BLASTN 2.2.24 [Aug-08-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= DPGLEAN01136 (UTR included)
(2232 letters)
Database: est
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Score = 67.9 bits (34), Expect = 7e-11
Identities = 40/42 (95%)
Strand = Plus / Plus
Query: 2191 atatacatatatatatatatatatatatatatatatatatat 2232
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Sbjct: 51 atatacatatatacatatatatatctatatatatatatatat 92
Score = 67.9 bits (34), Expect = 7e-11
Identities = 37/38 (97%)
Strand = Plus / Plus
Query: 2191 atatacatatatatatatatatatatatatatatatat 2228
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Sbjct: 59 atatacatatatatatctatatatatatatatatatat 96
Database: est
Posted date: Jul 14, 2011 2:25 PM
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Number of sequences in database: 9484
Lambda K H
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Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Sequences: 9484
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Length adjustment: 17
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Effective search space used: 17984092235
X1: 11 (21.8 bits)
X2: 15 (29.7 bits)
X3: 50 (99.1 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 34 (67.9 bits)