BLASTN 2.2.24 [Aug-08-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= DPGLEAN07086 (UTR included)
(2512 letters)
Database: est
9484 sequences; 8,280,457 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
BF14_2473_C1 3132 0.0
>BF14_2473_C1
Length = 1670
Score = 3132 bits (1580), Expect = 0.0
Identities = 1650/1671 (98%), Gaps = 3/1671 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 395 ccattaatataataaaattaaacactacgtacttggtta-tcgtgaaattaaagtatatt 453
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Sbjct: 1 ccattaataaaataaaatttaacactacgtacttggttagtcgtgaaattaaagtatatt 60
Query: 454 tcgacactggtagtattttaaatagacaacatatttataaaactgcaatgtcgaatcgag 513
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Sbjct: 61 tcgacactggtagtattttaaatagacaacatatttataaaactgcaatgtcgaatcgag 120
Query: 514 acctggacgagttaagaaattgctttaatagactaaaaataaaggaaaacgttccgacgg 573
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Sbjct: 121 acctggacgagttaagaaattgctttaatagactaaaaataaaggaaaacgttccgacgg 180
Query: 574 cactaaatgagataaaaagtattttagcttacaaaccagctgccgaagctgccccaacca 633
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Sbjct: 181 cactaaatgagataaaaagtattttagcttacaaaccagccgccgaagctgccccaacca 240
Query: 634 tcaggaacattgggatttccaaaatcctatattgcatcaacaccagtaccaaaagtgaag 693
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Sbjct: 241 tcaggaacattgggatttccaaaatcctatattgcatcaacacctctaccaaaagtgaag 300
Query: 694 ctgaacttgcttgtgatgtcttaaagatatgttttgataaatttgaacctggagaagcta 753
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Sbjct: 301 ctgaacttgcttgtgatgtcttaaagatatgttttgataaatttgaacctggagaagcta 360
Query: 754 ttaggtgttatatcagtcacttcatgtatttattgcggcatgaaagggactgtgtccgaa 813
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Sbjct: 361 ttaggtgttatatcagtcacttcatgtatttattgcggcatgaaagggactgtgttcgaa 420
Query: 814 gattggcggtggatgaggtctataaggctataacatcaaatgtcaatgtgcttccgttgc 873
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Sbjct: 421 gattggcggtggatgaggtctataaggctataacatcaaatgtcaatgtgcttccgttgc 480
Query: 874 cacaatacatagatgtatatgtggcagtcgctcaaatgatctgtgatgttgatattggca 933
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Sbjct: 481 cacaatacatagatgtatatgtggcagtcgctcaaatgatctgtgatgttgatattggca 540
Query: 934 tagccaataaagcagttttgataacgagcaatttgcctacggaagcttatccaaaagttt 993
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Sbjct: 541 tagccaataaagcagttttgataacaagcaatttgcctacggaagcttatccaaaagttt 600
Query: 994 tggaagaaatgaaaattgctctagattgcaacaatagtgccaaatgtaatgcttatgagg 1053
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Sbjct: 601 tggaggaaatgaaaattgctctagattgcaacaatagtgccaaatgtaatgcttatgagg 660
Query: 1054 tggttatgaacatatcctcaaagtcatatgatttattccaattgtgtgctcaagaaagat 1113
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Sbjct: 661 tggttatgaacatatcctcaaagtcatatgatttattccaattgtgtgctcaagaaagat 720
Query: 1114 atatagattttatggtaaatgagctcaactcggatgatatcttatatcagctgaatattc 1173
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Sbjct: 721 atatagattttatggta--tgagctcaactcggatgatatcttatatcagctgaatattc 778
Query: 1174 tcgaacttttgtcacaattagctgtaaaatctcatggaataaactatcttgttaaacaag 1233
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Sbjct: 779 tcgaacttttgtcacaattagctgtaaaatctcatggaataaactatcttgttaaacaag 838
Query: 1234 ggatgctacaaaaaatcgctgatcaagtcaaagagttgcatagcaatccattcggatcac 1293
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Sbjct: 839 ggatgctacaaaaaatcgctgatcaagttaaagagttgcatagcaatccattcggatcac 898
Query: 1294 ttttaactccaggttacatgaaattttttggttacattgcttacaattatccgaaagaaa 1353
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Sbjct: 899 ttttaactccaggttacatgaaattttttggttacattgcttacaattatccaaaagaaa 958
Query: 1354 tttttggaaaatatccgatcctattggaaacactctttgaagctttggattctaatgatt 1413
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Sbjct: 959 tttttggaaaatatcccatcctattggaaacactctttgaagctttggattctaatgatt 1018
Query: 1414 ccaatcttttgcctgttgctattgacacgctgggtttcattggaaccacgaatgaaggga 1473
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Sbjct: 1019 ccaatcttttgcctgttgctattgacacgctgggtttcattggaaccacaaatgaaggga 1078
Query: 1474 agatgtgtttagctacattaggcagcaaatatactcagaatattgaaagattgggtagca 1533
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Sbjct: 1079 agatgtgtttagctacattaggcagcaaatatactcagaatattgaaagattgggtagca 1138
Query: 1534 ttataagaaatagcccctctgaattacggattcgagccctacgttgcatgggaaatctaa 1593
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Sbjct: 1139 ttataagaaatagcccctctgaattacggattcgagccctacgttgtatgggaaatctaa 1198
Query: 1594 taagtgtggataaagatccaaattcaaaagttgaatctgttgatcagagaataactttga 1653
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Sbjct: 1199 taagcgtggataaagatccaaattcaaaagttgaatctgttgatcagagaataactttga 1258
Query: 1654 tgacgcgcgaatggttcaggattttgagtaagcagccgtcatctatggaagttttatatg 1713
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Sbjct: 1259 tgacgcgcgaatggttcaggattttgagtaagcagccgtcatctatggaagttttatatg 1318
Query: 1714 gcatttgtaagaatccattccccgatataaagttggctggattgattttacttgatgctg 1773
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Sbjct: 1319 gcatttgtaagaatccattccccgatataaagttggctggattgattttacttgatgctg 1378
Query: 1774 cttgtcaacaccagtggggtgaggagtcggtggcgagggtagcaggttttatcgagtatt 1833
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Sbjct: 1379 cttgtcaacaccagtggggtgaggagtcggtggcgagggtagcaggttttatcgagtatt 1438
Query: 1834 tattggatcggacaacggatttcaacaaggaatgcaatgaagctaaatatgatataataa 1893
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Sbjct: 1439 tattggatcggacaacagattttaataaggaatgcaatgaagctaaatatgatataataa 1498
Query: 1894 agaggttagcttcatctacagcttttgatgaagccattatcattcggctccaaaaatatg 1953
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Sbjct: 1499 agaggttagcttcatctacagctttcgatgaagccattatcattcggctccaaaaatatg 1558
Query: 1954 tggaacttggaccgttccagtctgaaactactttagaagttgctatggatggcgaataaa 2013
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Sbjct: 1559 tggaacttggaccgttccagtctgaaactactttagaagttgctatggatggcgaataaa 1618
Query: 2014 atataatgcttaactatttaaaaatgtattaaatttcaataaaataaccat 2064
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Sbjct: 1619 atataatgcttaactatttaaaaatgtattaaatttcaataaaataaccat 1669
Database: est
Posted date: Jul 14, 2011 2:25 PM
Number of letters in database: 8,280,457
Number of sequences in database: 9484
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Sequences: 9484
Number of Hits to DB: 355,496
Number of extensions: 7090
Number of successful extensions: 7090
Number of sequences better than 1.0e-10: 1
Number of HSP's gapped: 7088
Number of HSP's successfully gapped: 1
Length of query: 2512
Length of database: 8,280,457
Length adjustment: 17
Effective length of query: 2495
Effective length of database: 8,119,229
Effective search space: 20257476355
Effective search space used: 20257476355
X1: 11 (21.8 bits)
X2: 15 (29.7 bits)
X3: 50 (99.1 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 34 (67.9 bits)