BLASTN 2.2.24 [Aug-08-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= DPGLEAN01853 (UTR included)
(3289 letters)
Database: est
9484 sequences; 8,280,457 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
BF14_2303_C1 1398 0.0
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BF01009B2D05 68 1e-10
BF01025B2E05 68 1e-10
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>BF14_2303_C1
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Query: 2350 atggcagtctagcgggcgcgggggcggaggacggggggtcattgaccgcagggggaaagg 2409
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Sbjct: 122 atggcagtctagcgggcgcgggggccgaggacgggggttcattgaccgcagggggaaagg 181
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Sbjct: 182 ttcgatcaaggagtctcgaaccactcacaggactagcgatgtgggcgtccgagccacaga 241
Query: 2470 ttattgagctggtgaagggcgaacgaggtttgggcttctccatccttgactaccaggatc 2529
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Sbjct: 799 ataaatatatatatatatatatatatatatatatat 834
>BF01044A1D01
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Sbjct: 64 ataaatatatatatatatatatatatatatatatat 29
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Sbjct: 12 tacatatatatatatatatatatatatatatatatatat 50
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Query: 3048 atttacataaatatatatatatatatatatatatatatatat 3089
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Sbjct: 1135 atttatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 1176
>BF14_2930_C1
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Query: 3048 atttacataaatatatatatatatatatatatatatatatat 3089
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Sbjct: 727 atttaaatatatatatatatatatatatatatatatatatat 768
>BF14_1547_C2
Length = 723
Score = 67.9 bits (34), Expect = 1e-10
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Strand = Plus / Plus
Query: 3052 acataaatatatatatatatatatatatatatatatat 3089
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Sbjct: 650 acatatatatatatatatatatatatatatatatatat 687
Database: est
Posted date: Jul 14, 2011 2:25 PM
Number of letters in database: 8,280,457
Number of sequences in database: 9484
Lambda K H
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Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Sequences: 9484
Number of Hits to DB: 447,186
Number of extensions: 21262
Number of successful extensions: 21262
Number of sequences better than 1.0e-10: 17
Number of HSP's gapped: 21093
Number of HSP's successfully gapped: 21
Length of query: 3289
Length of database: 8,280,457
Length adjustment: 18
Effective length of query: 3271
Effective length of database: 8,109,745
Effective search space: 26526975895
Effective search space used: 26526975895
X1: 11 (21.8 bits)
X2: 15 (29.7 bits)
X3: 50 (99.1 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 34 (67.9 bits)