BLASTN 2.2.24 [Aug-08-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= DPGLEAN09800 (UTR included)
(2158 letters)
Database: est
9484 sequences; 8,280,457 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
BF14_1640_C1 2993 0.0
BF01016A2H01 1142 0.0
BF14_1640_C2 557 e-158
BF14_519_C1 250 8e-66
>BF14_1640_C1
Length = 1514
Score = 2993 bits (1510), Expect = 0.0
Identities = 1513/1514 (99%)
Strand = Plus / Plus
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Query: 1221 gaggtgatggaccccacagtggaccccgtcctagggttggataacgaaatattcacctcg 1280
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Query: 1281 ccgacgccggacaaaaggataatgctgtcggcggctaatccggccgtgttaacgggcacc 1340
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Query: 1341 tcgctggacacaccccccgtccggccctccagacccagcttcctccaagtaccccacaca 1400
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Query: 1401 ctcacacccgcacagatccacaacaacaaactgagcaacaacaacaaaatccccggcatc 1460
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Query: 1461 gagatcagcacgccaagcaacggtataccattcaacttcgacagcctcatggaaggcggg 1520
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Query: 1521 acggggctgacacccgtgcaccctcatccgttcgcacactctcacccacacgcgcaccct 1580
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Query: 1581 cacccatgcgcacagcagcagcgcgccgcccccgacctcgcctcgccggatgcacagaac 1640
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Query: 1641 agcctcgtcagcctctgagactacctcccggccggcctcttcgaacctctcgacctcttc 1700
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Query: 1701 gacctcgagagcga 1714
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Sbjct: 1501 gacctcgagagcga 1514
>BF01016A2H01
Length = 785
Score = 1142 bits (576), Expect = 0.0
Identities = 578/579 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 562 agttggccaacctagagggcctccagtcgggggtcccaacccgcaccacggcgaccataa 621
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Query: 622 cccccacacagttgcgcaacttcgaacagacttacatcgagttgagcaactgtcgcagcg 681
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Sbjct: 267 cccccacacagttgcgcaacttcgaacagacttacatcgagttgagcaactgtcgcagcg 326
Query: 682 aacagacgaaccacgcgggcttcgtaccgccttccgtcacgcaggccaacacttacggca 741
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Sbjct: 327 aacagacgaaccacgcgggcttcgtaccgccttccgtcacgcaggccaacacttacggca 386
Query: 742 tcctgaattcggcggcttactgtgactcgggcccgacgacattgcatgtgtcgccgggcc 801
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Query: 802 cactatcagcgagcggcgacagcagcagcagtcccggtctaccggctccgaagaggagga 861
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Query: 862 acatgggcggcagacgaccaactaaagccccccaagacatctctccagaagaagaggaac 921
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Sbjct: 507 acatgggcggcagacgaccaactaaagccccccaagacatctctccagaagaagaggaac 566
Query: 922 gcaggaagatacgccgcgagagaaacaaaatggccgcagcacgctgtcgcaaacgaaggt 981
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Query: 982 tggaccatacaaacgaattgcaagaggaaaccgataagttggaagaaaagaagcaagcgt 1041
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Query: 1102 atcatatgcacagcgggtgcagattgaataagcgatcta 1140
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Sbjct: 747 atcatatgcacagcgggtgcagattgaataagcgatcta 785
>BF14_1640_C2
Length = 780
Score = 557 bits (281), Expect = e-158
Identities = 284/285 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 564 ttggccaacctagagggcctccagtcgggggtcccaacccgcaccacggcgaccataacc 623
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Sbjct: 496 ttggccaacctagagggcctccagtcgggggtcccaacccgcaccacggcgaccataacc 555
Query: 624 cccacacagttgcgcaacttcgaacagacttacatcgagttgagcaactgtcgcagcgaa 683
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Sbjct: 556 cccacacagttgcgcaacttcgaacaaacttacatcgagttgagcaactgtcgcagcgaa 615
Query: 684 cagacgaaccacgcgggcttcgtaccgccttccgtcacgcaggccaacacttacggcatc 743
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Sbjct: 616 cagacgaaccacgcgggcttcgtaccgccttccgtcacgcaggccaacacttacggcatc 675
Query: 744 ctgaattcggcggcttactgtgactcgggcccgacgacattgcatgtgtcgccgggccca 803
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Sbjct: 676 ctgaattcggcggcttactgtgactcgggcccgacgacattgcatgtgtcgccgggccca 735
Query: 804 ctatcagcgagcggcgacagcagcagcagtcccggtctaccggct 848
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Sbjct: 736 ctatcagcgagcggcgacagcagcagcagtcccggtctaccggct 780
>BF14_519_C1
Length = 812
Score = 250 bits (126), Expect = 8e-66
Identities = 126/126 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 2033 tatagaataagtacttttatacggttatcgcctacgtgagtcaattgatgagctgttctt 2092
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Sbjct: 1 tatagaataagtacttttatacggttatcgcctacgtgagtcaattgatgagctgttctt 60
Query: 2093 atgttatggaggtgaatatatttttaataaataaataactagaatgtatttcagcgtaaa 2152
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Sbjct: 61 atgttatggaggtgaatatatttttaataaataaataactagaatgtatttcagcgtaaa 120
Query: 2153 taataa 2158
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Sbjct: 121 taataa 126
Database: est
Posted date: Jul 14, 2011 2:25 PM
Number of letters in database: 8,280,457
Number of sequences in database: 9484
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Sequences: 9484
Number of Hits to DB: 183,511
Number of extensions: 7605
Number of successful extensions: 7605
Number of sequences better than 1.0e-10: 4
Number of HSP's gapped: 7605
Number of HSP's successfully gapped: 4
Length of query: 2158
Length of database: 8,280,457
Length adjustment: 17
Effective length of query: 2141
Effective length of database: 8,119,229
Effective search space: 17383269289
Effective search space used: 17383269289
X1: 11 (21.8 bits)
X2: 15 (29.7 bits)
X3: 50 (99.1 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 34 (67.9 bits)