BLASTN 2.2.24 [Aug-08-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= DPGLEAN09772 (UTR included)
(2476 letters)
Database: est
9484 sequences; 8,280,457 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
BF01049A2B04 1570 0.0
BF14_2329_C1 1413 0.0
>BF01049A2B04
Length = 820
Score = 1570 bits (792), Expect = 0.0
Identities = 813/820 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 742 atgccaatgataatataaataaagttcaaccaacacgctacgacgacgacgagtctccga 801
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Sbjct: 1 atgccaatgataatataaataaagttcaaccaacacggtacgacgacgacgagtctccga 60
Query: 802 ttgtttcaaaaccggttagattcgttggagtcggtacaactgattttgaacaactgaaca 861
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Sbjct: 61 ttgtttcaaaaccggttagattcgttggagtcggtacaactgattttgaacaactgaaca 120
Query: 862 atgttacttacgccctaacagaatttagcgtcatcttaatgagaagtgttaaccaattaa 921
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Sbjct: 121 atgttacttacgccctaacagaatttagcgtcatcttaatgagaagtgttaaccaactaa 180
Query: 922 taagaggaaatgttatagtttctcccacgtctattgcgacagttttagctctcctacaac 981
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Sbjct: 181 taagaggaaatgttatagtttcacccacgtctattgcgacagttttagctcttctacaac 240
Query: 982 aaggaacttcgggagaggctcaggatcaaatgacaagagctctttcaatgccacctaacg 1041
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Sbjct: 241 aaggaacttcgggagaggctcaggatcaaatgacaagagctctttcaatgccacctaacg 300
Query: 1042 ccacagcgcctacttatcaaagacttacgtatgatatgaagaaaagaaattcaagaaaca 1101
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Sbjct: 301 ccacagcgcctacttatcaaagacttacgtatgatatgaagaaaagaaattcaagaaaca 360
Query: 1102 tactgactgtttccatcaatttataccttggagaaggttttcaaatagaaccagatttca 1161
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Sbjct: 361 tactgactgtttccatcaatttatacctcggagaaggttttcaaatagaaccagatttca 420
Query: 1162 aagagacctctgttcaatatttcggtagcgaaataacaaatgttgatttcagtagacctg 1221
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Sbjct: 421 aagagacctctgttcaatatttcggtagcgaaataacaaatgttgatttcagtagacctg 480
Query: 1222 gtccagctgttaggcaaataaataaatggatatcgatccaaactcataacagaattgccg 1281
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Sbjct: 481 gtccagctgttaggcaaataaataaatggatatcgatccaaactcataacagaattgccg 540
Query: 1282 aacttctaccggagagtgctgttagttcctccacccaagtgctaatagcaaatgtggtat 1341
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Sbjct: 541 aacttctaccggagagtgctgttagttccttcacccaagtgctaatagcaaatgtggtat 600
Query: 1342 atttcaaaggactttgggagacaaaatttaaaccagaatccacgagagagctattgttcc 1401
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Sbjct: 601 atttcaaaggactttgggagacaaaatttaaaccagaatccacgagagagctattgttcc 660
Query: 1402 acttaagtagtggcgaaagtattactgtgccatttatgcgcatgcgccattcttttagat 1461
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Sbjct: 661 acttaagtagtggcgaaagtattacagtgccatttatgcgcatgcgccattcttttagat 720
Query: 1462 atggtatagatgaagagagtaattcagctgtcgttgtaatgccatttgaaagataccagt 1521
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Sbjct: 721 atggtatagatgaagagagtaattcagctgtcgttgtaatgccatttgaaagataccagt 780
Query: 1522 actctcttataattatattaccacagcatcagtctaatgt 1561
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Sbjct: 781 actctcttataattatattaccacagcatcagtctaatgt 820
>BF14_2329_C1
Length = 829
Score = 1413 bits (713), Expect = 0.0
Identities = 798/829 (96%), Gaps = 18/829 (2%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1519 agtactctcttataattatattaccacagcatcagtctaatgtagacaatatattaaaat 1578
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Sbjct: 1 agtactctcttataattatattaccacagcatcagtctaatgtagacattatattaaaat 60
Query: 1579 cactatcaaataataaattacttaactatcttaaatttgatgaaagtgaaatccaattgg 1638
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Sbjct: 61 cactatcaaataataaattactgaactatcttaaatttgatgaaagtgaaatccaattgg 120
Query: 1639 aaattccgaaatttaccataaaatcacacactaatatgataccagtcttgcaaaagatgg 1698
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Sbjct: 121 aaattccgaaatttaccataaaatcacacactaatatgataccagtcttgcaaaagatgg 180
Query: 1699 gcatcactgaaattttttcaccgcaagctgatcttacgcgtattggaacttaccggacgt 1758
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Sbjct: 181 gcatcactgaaattttttcaccgcaagctgatcttacgcgtattggaacttaccggacgt 240
Query: 1759 attcacctagaatatctagtgctatacacaccggttatctgtcagtcgacgagcaaggtc 1818
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Sbjct: 241 attcacccagaatatctagtgctatacacaccggttatctgtcagtcgacgagcaaggtc 300
Query: 1819 tatcagcaacagcagctacaagttttgctgcaatcgccttatcatatgaggatccccctg 1878
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Sbjct: 301 tatcagcaacagcagctacaagttttgctgcaatcgccttatcatatgaggatccccctg 360
Query: 1879 cactgttccaggctaatagaccattcttagccgtattatgggacactcaattcgctattc 1938
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Sbjct: 361 cactgttccaggctaatagaccattcctagccgtattatgggacactcaattcgctattc 420
Query: 1939 ctttgtttatagccaaaattgaagacccatctaagtgataatttcatgttaagttttcta 1998
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Sbjct: 421 ctttgtttatagccaaaattgaagacccatctaagtgataatttcatgttaagttttcta 480
Query: 1999 ctacagatagttaacttgattttttattcttacacttatatatattacgtgtttattcat 2058
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Sbjct: 481 ctacagatagttaacttgattttttattcttacacttatatatattacgtgtttattcat 540
Query: 2059 ttaattataggactgatagtttttataccctctatgttacgacatatacttt-aacatgg 2117
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Sbjct: 541 ttaattataggactgatagtttttacaccctctgtgttacgacatatactttaaatatgg 600
Query: 2118 acataaaggcatcgcttatattgataacaaacgttatatttaacacaaatcatatcatga 2177
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Sbjct: 601 acataaagacatcgcttatattgataacaaacgttatatttaacacaaatcatatcatga 660
Query: 2178 tattatcatatcaa-----------------gatatcatactgccaacgaaatattacga 2220
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Sbjct: 661 tatgatcatatcaagatacaaatcatatcatgatatcatactgccatagaaatattccga 720
Query: 2221 aaggaaacaggcctcagcttcttaatctaaaattatttttcttatcaaatattagaaagt 2280
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Sbjct: 721 aaggaaacaggcctcagcttcttaatctaaaattatttttgttatcaaatattagaaagt 780
Query: 2281 ttttaatgatacatgcaatcagttaagttaaaggttacgtttaaaaata 2329
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Sbjct: 781 ttttaatgatacatgcaatcagttaagttaaaggttacgtttaaaaata 829
Database: est
Posted date: Jul 14, 2011 2:25 PM
Number of letters in database: 8,280,457
Number of sequences in database: 9484
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Sequences: 9484
Number of Hits to DB: 394,546
Number of extensions: 11681
Number of successful extensions: 11681
Number of sequences better than 1.0e-10: 2
Number of HSP's gapped: 11680
Number of HSP's successfully gapped: 3
Length of query: 2476
Length of database: 8,280,457
Length adjustment: 17
Effective length of query: 2459
Effective length of database: 8,119,229
Effective search space: 19965184111
Effective search space used: 19965184111
X1: 11 (21.8 bits)
X2: 15 (29.7 bits)
X3: 50 (99.1 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 34 (67.9 bits)