BLASTN 2.2.24 [Aug-08-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= DPGLEAN06525 (UTR included)
(1828 letters)
Database: est
9484 sequences; 8,280,457 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
BF01005A2E05 1239 0.0
BF01024B1A07 1181 0.0
BF01060B2C08 466 e-131
>BF01005A2E05
Length = 627
Score = 1239 bits (625), Expect = 0.0
Identities = 625/625 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 520 tgtttgctcttggtattttcctttgctatttagaaacgatagcgtcaactgaagatgttt 579
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3 tgtttgctcttggtattttcctttgctatttagaaacgatagcgtcaactgaagatgttt 62
Query: 580 gtgtcaaaaaaggaccctgttcatgtgagttctccaatggtaccggtattgatttatcgc 639
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 63 gtgtcaaaaaaggaccctgttcatgtgagttctccaatggtaccggtattgatttatcgc 122
Query: 640 caactgcaaatggatttgctatgacgcaaacttatgaattaaagaatgaaggttcgcaat 699
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 123 caactgcaaatggatttgctatgacgcaaacttatgaattaaagaatgaaggttcgcaat 182
Query: 700 actctttgagcacatattattatcatccctgctatgatatccaactcaagatcaatacga 759
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 183 actctttgagcacatattattatcatccctgctatgatatccaactcaagatcaatacga 242
Query: 760 ccaaagttataggcacttgcggaaatcctttgtcgatatgtagatatacaaggaattttg 819
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 243 ccaaagttataggcacttgcggaaatcctttgtcgatatgtagatatacaaggaattttg 302
Query: 820 atttgcaaaatgcaacaaaagatacatttaaaattgacgatggcaattatgagtttatgg 879
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 303 atttgcaaaatgcaacaaaagatacatttaaaattgacgatggcaattatgagtttatgg 362
Query: 880 gaagttctaatataactcagtttggcgcagacggaaagtctatcatatacttcaatgggc 939
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 363 gaagttctaatataactcagtttggcgcagacggaaagtctatcatatacttcaatgggc 422
Query: 940 cttcttcaactgtggttatgttgatatgtgcccagacggaaaatagattacatatttatt 999
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 423 cttcttcaactgtggttatgttgatatgtgcccagacggaaaatagattacatatttatt 482
Query: 1000 ccttggaagaaccggacaaaattgtgttggcattttattctagggaggcatgcctgaaac 1059
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 483 ccttggaagaaccggacaaaattgtgttggcattttattctagggaggcatgcctgaaac 542
Query: 1060 agattgaagaactcggtccatcattgggtacaactttgctcataatattattttcatttg 1119
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 543 agattgaagaactcggtccatcattgggtacaactttgctcataatattattttcatttg 602
Query: 1120 tagctctgtatctagctttaggtat 1144
|||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 603 tagctctgtatctagctttaggtat 627
>BF01024B1A07
Length = 820
Score = 1181 bits (596), Expect = 0.0
Identities = 611/616 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 409 tttacaaatgatttgaataattgaattttttgacttatacatctgatgtttagttattga 468
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 13 tttacaaatgatttgaataattgaattttttgacttatacatctgatgtttagttattga 72
Query: 469 cgtttcattatagcaaagttaagaatttgaatatgttcgactataagatgctgtttgctc 528
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 73 cgtttcattatagcaaagttaagaatttgaatatgttcgactataagatgctgtttgctc 132
Query: 529 ttggtattttcctttgctatttagaaacgatagcgtcaactgaagatgtttgtgtcaaaa 588
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 133 ttggtattttcttttgctatttagaaacgatagcgtcaactgaagatgtttgtgtcaaaa 192
Query: 589 aaggaccctgttcatgtgagttctccaatggtaccggtattgatttatcgccaactgcaa 648
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 193 aaggaccctgttcatgtgagttctccaatggtaccggtattgatttatcgccaactgcaa 252
Query: 649 atggatttgctatgacgcaaacttatgaattaaagaatgaaggttcgcaatactctttga 708
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 253 atggatttgctatgacgcaaacttatgaattaaagaatgaaggttcgcaatactctttga 312
Query: 709 gcacatattattatcatccctgctatgatatccaactcaagatcaatacgaccaaagtta 768
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 313 gcacatattattatcatccctgctatgatatccaactcaagatcaatacgaccaaagtta 372
Query: 769 taggcacttgcggaaatcctttgtcgatatgtagatatacaaggaattttgatttgcaaa 828
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 373 taggcacttgcggaaatcctttgtcgatatgtagatatacaaggaattttgatttgcaaa 432
Query: 829 atgcaacaaaagatacatttaaaattgacgatggcaattatgagtttatgggaagttcta 888
|||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 433 atgcgacaaaagatacatttaaaatcgacgatggcaattatgagtttatgggaagttcta 492
Query: 889 atataactcagtttggcgcagacggaaagtctatcatatacttcaatgggccttcttcaa 948
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 493 atataactcagtttggtgcagacggaaagtctatcatatacttcaatgggccttcttcaa 552
Query: 949 ctgtggttatgttgatatgtgcccagacggaaaatagattacatatttattccttggaag 1008
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 553 ctgtggttatgttgatatgtgcccagacggaaaatagattacatatttattccttggaag 612
Query: 1009 aaccggacaaaattgt 1024
|||| |||||||||||
Sbjct: 613 aaccagacaaaattgt 628
>BF01060B2C08
Length = 782
Score = 466 bits (235), Expect = e-131
Identities = 251/255 (98%), Gaps = 1/255 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1574 gtgattattgttgtagttttagttttggagtatgatgatctcttgtaaagatgtccattt 1633
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 gtgattattgttgtagttttagttttggagtatgatgatctcttgtaaagatgtccattt 60
Query: 1634 ttattttctgaatctgagtctgaacctctatagaacattttttttcttgtttgaagaccg 1693
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 61 ttattttctgaatctgagtctgaacctctatagaacatttt-tttcttgtttgaagaccc 119
Query: 1694 ctattaatttaattggttattgcctactaaaaaattcattttaatcatgtaataaataac 1753
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 120 ccattaatttaattggttattgcctactaaaaaattcattttaatcatgtaataaataac 179
Query: 1754 aaaaattgttaaaaatatctttatcataataatgtttgctgaatgtttgtaatataacat 1813
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 180 agaaattgttaaaaatatctttatcataataatgtttgctgaatgtttgtaatataacat 239
Query: 1814 ttttttattatataa 1828
|||||||||||||||
Sbjct: 240 ttttttattatataa 254
Database: est
Posted date: Jul 14, 2011 2:25 PM
Number of letters in database: 8,280,457
Number of sequences in database: 9484
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Sequences: 9484
Number of Hits to DB: 326,683
Number of extensions: 7698
Number of successful extensions: 7698
Number of sequences better than 1.0e-10: 3
Number of HSP's gapped: 7697
Number of HSP's successfully gapped: 3
Length of query: 1828
Length of database: 8,280,457
Length adjustment: 17
Effective length of query: 1811
Effective length of database: 8,119,229
Effective search space: 14703923719
Effective search space used: 14703923719
X1: 11 (21.8 bits)
X2: 15 (29.7 bits)
X3: 50 (99.1 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 34 (67.9 bits)