BLASTN 2.2.24 [Aug-08-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= DPGLEAN05002 (UTR included)
(3901 letters)
Database: est
9484 sequences; 8,280,457 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
BF01045A1E09 1526 0.0
BF01051A1F07 1362 0.0
BF01006X1E08 1350 0.0
>BF01045A1E09
Length = 790
Score = 1526 bits (770), Expect = 0.0
Identities = 785/790 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 427 tcttaaatttagtgttattaattattatacagtatatattgtgaagttatgagtaagaaa 486
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 tcttaaatttagtgttattaattattatacagtatatattgtgaagttatgagtaagaaa 60
Query: 487 cttaaatctccactatggctttaaaaaaagttaagggtaacttcgaaagaatgtttgaca 546
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 cttaaatctccactatggctttaaaaaaagttaagggtaacttcgaaagaatgtttgaca 120
Query: 547 aaaatcttacggatttagttcgtgggataagaaataacaaagataacgaggcaaaatata 606
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 aaaatcttacggatttagttcgtgggataagaaataacaaagataacgaggcaaaatata 180
Query: 607 tagcacaatgtatggaagaaattaaagttgaattgcggcaagataatatcggggtgaaag 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 tagcacaatgtatggaagaaattaaagttgaattgcggcaagataatatcggggtgaaag 240
Query: 667 ctaacgctgtcgccaaactaacatatcttcaaatgttaggatatgacatatcctgggcta 726
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 ctaacgctgtcgccaaactaacatatcttcaaatgttaggatatgacatatcctgggcta 300
Query: 727 tatttaatataattgaagttatgagttcaactaagtttacatataaacgtattggatatt 786
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 tatttaatataattgaagttatgagttcaactaagtttacatataaacgtattggatatt 360
Query: 787 tagctgctagtcagtcattccatgcagactccgagctgcttatgcttaccactaatatga 846
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 tagctgctagtcagtcattccatgcagactccgagctgcttatgcttaccactaatatga 420
Query: 847 taagaaaagatctgaatgctcaaaaccagtacgaagcaggcctggcgcttagtggtctca 906
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 421 taagaaaagatctgaatgctcaaaaccagtatgaagcaggcctggcacttagtggtctca 480
Query: 907 gctgtttcatatctcatgatctggcgagagacttagctaatgatatcatgacattgatga 966
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 gctgtttcatatctcatgacctggcgagagacttagctaatgatatcatgacattgatga 540
Query: 967 gttctacgaaaccctatctcagaatgaaggcggtgttgatgatgtacaaagtattcttaa 1026
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 gttctacgaaaccctatctcagaatgaaggcggtgttgatgatgtacaaagtattcttaa 600
Query: 1027 gatatcccgaagctttgagaccagcttttcctaagttaaaagagaaacttgaagatcccg 1086
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 gatatcccgaagctttgagaccagcttttcctaagttaaaagagaaacttgaagatcccg 660
Query: 1087 atcccggtgtacagtcagctgctgtgaatgttgtgtgtgaattggcccggaagaatccca 1146
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 661 atcccggtgtacagtcagctgctgtgaatgttgtgtgtgaattggctcggaagaatccca 720
Query: 1147 agaattatctgtcactggctcccgtcttctttaagctaatgaccacctccactaacaatt 1206
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 721 agaattatctgtcactggcccccgtcttctttaagctaatgaccacctccactaacaatt 780
Query: 1207 ggatgttgat 1216
||||||||||
Sbjct: 781 ggatgttgat 790
>BF01051A1F07
Length = 703
Score = 1362 bits (687), Expect = 0.0
Identities = 699/703 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 2114 gctcctgttgtatgagaacagaggcgagcgcaccgccgcgctctcggttatccacgagac 2173
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 gctcttgttgtatgagaacagaggcgagcgcaccgccgcgctctcggttatccacgagac 60
Query: 2174 cctggcgggcatgcagcctttactcagcagcgaggatatggaggtacaggagcgagccca 2233
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 cctggcgggcatgcagcctttactcagcagcgaggatatggaggtacaggagcgagccca 120
Query: 2234 caacgctacagcactactgcgtatagtgttgaggaagatcaaccccacggatcccgcgct 2293
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 caacgctacagcactactgcgtatagtgttgaggaagatcaaccccacggatcccgcgct 180
Query: 2294 cggcagtgacgtcatccgcaatgacgtcaccgacaccttggtagaacacgaaccggaaca 2353
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 cggcagtgacgtcatccacaatgacgtcaccgacaccttggtagaacacgaaccggaaca 240
Query: 2354 gagcaacggcgtggacatcattggtgatagtgacatgaatggcggagacgacgaaggttt 2413
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 gagcaacggcgtggacatcattggtgatagtgacatgaatggcggagacgacgaaggttt 300
Query: 2414 cagtggcggcctcatagcagagctggctggtttgttcgagggtgagctcaagcccgtagc 2473
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 cagtggcggcctcatagcagagctggctggtttgttcgagggtgagctcaagcccgtagc 360
Query: 2474 gcccaaggcacagaagaaagtaccgatgccgccggacctggatctcagcgagtggcagtc 2533
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 gcccaaggcacagaagaaagtaccgatgccgccggacctggatctcagcgagtggcagtc 420
Query: 2534 ttcgtcgcggtggtcgtcagacagctcctcctctgaggcggaagaggacgctctgttcgt 2593
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 ttcgtcgcggtggtcgtcagacagttcctcctctgaggcggaagaggacgctctgttcgt 480
Query: 2594 cgcaccgcaaccagaacaaaaacccgcaacacccgtcactacactacagtcgttgcgcga 2653
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 cgcaccgcagccagaacaaaaacccgcaacacccgtcactacactacagtcgttgcgcga 540
Query: 2654 ggctcgtctcctggaacaggccaacaaccctcactacttgaaggacgacggccgctacca 2713
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 ggctcgtctcctggaacaggccaacaaccctcactacttgaaggacgacggccgctacca 600
Query: 2714 gcaggaggacgaggacccgcccgtcgctgagatcgctttagacgtgccgctgcaaataac 2773
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 gcaggaggacgaggacccgcccgtcgctgagatcgctttagacgtgccgctgcaaataac 660
Query: 2774 cgttaagagatctgataagtacttaatgtcgaaagaaaactcg 2816
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661 cgttaagagatctgataagtacttaatgtcgaaagaaaactcg 703
>BF01006X1E08
Length = 705
Score = 1350 bits (681), Expect = 0.0
Identities = 699/705 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1388 ccatgcagcatcagtacagctctgcgtacagaaactacggatacttatagaggacagcga 1447
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 ccatgcagcatcagtacagctctgtgtacagaaactacggatacttatagaggacagcga 60
Query: 1448 tcagaatttgaagtatctgggtctgctggctatgtctcggatactgaagtctcatccgaa 1507
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 tcagaatttgaagtatctgggtctgctggctatgtctcggatactgaagtctcatccgaa 120
Query: 1508 atcagttcaagctcacaaggacctcgtcctggcctgtttggatgataaggacgagtctat 1567
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 atcagttcaagctcacaaggacctcgtcctggcctgtttggatgataaggacgagtctat 180
Query: 1568 aagactaagagctctcggcctgctgtacggaatggtgtcgaagaagaatttgatagagat 1627
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 aagactaagagctctcggcctgctgtatggaatggtgtcgaagaagaatttgatagagat 240
Query: 1628 agtgaagaaactaatggtacacatggaacgagctgagggtacgctgtacagggacgagct 1687
|||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 agtgaagaaactgatggtacatatggaacgagctgagggtacgctgtacagggacgagct 300
Query: 1688 gttgaccaggatgattgagatctgctcccagaacaactaccagcatgtggtgcacttcga 1747
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 gttgaccaggatgattgagatctgctcccagaacaactaccagcatgtggtgcacttcga 360
Query: 1748 gtggtacatcacggtgctgacggaactcactgaaatggagaccagcgctaaacacggttg 1807
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct: 361 gtggtacatcacggtgctgacggaactcactgaaatggagaccagcgctaaacacggatg 420
Query: 1808 tatgatagccgggcagttattggaggtgggggcccgggtgtcggagacccgggctttcgc 1867
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 tatgatagccgggcagttattggaggtgggggcccgggtgtcggagacccgggctttcgc 480
Query: 1868 cgcccgcgagtgctcgtcgctggtgacccgcaccgccgcaacacaacacgcgcctcgtgc 1927
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 cgcccgcgagtgctcgtcgctggtgacccgcaccgccgcaacacaacacgcgcctcgtgc 540
Query: 1928 cgcctccagggaggtgttgtacgccgccgcctatgtactcagcgaatactgcaccgagga 1987
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 cgcctccagggaggtgttgtacgccgccgcctatgtactcagcgaatactgcaccgagga 600
Query: 1988 gccggtgatgcgatcttccctgtctcctctgctggtgtgtgccggtctccacgcgggccc 2047
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 601 gccggtgatgcgatcttccctgtctcctctgctggtgtgtgccggcctccacgcgggccc 660
Query: 2048 gtccagcgcgcatatgcgggcccgggcggtgtgtgtgcacgccgc 2092
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661 gtccagcgcgcatatgcgggcccgggcggtgtgtgtgcacgccgc 705
Database: est
Posted date: Jul 14, 2011 2:25 PM
Number of letters in database: 8,280,457
Number of sequences in database: 9484
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Sequences: 9484
Number of Hits to DB: 442,145
Number of extensions: 9658
Number of successful extensions: 9658
Number of sequences better than 1.0e-10: 3
Number of HSP's gapped: 9656
Number of HSP's successfully gapped: 3
Length of query: 3901
Length of database: 8,280,457
Length adjustment: 18
Effective length of query: 3883
Effective length of database: 8,109,745
Effective search space: 31490139835
Effective search space used: 31490139835
X1: 11 (21.8 bits)
X2: 15 (29.7 bits)
X3: 50 (99.1 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 35 (69.9 bits)