BLASTN 2.2.24 [Aug-08-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= DPGLEAN04346 (UTR included)
(2002 letters)
Database: est
9484 sequences; 8,280,457 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
BF14_479_C1 2379 0.0
BF01017B1E01 910 0.0
>BF14_479_C1
Length = 1865
Score = 2379 bits (1200), Expect = 0.0
Identities = 1218/1224 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 aaaaatttgacgattaaacattccggtagtaaaagtgaacaaaccttttttaaatcaata 60
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Sbjct: 151 aaaaatttgacgattaaacattccggtagtaaaagtgaacaaaccttttttaaatcaata 210
Query: 61 gctgcagatatcgatgaagtttcaacagaaatagtttttgctgaatatgctgaaaaaatc 120
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Sbjct: 211 gctgcagatatcgatgaagtttcaacagaaatagtttttgctgaatatgctgaaaaaatc 270
Query: 121 ttgctcattgtatcacaataccaaaaaattgggagtatgttgatgataactagggatcaa 180
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Sbjct: 271 ttgctcattgtatcacaataccaaaaaattgggagtatgttgatgataactagggatcaa 330
Query: 181 gtccacagtcccttaggtacaaataatatttttacaacaaaagttatttttggtgccaca 240
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Sbjct: 331 gtccacagtcccttaggtacaaataatatttttacaacaaaagttatttttggtgccaca 390
Query: 241 ggagaagatcaacaagttgcagcaaggtacctggcggaggctatacaaattactaaaccg 300
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Sbjct: 391 ggagaagatcaacaagttgcagcaaggtacctggcggaggctatacaaattactaaaccg 450
Query: 301 ctatacatattcataaatctcaaatcatatgatattgagactgtaaaagcttgcaaagat 360
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Sbjct: 451 ctatacatattcataaatctcaaatcatatgatattgagactgtaaaagcttgcaaagat 510
Query: 361 attatacttgatttgaaaaaagaggaaagtgaataatgtttgcaacaaaatctttaaata 420
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Sbjct: 511 attatacttgatttgaaaaaagaggaaagtgaataatgtttgcaacaaaatctttaaata 570
Query: 421 cttttaagtctgtaaataaattatatggccaattagtaataggcccaccaggagcaggga 480
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Sbjct: 571 cttttaagtctgtaaataaattatatggccaattagtaataggcccaccaggagcaggga 630
Query: 481 agacaacttactgcagtgaaatgtcaaaattactaagaaaaattgacagaaaagttgtca 540
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Sbjct: 631 agacaacttactgcagtgaaatgtcaaaattactaagaaaaattgacagaaaagttgtca 690
Query: 541 tcgtaaatttagatccagctaatgaatgtatgacatataaagcagatattgatataagag 600
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Sbjct: 691 tcgtaaatttagatccagctaatgaatgtatgacatataaagcagatattgatataagag 750
Query: 601 atcttatcggtcttgaaaatgttatggatgaacatagtctgggacctaatggtgctttgg 660
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Sbjct: 751 atcttatcggacttgaaaatgttatggatgaacatagtctgggacctaatggtgctttgg 810
Query: 661 tttattgtatggaatatttggagaaaaatttagattggttactagaccaaataaaaggcg 720
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Sbjct: 811 tttattgtatggaatatttggaaaaaaatttagattggttactagaccaaataaaaggcg 870
Query: 721 ataatgctacaaattttatatttgacttgccgggtcaagttgagctctacagtcatcatg 780
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Sbjct: 871 ataatgctacaaattttatatttgacttgccgggtcaagttgagctctacagtcatcatg 930
Query: 781 attcccttagtaatatttttagtaaattatccagtgtaaatcatatgcagctctgtgttg 840
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Sbjct: 931 attcccttagtaatattttcagtaaattatccagtgtaaatcatatgcagctctgtgttg 990
Query: 841 tgcacttaatagattcacaccactgttctgatgcaggaaaatttatagcagcactgatgt 900
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Sbjct: 991 tgcacttaatagattcacaccactgctctgatgcaggaaaatttatagcagcactgatgt 1050
Query: 901 tatccctgaatgccatgttgaaaattggattaccgcacattaatttgctcactaaggtag 960
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Sbjct: 1051 tatccctgaatgccatgttgaaaattggattaccacacattaatttgctcactaaggtag 1110
Query: 961 atttgctgaagcaacatgctgataagatccaatttggtatagatttctatacagaagttt 1020
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Sbjct: 1111 atttgctgaagcaacatgctgataagatccaatttggtatagatttctatacagaagttt 1170
Query: 1021 tagatttaaattatcttttggatagtcttgattccgataacttcacaaataaatataaga 1080
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Sbjct: 1171 tagatttaaattatcttttggatagtcttgattccgataacttcacaaataaatataaga 1230
Query: 1081 aattgaacagtgcattggtatctataattgaagactacagcttggtctcattccacctag 1140
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Sbjct: 1231 aattgaacagtgcattggtatctataattgaagactacagcttggtctcattccacctag 1290
Query: 1141 tagatatgttcaaagagcagagtttgattaatgttaaaaaattagtggataaagccaacg 1200
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Sbjct: 1291 tagatatgttcaaagagcagagtttgattaatgttaagaaattagtggataaagccaacg 1350
Query: 1201 gttatgttttcaaatcagatgagg 1224
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Sbjct: 1351 gttatgttttcaaatcagatgagg 1374
>BF01017B1E01
Length = 533
Score = 910 bits (459), Expect = 0.0
Identities = 469/471 (99%), Gaps = 1/471 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1532 ttttatttgaagacaaatacaactctttacaattttatttattaattgtttttttttttg 1591
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Sbjct: 1 ttttatttgaagacaaatacaactctttacaattttatttattaattgtttt-ttttttg 59
Query: 1592 tgtccaagtaactaaaatagtatttgaacattttatatattttcacatacagcagggttt 1651
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Sbjct: 60 ggtccaagtaactaaaatagtatttgaacattttatatattttcacatacagcagggttt 119
Query: 1652 atgtagttaagttataagtgttttcaaaaaagccacagttccatgttgctacttcaatta 1711
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Sbjct: 120 atgtagttaagttataagtgttttcaaaaaagccacagttccatgttgctacttcaatta 179
Query: 1712 cgaaaagtgttatgtattacatgacaaatattttctaatatatttattatacgttgacaa 1771
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Sbjct: 180 cgaaaagtgttatgtattacatgacaaatattttctaatatatttattatacgttgacaa 239
Query: 1772 tatttaaaagagcattgtcagcaaacaagttataaaatggattaaaggttttacactgtt 1831
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Sbjct: 240 tatttaaaagagcattgtcagcaaacaagttataaaatggattaaaggttttacactgtt 299
Query: 1832 gaatattctaaaactatactgaataaacgttttaagagaaaaaataaaaactacatcctt 1891
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Sbjct: 300 gaatattctaaaactatactgaataaacgttttaagagaaaaaataaaaactacatcctt 359
Query: 1892 ctcggattcaccactaacattaactttaaaatatgtgacaaagtatatatattcaagcag 1951
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Sbjct: 360 ctcggattcaccactaacattaactttaaaatatgtgacaaagtatatatattcaagcag 419
Query: 1952 cacaaatacggtacgttaacgtaaaaggcatccgtttatatttaataaata 2002
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Sbjct: 420 cacaaatacggtacgttaacgtaaaaggcatccgtttatatttaataaata 470
Database: est
Posted date: Jul 14, 2011 2:25 PM
Number of letters in database: 8,280,457
Number of sequences in database: 9484
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Sequences: 9484
Number of Hits to DB: 321,819
Number of extensions: 7284
Number of successful extensions: 7284
Number of sequences better than 1.0e-10: 2
Number of HSP's gapped: 7283
Number of HSP's successfully gapped: 2
Length of query: 2002
Length of database: 8,280,457
Length adjustment: 17
Effective length of query: 1985
Effective length of database: 8,119,229
Effective search space: 16116669565
Effective search space used: 16116669565
X1: 11 (21.8 bits)
X2: 15 (29.7 bits)
X3: 50 (99.1 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 34 (67.9 bits)