BLASTN 2.2.24 [Aug-08-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= DPGLEAN03021 (UTR included)
(6739 letters)
Database: est
9484 sequences; 8,280,457 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
BF14_948_C1 4026 0.0
>BF14_948_C1
Length = 2063
Score = 4026 bits (2031), Expect = 0.0
Identities = 2053/2059 (99%), Gaps = 1/2059 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 4652 agatggcttccaaggtctacaaggggaaaagggtgatcaaggattcactggacaaaaggg 4711
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5 agatggcttccaaggtctacaaggggaaaagggtgatcaaggattcactggacaaaaggg 64
Query: 4712 tgaaatgggtagaatgggcgccatgggtgaaagaggtgaaagaggtccaattggaccgac 4771
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 65 tgaaatgggtagaatgggcgccatgggtgaaagaggtgaaagaggtccaattggaccgac 124
Query: 4772 tggtattcctggactcacagtaaaaggtgaaaaaggtttacctggaaataacggaaaaca 4831
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 125 tggtattcctggactcacagtaaaaggtgaaaaaggtttacctggaaataacggaaaaca 184
Query: 4832 cggcagacctggcatgcgcggtgctactggagaaaaaggagaacaaggattacctggact 4891
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 185 cggtagacctggcatgcgcggtgctactggagaaaaaggagaacaaggattacctggact 244
Query: 4892 tccaggtccaattgggcgctctggcatgccaggaacaccgggacctagaggtgaacccgg 4951
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 245 tccaggtccaattgggcgctctggcatgccaggaacaccgggacctagaggtgaacccgg 304
Query: 4952 tgaaccaggaagtgaaggagtcgcaggaccccctgggtttgacggtcctccggggctaca 5011
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 305 tgaaccaggaagtgaaggagtcgcaggaccccctgggtttgacggtcctccggggctaca 364
Query: 5012 aggtcgtcctggcgaatatggtgaaaaaggtaacaagggtgataagggtgctgttggttt 5071
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 365 aggtcgtcctggcgaatatggtgaaaaaggtaacaagggtgataagggtgctgttggttt 424
Query: 5072 tggtttacctggcccgaaaggagacactggcttgccaggattaccgggtttaaatggtga 5131
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 425 tggtttacctggcccgaaaggagacactggcttgccaggattaccgggtttaaatggtga 484
Query: 5132 aaaaggtgataaaggagatcagggtttcgatggattagttggagagatgggtgagaaagg 5191
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 485 aaaaggtgataaaggagatcagggtttcgatggattagttggagagatgggtgagaaagg 544
Query: 5192 taaccaaggagaaaaaggtgacagaggctatcctggtcggcctggaattcctggccttga 5251
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 545 taaccaaggagaaaaaggtgacagaggctatcctggtcggcctggaattcctggccttga 604
Query: 5252 tggtgtaaaaggagataagggagaagcggctgctatagtttatggaagtaagggagaacc 5311
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 605 tggtgtaaaaggagataagggagaagcggctgctatagtttatggaagtaagggagaacc 664
Query: 5312 aggaccaagaggtcctcctggattgaatggtccacctggacttgacggattacctggtcc 5371
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 665 aggaccaagaggtcctcctggattgaatggtccacctggacttgacggattacctggtcc 724
Query: 5372 taaaggctgggatggtgctccaggcatgaaaggagataaaggtttccaaggacctatggg 5431
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 725 taaaggctgggatggtgctccaggcatgaaaggagataaaggtttccaaggacctatggg 784
Query: 5432 cccaccaggcttaccaggacctcaaggaataatgggtattcaaggtgaacgtggtgaaac 5491
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 785 cccaccaggcttaccaggacctcaaggaataatgggtattcaaggtgaacgtggtgaaac 844
Query: 5492 aggtcgtatgggattacaaggtgtacctggaatacctggtgctccttgtgctactacaga 5551
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 845 aggtcgtatgggattacaaggtgtacctggaatacctggtgctccttgtgctactacaga 904
Query: 5552 ctatcttactggcatccttttagtgcgtcatagtcaaacaaacatagtaccccaatgtga 5611
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 905 ctatcttactggcatccttttagtgcgtcatagtcaaacaaacatagtaccccaatgtga 964
Query: 5612 acccggacatattaaattgtgggatggctattccttactttacattgatggaaatgaaaa 5671
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 965 acccggacatattaaattgtgggatggctattccttactttacattgatggaaatgaaaa 1024
Query: 5672 ggctcataatcaagatctgggatatgctggatcttgtgtaagaaagttcagtaccatgcc 5731
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1025 ggctcataatcaagatctgggatatgctggatcttgtgtaagaaagttcagtaccatgcc 1084
Query: 5732 attccttttctgtgatcttaatgatgtatgcaattacgcaagtcgaaatgatcgcagtta 5791
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1085 attccttttctgtgatcttaatgatgtatgcaattacgcaagtcgaaatgatcgcagtta 1144
Query: 5792 ttggctttctacaaatttgccgatacccatgatgccagtaaacaacaatgaaatttcacg 5851
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 1145 ttggctttctacaaatttgccgatacccatgatgccagtaaacaataatgaaatttcacg 1204
Query: 5852 atatatttcaagatgtgttgtttgtgaggttccagccaatgtcatagctgttcacagtca 5911
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1205 atatatttcaagatgtgttgtttgtgaggttccagccaatgtcatagctgttcacagtca 1264
Query: 5912 aactcttgatatacctagttgtccagtgggttggaactcattatggattggatacagttt 5971
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1265 aactcttgatatacctagttgtccagtgggttggaactcattatggattggatacagttt 1324
Query: 5972 tgttatgcacactggagctggtggacaaggcggtggtcaagcccttgctagtccgggatc 6031
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1325 tgttatgcacactggagctggtggacaaggcggtggtcaagcccttgctagtccgggatc 1384
Query: 6032 ttgtcttgaagacttccgagcgacaccatttattgaatgtaacggtgaaggtggtacttg 6091
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1385 ttgtcttgaagacttccgagcgacaccatttattgaatgtaacggtgaaggtggtacttg 1444
Query: 6092 ccatcatttcgccaataaacttagtttttggctaacaactatagatgataagaagcaatt 6151
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1445 ccatcatttcgccaataaacttagtttttggctaacaactatagatgataagaagcaatt 1504
Query: 6152 cgcaaaaccagagcgtgaaactcttaaatctggacgactattgcagcgagtgtctagatg 6211
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 1505 cgcaaaaccagagcgtgaaactcttaaatctggacgacttttgcagcgagtgtctagatg 1564
Query: 6212 cgctgtttgcattaagaataccacatagtctatagaaaatattatagtatctaagtaact 6271
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1565 cgctgtttgcattaagaataccacatagtctatagaaaatattatagtatctaagtaact 1624
Query: 6272 taataatgtgcgctgtaaccttccgtaggatctattttttcagtaacacttagtttttgt 6331
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1625 taataatgtgcgctgtaaccttccgtaggatctattttttcagtaacacttagtttttgt 1684
Query: 6332 tgacaattttccaaattaaaattcggtactacattataaacacaatttggtgataaataa 6391
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1685 tgacaattttccaaattaaaattcggtactacattataaacacaatttggtgataaataa 1744
Query: 6392 ttgagatgcataattgttaaataagtctttaaatagatataacgtacattataataataa 6451
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1745 ttgcgatgcataattgttaaataagtctttaaatagatataacgtacattataataataa 1804
Query: 6452 aagcacaccaaagcaatatacctataatttaggttaatattttttataagtatattttat 6511
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1805 aagcacaccaaagcaatatacctataatttaggttaatattttttataagtatattttat 1864
Query: 6512 ttaaatattcttttacatttcaatatattataaaatttatatatattaatgtactccgta 6571
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1865 ttaaatattcttttacatttcaatatattataaaatttatatatattaatgtactccgta 1924
Query: 6572 tagtgattacttgacatcgtatgttcgaagaaagttgtatattgtcactagtcacgtcga 6631
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1925 tagtgattacttgacatcgtatgttcgaagaaagttgtatattgtcactagtcacgtcga 1984
Query: 6632 atattgtacctacactgaacgataaatatcaaaattac-aaattaaaaaaaaattaaata 6690
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 1985 atattgtacctacagtgaacgataaatatcaaaattacgaaattaaaaaaaaattaaata 2044
Query: 6691 ctaacatacaataagagta 6709
|||||||||||||||||||
Sbjct: 2045 ctaacatacaataagagta 2063
Database: est
Posted date: Jul 14, 2011 2:25 PM
Number of letters in database: 8,280,457
Number of sequences in database: 9484
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Sequences: 9484
Number of Hits to DB: 92,310
Number of extensions: 11859
Number of successful extensions: 11859
Number of sequences better than 1.0e-10: 1
Number of HSP's gapped: 11846
Number of HSP's successfully gapped: 1
Length of query: 6739
Length of database: 8,280,457
Length adjustment: 18
Effective length of query: 6721
Effective length of database: 8,109,745
Effective search space: 54505596145
Effective search space used: 54505596145
X1: 11 (21.8 bits)
X2: 15 (29.7 bits)
X3: 50 (99.1 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 35 (69.9 bits)