BLASTN 2.2.24 [Aug-08-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= DPGLEAN08439 (UTR included)
(3598 letters)
Database: est
9484 sequences; 8,280,457 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
BF01046A2B10 1558 0.0
BF01014A1F05 1453 0.0
BF14_1516_C1 1243 0.0
BF01038A2F08 733 0.0
>BF01046A2B10
Length = 802
Score = 1558 bits (786), Expect = 0.0
Identities = 792/794 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 2537 tcatgaattaaaacctttgggtgacaaggaacgagtgacagaagggaacaaagagcaata 2596
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 9 tcatgaattaaaaccttcgggtgacaaggaacgagtgacagaagggaacaaagagcaata 68
Query: 2597 tttacaattagttacacaatggagaatgaccagaggaattgaagaacaaaccaatgcttt 2656
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 69 tttacaattagttacacaatggagaatgaccagaggaattgaagaacaaaccaatgcttt 128
Query: 2657 tctggacggattcaacgaggtagtaccacttgagtggctgaaatattttgatgagcgtga 2716
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 129 tctggacggattcaacgaggtagtaccacttgagtggctgaaatattttgatgagcgtga 188
Query: 2717 gctggaactgatgctgtgcgggatgcaggaggttgatgtagatgattggcagcggaacac 2776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 189 gctggaactgatgctgtgcgggatgcaggaggttgatgtagatgattggcagcggaacac 248
Query: 2777 catctacaggcattacacgagaaccagcaagcaggtcgtctggttttggcagtttgtaag 2836
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 249 catctacaggcattacacgagaaccagcaagcaggtcgtctggttttggcagtttgtaag 308
Query: 2837 acaaatggataatgagaaacgcgctaggctccttcagttcgtgactggaacatgtcgggt 2896
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 309 acaaatggataatgagaaacgcgctaggctccttcagttcgtgactggaacatgtcgggt 368
Query: 2897 gcctgtgggcgggttcgctgaactcatgggctctaatggaccacagagattctgtataga 2956
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 369 gcctgtgggcgggttcgctgaactcatgggctctaatggaccacagagattctgtataga 428
Query: 2957 aaaggtcggtaaggacacttggttgccgcgatcgcacacttgcttcaaccgcctagattt 3016
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 429 aaaggtcggtaaggacacttggttgccgcgatcgcacacttgcttcaaccgcctagattt 488
Query: 3017 accgccctacaagagctatgaacaattatgtgagaaattaaattatgcaattgaagaaac 3076
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 489 accgccctacaagagctatgaacaattatgtgagaaattaaattatgcaattgaagaaac 548
Query: 3077 agaaggcttcggtcaggagtgaataggtttgctattagttatagtagaatattgtaaatt 3136
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 549 ggaaggcttcggtcaggagtgaataggtttgctattagttatagtagaatattgtaaatt 608
Query: 3137 attattatgttattttaatgcaccaactaatatatggcatcattgaatgatacggtgccg 3196
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 609 attattatgttattttaatgcaccaactaatatatggcatcattgaatgatacggtgccg 668
Query: 3197 tcatgaaaaagaccaaccaaaaaattttatgaatatttgtttaaacaataattttattat 3256
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 669 tcatgaaaaagaccaaccaaaaaattttatgaatatttgtttaaacaataattttattat 728
Query: 3257 gtagatatatttagtgtactatgtcagttatataagatatattttgtttgaactatattt 3316
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 729 gtagatatatttagtgtactatgtcagttatataagatatattttgtttgaactatattt 788
Query: 3317 aaaagttcttctat 3330
||||||||||||||
Sbjct: 789 aaaagttcttctat 802
>BF01014A1F05
Length = 745
Score = 1453 bits (733), Expect = 0.0
Identities = 733/733 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1716 cccgatggacgcgtctactacgtcaaccacaaaaaccgcactactcagtgggaagatcca 1775
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 13 cccgatggacgcgtctactacgtcaaccacaaaaaccgcactactcagtgggaagatcca 72
Query: 1776 cgcacacagggtcaagagataagttcgttagaagaggcgttaccacccggttgggagatc 1835
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 73 cgcacacagggtcaagagataagttcgttagaagaggcgttaccacccggttgggagatc 132
Query: 1836 agatttactgaggagggaacgcgttatttcgtcgaccacaacacaagaactactacattc 1895
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 133 agatttactgaggagggaacgcgttatttcgtcgaccacaacacaagaactactacattc 192
Query: 1896 caagatcctcgtcccggggcaccgaagggacctcagggggcttacggggtccctcgagcg 1955
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 193 caagatcctcgtcccggggcaccgaagggacctcagggggcttacggggtccctcgagcg 252
Query: 1956 tacgaacgatccttcagatggaaacttagccaatttagatacctctgtcagagcaatgct 2015
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 253 tacgaacgatccttcagatggaaacttagccaatttagatacctctgtcagagcaatgct 312
Query: 2016 ttaccaagtcacattaaaattactttggctagacagactttgtttgaagattcctatcat 2075
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 313 ttaccaagtcacattaaaattactttggctagacagactttgtttgaagattcctatcat 372
Query: 2076 cagattatgagactaccagcgtatgaactgagaagaagactttatattatattccgaggt 2135
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 373 cagattatgagactaccagcgtatgaactgagaagaagactttatattatattccgaggt 432
Query: 2136 gaagaaggtctcgactatggtggcgtcagtcgagagtggttctttttattgtcgcatgag 2195
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 433 gaagaaggtctcgactatggtggcgtcagtcgagagtggttctttttattgtcgcatgag 492
Query: 2196 gttctcaaccccatgtactgtctgtttgaatatgcaaataaaaacaactatagccttcag 2255
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 493 gttctcaaccccatgtactgtctgtttgaatatgcaaataaaaacaactatagccttcag 552
Query: 2256 ataaatccagccagttatgtgaaccccgatcatttgctctactttaagtttattggaaga 2315
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 553 ataaatccagccagttatgtgaaccccgatcatttgctctactttaagtttattggaaga 612
Query: 2316 ttcatagcaatggcactctatcatggtagatttatttattctggtttcacaatgcccttc 2375
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 613 ttcatagcaatggcactctatcatggtagatttatttattctggtttcacaatgcccttc 672
Query: 2376 tataagagaatgttgaataagaagttgacaatgaaagacattgaatcaattgatccggaa 2435
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 673 tataagagaatgttgaataagaagttgacaatgaaagacattgaatcaattgatccggaa 732
Query: 2436 ttctacaactcat 2448
|||||||||||||
Sbjct: 733 ttctacaactcat 745
>BF14_1516_C1
Length = 958
Score = 1243 bits (627), Expect = 0.0
Identities = 636/639 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 432 gatttcaaataatgtgcaaaagctattataattatacctaagaaaacattatgaaatagt 491
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 320 gatttcaaataatgtgcaaaagctattataattatacctaagaaaacattatgaaatagt 379
Query: 492 cacatcactatgacggaaaacaccactacagtgacttcacctattactttatcaaattat 551
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 380 cacatcactatgacggaaaacaccactacagtgacttcacctattactttatcaaattat 439
Query: 552 catcaactcagtcttacagttgagtctgcgaacataagaaattcaggattattcaaaccg 611
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 440 catcaactcagtcttacagttgagtctgcgaacataagaaattcaggattattcaaaccg 499
Query: 612 aatccttatttacaagttgtagtagacgataagatttcacgacggacagaggttttgaag 671
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 500 aatccttatttacaagttgtagtagacgataagatttcacgacggacagaggttttgaag 559
Query: 672 aacactcaacatccaaaatggaaggaagatttcactgttttagtaacacctcagtctcaa 731
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 560 aacactcaacatccaaaatggaaggaagatttcactgttttagtaacacctcagtctcaa 619
Query: 732 atgctctttcgtttggcggaccatcatagttttagaaaagatcatattattggtgaaaaa 791
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 620 atgctctttcgtttggcggaccatcatagttttagaaaagatcatattattggtgaaaaa 679
Query: 792 agaataggtctattccaaattttgctatactttaacgggaaatgtgaaaatgttgaaatt 851
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 680 agaataggtctattccaaattttgctatactttaacgggaaatgtgaaaatgttgaaatt 739
Query: 852 tgtattgatttaatgaaaacagtatcaaatgaaaatgtaccacatgtagaagtcaagtcc 911
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 740 tgtattgatttaatgaaaacagtaccaaatgaaaatgtaccacatgcagaagtcaagtcc 799
Query: 912 gctgagctcactctattacttgatggtttaagaatagatcctgccgttctagctcaaaca 971
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 800 gctgagctcactctattacttgatggtttaagaatagatcctgccgttctagctcaaaca 859
Query: 972 ccagaatattttgagaggttgaattcccgtagtcctctaactgacggagtacgtgcaaga 1031
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 860 ccagaatattttgagaggttgaattcccgtagtcctctaactgacggagtacgtgctaga 919
Query: 1032 ataagattaaggaataatctggaagttgttaggtccatg 1070
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 920 ataagattaaggaataatctggaagttgttaggtccatg 958
>BF01038A2F08
Length = 754
Score = 733 bits (370), Expect = 0.0
Identities = 398/405 (98%), Gaps = 3/405 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 tttgaacttaaaattctattttttc-catacttatcttttattatttgtagcggaactct 59
|||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 352 tttgaacttaaaattctatttttttacataattatcttttattatttgtagcggaactct 411
Query: 60 aatttattgagcagacatttcattgaaatacattttttcgttaaaatgtttttgtaactt 119
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 412 aatttattgagcagacatttcattgaaatacattttttcgttaaaatgtttttgtaactt 471
Query: 120 gtccttgaaagtaacataattagatataatatgtatagtaaaatgtcaatatcatcttga 179
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 472 gtccttgaaagtaacataattagatataatatgtatagtaaaatgtcaatatcatcttga 531
Query: 180 atatgtaacacgtctatacaatatttacatttggaatgtatgataggatgttattgtgag 239
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 532 atatgtaacacgtctatacaatatttacatttggaatgtatgataggatgttattgtgag 591
Query: 240 tatgtttaatgttatcaatatgcaaaatttaagtcttacaattaaaaatttactgtattg 299
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 592 tatgtttaatgttatcaatatgcaacatttaagtcttacaattaaaaatttactgtattg 651
Query: 300 ataacactatagcatgctatctcttattgttgctttgataaaaaaaaaaaatccgtcata 359
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct: 652 ataacactatggcatgctatctcttattgttgctttgat--aaaaaaaaaatccgtcata 709
Query: 360 ccttttttttagctcttatagatcttttattgctacctaaggatt 404
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 710 ccttttttttagctcttatagatcttttattgctacctaaggatt 754
Database: est
Posted date: Jul 14, 2011 2:25 PM
Number of letters in database: 8,280,457
Number of sequences in database: 9484
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Sequences: 9484
Number of Hits to DB: 450,054
Number of extensions: 21596
Number of successful extensions: 21596
Number of sequences better than 1.0e-10: 4
Number of HSP's gapped: 21594
Number of HSP's successfully gapped: 4
Length of query: 3598
Length of database: 8,280,457
Length adjustment: 18
Effective length of query: 3580
Effective length of database: 8,109,745
Effective search space: 29032887100
Effective search space used: 29032887100
X1: 11 (21.8 bits)
X2: 15 (29.7 bits)
X3: 50 (99.1 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 35 (69.9 bits)