BLASTN 2.2.24 [Aug-08-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= DPGLEAN04223 (UTR included)
(5740 letters)
Database: est
9484 sequences; 8,280,457 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
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BF01041A1C01 1570 0.0
BF01040A1C10 1402 0.0
>BF14_1564_C1
Length = 971
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Identities = 899/900 (99%)
Strand = Plus / Plus
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Query: 5576 tagattgtaaaaactcaatcgcccttgaaccttgcagtgcagtgccgtacaatgcttgta 5635
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Query: 5636 caatggcgattttataagtattttgtaacagtttatccagaaatacactcgatataagta 5695
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Sbjct: 885 caatggcgattttataagtattttgtaacagtttatccagaaatacactcgatataagta 944
>BF01041A1C01
Length = 837
Score = 1570 bits (792), Expect = 0.0
Identities = 825/837 (98%)
Strand = Plus / Plus
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Query: 565 gattgaaattggcaagaaatgttgtacaaacccagtattttccaacagctccaaaagaaa 624
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Query: 685 tatgtgaagttttaaactggctgaataatgtggatgatttcacaagtgaatttaaaagta 744
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Query: 745 aacttataaaggtggtgtcacaatacctccacaggaacgtattagaaaataatgacatag 804
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Query: 805 aaaatatcatagcgttcatggataacagcaaaatgtcaccgcaactaattctacagattg 864
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Sbjct: 301 aaaatataatagcgttcatggataacagcaaaatgtcaccgcaactgattctacagattg 360
Query: 865 aagatttcctgttcattgttacaactttactacaaaacctacataacgaagaaaattata 924
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Sbjct: 361 aagatttcctgttcattgttacaactttactacaaaacctacataacgaagaaaattata 420
Query: 925 ctctcgttgataaaatactaaataatattgtgagatattataaggattccaaaaagaagt 984
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Query: 985 tgcaattcatcatcggattcctggaaggtgaacatttagagaccattttttgtttccttc 1044
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Sbjct: 481 tgcaattcatcatcagattcctggaaggtgaacatttagagaccattttttgtttccttc 540
Query: 1045 acaccaaatctcactctgccgcaataagtttatgccagaatgtattgtttccattgagta 1104
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Query: 1105 aaaagcagattttctcaagtttcctaacaaatttgatcagaaaggagaccattgacgact 1164
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Sbjct: 601 aaaagcagattttctcaagtttcctaacaaatttgatcagaaaggagactattgacgact 660
Query: 1165 taatagccgaaaaaggtgataatatacagattgtattgaaaattatgagttcatttttca 1224
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Query: 1285 ttacaagttgctttagaagcgagagtcaattatgcttcacattctacatcatggcta 1341
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Sbjct: 781 ttacaagttgctttagaagcgagagtcaattatgcttcacattctacatcatggcta 837
>BF01040A1C10
Length = 750
Score = 1402 bits (707), Expect = 0.0
Identities = 728/735 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3615 cacattgagacatcgatcaaccttataaacattactctgagatatctcaagagactgaca 3674
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Query: 3735 agactatgggttgcgataacatgtagattgtctatggtttttgacaagcggcaaaagaga 3794
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Sbjct: 132 agactatgggttgcgataacatgtagattgtctatggtttttgacaagcggcaaaagaga 191
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Sbjct: 192 agaataagtaataactgtatcgacgaaatagctgtcatgttaaaatttctagctgaattg 251
Query: 3855 tcatcggttgaatgcttttgcaaccattttgttggagatttatctaagttagcattactt 3914
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Query: 3915 aagaatccatcatttatactaaagaatgacgagatcacgaacagtcagatcacagccagg 3974
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Sbjct: 312 aagaatccatcatttatactaaagaatgacgagatcacgaacagtcagatcacagccagg 371
Query: 3975 agagtatacaaatatctgtggcagaactgtctcaaagcaaacatcatagaggctaaatgt 4034
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Query: 4035 gttgcaatgacaaaaattatatttagatcgacaaaaaatataaaacattggatatggcaa 4094
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Query: 4095 cactatgataatattgtacaaaatggtccacatgaagttgtagtcgatgatagcatatgt 4154
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Sbjct: 492 cactatgataatattgtacagaatggtccacatgaagttgtagtcgatgatagcatatgt 551
Query: 4155 gaattgttgaggaatgatcttgatacactctgtgatgttattatggctgccaaaaagata 4214
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Query: 4215 aacctcgactacaaattcctggattccatatttgagttagcgcatctctaccaatacctg 4274
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Sbjct: 612 aacctcgactacaaattcctggattccatatttgagttagcgcatctctaccaatacctg 671
Query: 4275 ctgggatcgaacaccatcaacaccaagtgtgtgatatcatggaattcatttatcacactg 4334
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Sbjct: 672 ctgggatcaaacaccatcaacaccaagtgtgtgatatcatggaattcatttatcacactg 731
Query: 4335 tttgagggatgcacc 4349
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Sbjct: 732 tttgagggatgcacc 746
Database: est
Posted date: Jul 14, 2011 2:25 PM
Number of letters in database: 8,280,457
Number of sequences in database: 9484
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Sequences: 9484
Number of Hits to DB: 707,365
Number of extensions: 15098
Number of successful extensions: 15098
Number of sequences better than 1.0e-10: 3
Number of HSP's gapped: 15096
Number of HSP's successfully gapped: 3
Length of query: 5740
Length of database: 8,280,457
Length adjustment: 18
Effective length of query: 5722
Effective length of database: 8,109,745
Effective search space: 46403960890
Effective search space used: 46403960890
X1: 11 (21.8 bits)
X2: 15 (29.7 bits)
X3: 50 (99.1 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 35 (69.9 bits)