BLASTN 2.2.24 [Aug-08-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= DPGLEAN03388 (UTR included)
(7216 letters)
Database: est
9484 sequences; 8,280,457 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
BF14_1892_C2 2405 0.0
BF14_1892_C1 2200 0.0
BF01051A2H03 1176 0.0
>BF14_1892_C2
Length = 1537
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Identities = 1216/1217 (99%)
Strand = Plus / Plus
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Sbjct: 624 cacgcgcccgcgccgcccatgtaccgcgcgccgccctcgcagccgccgcgaccacaccac 683
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Query: 6900 gagccaccgccgcctcgagcggactcgagtccggtctcggtgactggacccggcccggcc 6959
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Query: 7020 ttttgtatgtaaataaatttatcggactgatatccggctgtctaattgactgttatattt 7079
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Sbjct: 1164 ttttgtatgtaaataaatttatcggactgatatccggctgtctaattgactgttatattt 1223
Query: 7080 taagtatatatgtaaaaagcgattagtcgtcggcctcgctgcgtgagatgcacagcgcgg 7139
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Query: 7140 ggactgtgcgatgtgcgtccatctgtaacgctgcctcgagacctctcactagtgaatatg 7199
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Sbjct: 1284 ggactgtgcgatgtgcgtccatctgtaacgctgcctcgagacctctcactagtgaatatg 1343
Query: 7200 tagccacggtttttgca 7216
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Sbjct: 1344 tagccacggtttttgca 1360
Score = 270 bits (136), Expect = 3e-71
Identities = 145/149 (97%)
Strand = Plus / Plus
Query: 5690 cactgtacttatttcaagtacgtcaaactcgctcatgtcggctacagtaaagccatcgac 5749
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Sbjct: 1 cactgtacttatttcaagtacgtcaaactcnnncatgtcggctacagtaaagccttcgac 60
Query: 5750 tcaacagatcggagctattggtagtaaaggtggaggcgtgggcggagtcggtggggtcgg 5809
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Sbjct: 61 tcaacagatcggagctattggtagtaaaggtggaggcgtgggcggagtcggtggggtcgg 120
Query: 5810 ggctgttggtggtgtgaatacgttccagc 5838
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Sbjct: 121 ggctgttggtggtgtgaatacgttccagc 149
>BF14_1892_C1
Length = 1635
Score = 2200 bits (1110), Expect = 0.0
Identities = 1116/1118 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 5477 acaaggtggattatacggagcctttttagatcaaacacggggacaatttggaggcttccc 5536
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Sbjct: 1 acaaggtggattatacggagcctttttagatcaaacacggggacaatttggaggcttccc 60
Query: 5537 tggaactccttatggcgcgggttctgctactccatataattaccaaccaccaccggatat 5596
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Sbjct: 61 tggaactccttatggcgcgggttctgctactccatataattaccaaccaccaccggatat 120
Query: 5597 gttccagagcctgccaagtcaataccgaatggccgctgcggcaggaggtggcgctgcctt 5656
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Sbjct: 121 gttccagagcctgccaagtcaataccgaatggccgctgcggcaggaggtggcgctgcctt 180
Query: 5657 cggccagtctggtcaattaggaaacagtccaagcactgtacttatttcaagtacgtcaaa 5716
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Query: 5717 ctcgctcatgtcggctacagtaaagccatcgactcaacagatcggagctattggtagtaa 5776
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Query: 5777 aggtggaggcgtgggcggagtcggtggggtcggggctgttggtggtgtgaatacgttcca 5836
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Query: 5897 gctgcctcggcctgcccctccttccacttcatactactccccctaccagccgcccgccgc 5956
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Sbjct: 421 gctgcctcggcctgcccctccttccacttcatactactccccgtaccagccgcccgccgc 480
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Query: 6077 acaatatcgggcacctctacaacaacagtatgctccgcctcagccccgacctccgcctca 6136
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Query: 6137 gcaacaactcaagagtccactgcacgaacatcctaacggattcgcccctttgtgtgactc 6196
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Score = 644 bits (325), Expect = 0.0
Identities = 325/325 (100%)
Strand = Plus / Plus
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Query: 6715 gaggcggcgccccacggccaccgcccctcggccctcgcccctcgccaacgcgctcccggc 6774
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Query: 6775 agcccgagcgatcgccgctcgacagacgtccgcctctccactgacgtcgacagatttagg 6834
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Sbjct: 1491 agcccgagcgatcgccgctcgacagacgtccgcctctccactgacgtcgacagatttagg 1550
Query: 6835 ttttcggtatttttaagtaataaattatggaagtgatttaatgttatttaagattcatac 6894
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Sbjct: 1551 ttttcggtatttttaagtaataaattatggaagtgatttaatgttatttaagattcatac 1610
Query: 6895 gaatcgagccaccgccgcctcgagc 6919
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Sbjct: 1611 gaatcgagccaccgccgcctcgagc 1635
>BF01051A2H03
Length = 790
Score = 1176 bits (593), Expect = 0.0
Identities = 599/601 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 6394 gcgggaacggcggcaacggaaacggcaacgccatgaaccgcggcggcatggtgacgtcac 6453
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Query: 6454 gctacccagcacccatacagaggccgcacgcgcccgcgcctcccatgtaccgcgcgccgc 6513
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Sbjct: 250 gctacccagcacccatacagaggccgcacgcgcccgcgccgcccatgtaccgcgcgccgc 309
Query: 6514 cctcgcagccgccgcgaccacaccacgcgcaacacgtacaacatatgagacccaacctct 6573
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Sbjct: 310 cctcgcagccgccgcgaccacaccacgcgcaacacgtacaacatatgagacccaacctct 369
Query: 6574 actaccatcaccaccaacgcaacggcgggggaggttcggagcgtgtgaccgagggtgggg 6633
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Query: 6634 aagtatcagctaccatggaggaggtcggggagacggtgaccgcaggcgagacgccttccc 6693
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Sbjct: 430 aagtatcagctaccatggaggaggtcggggagacggtgaccgcaggcgagacgccttccc 489
Query: 6694 ccgctgaggtgaaggccgagtgaggcggcgccccacggccaccgcccctcggccctcgcc 6753
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Sbjct: 490 ccgctgaggtgaaggccgagtgaggcggcgccccacggccaccgcccctcggccctcgcc 549
Query: 6754 cctcgccaacgcgctcccggcagcccgagcgatcgccgctcgacagacgtccgcctctcc 6813
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Sbjct: 550 cctcgccaatgcgctcccggcagcccgagcgatcgccgctcgacagacgtccgcctctcc 609
Query: 6814 actgacgtcgacagatttaggttttcggtatttttaagtaataaattatggaagtgattt 6873
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Sbjct: 610 actgacgtcgacagatttaggttttcggtatttttaagtaataaattatggaagtgattt 669
Query: 6874 aatgttatttaagattcatacgaatcgagccaccgccgcctcgagcggactcgagtccgg 6933
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Sbjct: 670 aatgttatttaagattcatacgaatcgagccaccgccgcctcgagcggactcgagtccgg 729
Query: 6934 tctcggtgactggacccggcccggcccggcccggccccggccccggccacggccacgtgt 6993
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Query: 6994 c 6994
|
Sbjct: 790 c 790
Score = 377 bits (190), Expect = e-103
Identities = 190/190 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 6074 gcaacaatatcgggcacctctacaacaacagtatgctccgcctcagccccgacctccgcc 6133
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Sbjct: 1 gcaacaatatcgggcacctctacaacaacagtatgctccgcctcagccccgacctccgcc 60
Query: 6134 tcagcaacaactcaagagtccactgcacgaacatcctaacggattcgcccctttgtgtga 6193
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Sbjct: 61 tcagcaacaactcaagagtccactgcacgaacatcctaacggattcgcccctttgtgtga 120
Query: 6194 ctcggcctcaccgacgcccaaaggagcaacaaaacagcagaaaccgcctcattcgccgcc 6253
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Sbjct: 121 ctcggcctcaccgacgcccaaaggagcaacaaaacagcagaaaccgcctcattcgccgcc 180
Query: 6254 tcaacacaag 6263
||||||||||
Sbjct: 181 tcaacacaag 190
Database: est
Posted date: Jul 14, 2011 2:25 PM
Number of letters in database: 8,280,457
Number of sequences in database: 9484
Lambda K H
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Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Sequences: 9484
Number of Hits to DB: 91,073
Number of extensions: 10159
Number of successful extensions: 10159
Number of sequences better than 1.0e-10: 3
Number of HSP's gapped: 10141
Number of HSP's successfully gapped: 6
Length of query: 7216
Length of database: 8,280,457
Length adjustment: 18
Effective length of query: 7198
Effective length of database: 8,109,745
Effective search space: 58373944510
Effective search space used: 58373944510
X1: 11 (21.8 bits)
X2: 15 (29.7 bits)
X3: 50 (99.1 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 35 (69.9 bits)