaacacaca 256
Score = 323 bits (163), Expect = 6e-88
Identities = 202/215 (93%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1777 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacac 1836
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Sbjct: 42 acacacacacacacacacacacacaaacacacacacacacacacaaacacacacacacac 101
Query: 1837 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacac 1896
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Sbjct: 102 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacactcac 161
Query: 1897 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacac 1956
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Sbjct: 162 aaacacagacacacacacaaacacacacacacacacacacacactcacaaacacagacac 221
Query: 1957 acacacacacacacacacacacacacacacacaca 1991
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Sbjct: 222 acacacaaacacacaaacacagacacaaacacaca 256
Score = 323 bits (163), Expect = 6e-88
Identities = 202/215 (93%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1779 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacac 1838
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Sbjct: 42 acacacacacacacacacacacacaaacacacacacacacacacaaacacacacacacac 101
Query: 1839 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacac 1898
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 102 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacactcac 161
Query: 1899 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacac 1958
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Query: 1573 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca 1627
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Score = 83.8 bits (42), Expect = 1e-15
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Query: 1949 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacac 2002
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>BF14_335_C4
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Query: 1129 gacttgcgacccagg 1143
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Length = 840
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Sbjct: 587 cgttgcagggagaggagcttcaacagtgcctgggacttgcgacccagg 634
Database: est
Posted date: Jul 14, 2011 2:25 PM
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Lambda K H
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Gapped
Lambda K H
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Matrix: blastn matrix:1 -3
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