BLASTN 2.2.24 [Aug-08-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= DPGLEAN02663 (UTR included)
(2035 letters)
Database: est
9484 sequences; 8,280,457 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
BF14_1562_C1 1677 0.0
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BF14_2303_C1 76 2e-13
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BF01012B1C01 72 4e-12
BF01010A2B06 72 4e-12
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BF01046A2B12 70 2e-11
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BF14_3403_C1 68 6e-11
>BF14_1562_C1
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Query: 1327 aagcggcggaggcgtgggtgaggggggcgcacgcggcg 1364
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>BF01031A2G09
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Strand = Plus / Plus
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>BF01033A1F05
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Sbjct: 1618 aatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 1663
Score = 67.9 bits (34), Expect = 6e-11
Identities = 40/42 (95%)
Strand = Plus / Plus
Query: 199 atatataaatatatatatatatatatatatatgtatatatat 240
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Sbjct: 1619 atatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 1660
Score = 67.9 bits (34), Expect = 6e-11
Identities = 40/42 (95%)
Strand = Plus / Plus
Query: 198 tatatataaatatatatatatatatatatatatgtatatata 239
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Sbjct: 1622 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 1663
>BF01047A1H12
Length = 723
Score = 67.9 bits (34), Expect = 6e-11
Identities = 52/58 (89%)
Strand = Plus / Minus
Query: 183 atatatataaatatgtatatataaatatatatatatatatatatatatgtatatatat 240
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Sbjct: 96 atatatatatatatatatatagatatatatatgtatatatgtatatatgtatatatat 39
>BF14_3403_C1
Length = 1210
Score = 67.9 bits (34), Expect = 6e-11
Identities = 40/42 (95%)
Strand = Plus / Plus
Query: 198 tatatataaatatatatatatatatatatatatgtatatata 239
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Sbjct: 1138 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 1179
Score = 67.9 bits (34), Expect = 6e-11
Identities = 40/42 (95%)
Strand = Plus / Minus
Query: 198 tatatataaatatatatatatatatatatatatgtatatata 239
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Sbjct: 1179 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 1138
Database: est
Posted date: Jul 14, 2011 2:25 PM
Number of letters in database: 8,280,457
Number of sequences in database: 9484
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Sequences: 9484
Number of Hits to DB: 373,286
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Number of successful extensions: 23163
Number of sequences better than 1.0e-10: 25
Number of HSP's gapped: 21764
Number of HSP's successfully gapped: 1284
Length of query: 2035
Length of database: 8,280,457
Length adjustment: 17
Effective length of query: 2018
Effective length of database: 8,119,229
Effective search space: 16384604122
Effective search space used: 16384604122
X1: 11 (21.8 bits)
X2: 15 (29.7 bits)
X3: 50 (99.1 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 34 (67.9 bits)