BLASTN 2.2.24 [Aug-08-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= DPGLEAN10051 (UTR included)
(3514 letters)
Database: est
9484 sequences; 8,280,457 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
BF14_1968_C1 2276 0.0
BF14_2515_C1 983 0.0
BF14_217_C1 728 0.0
BF01017B1E11 418 e-116
BF01051B1A02 172 2e-42
>BF14_1968_C1
Length = 1166
Score = 2276 bits (1148), Expect = 0.0
Identities = 1161/1166 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1041 acatccccgtgtatagcgactgagtttgaatgtcgtgaccgcatcacatgtgttcaccga 1100
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 acatccccgtgtatagcgactgagtttgaatgtnntgaccgcatcacatgtgttcaccga 60
Query: 1101 gcttgggtctgcgatggtgataaggattgtgctgacggcggtgatgaagctcctgagctt 1160
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 gcttgggtctgcgatggtgataaggattgtgctgacggcggtgatgaagctcctgagctt 120
Query: 1161 tgccgcgggaacgtcacttgcagactagatcagttcacatgcaaagaccacagctgcata 1220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 tgccgcgggaacgtcacttgcagactagatcagttcacatgcaaagaccacagctgcata 180
Query: 1221 ccaggagcactgtactgcaacggagataaagactgcccggatggtagcgacgaagttaac 1280
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 ccaggagcactgtactgcaacggagataaagactgcccggatggtagcgacgaagttaac 240
Query: 1281 tgcactaaaccaaaacacgtgtgcgacaaaaagacagaattcgattgtggcggcggtatg 1340
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 tgcactaaaccaaaacacgtgtgcgacaaaaagacagaattcgattgtggcggcggtatg 300
Query: 1341 tgcatacccttatctaaggtctgcgacaaacgaccggactgtcccaattttgaagacgaa 1400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||
Sbjct: 301 tgcatacccttatctaaggtctgcgacaaacgaccggactgtcccaacttcgaagacgaa 360
Query: 1401 cctcgtgatagatgtggggaagatgaatgtgccgtaaacaatggaggctgtacacaaaag 1460
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 cctcgtgatagatgtggggaagatgaatgtgccgtaaacaatggaggctgtacacaaaag 420
Query: 1461 tgtgtggacaccccagtggggtactactgcgactgtgagaaaggatacaaactgtctgat 1520
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 tgtgtggacaccccagtggggtactactgcgactgtgagaaaggatacaaactgtctgat 480
Query: 1521 aacaggacttgcgaagacatcgacgaatgtctggatccgggagcgtgttcccaaatatgc 1580
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 aacaggacttgcgaagacatcgacgaatgtctggatccgggagcgtgttcccaaatatgc 540
Query: 1581 accaacgagaaaggcaccttcaaatgcgaatgtcaccccggctacgcgagggaccctcgt 1640
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 accaacgagaaaggcaccttcaaatgcgaatgtcaccccggctacgcgagggaccctcgt 600
Query: 1641 gataggacccgctgcaaggccaccgagggtcatccgtcactgttgttcgcgagacgcttc 1700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 gataggacccgctgcaaggccaccgagggtcatccgtcactgttgttcgcgagacgcttc 660
Query: 1701 gacatcaggaagatcagcttggaccatcatgagatggtcgccatagtgaacgacaccaag 1760
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661 gacatcaggaagatcagcttggaccatcatgagatggtcgccatagtgaacgacaccaag 720
Query: 1761 tcggccacagccctcgactacgttttcagaaccggaatgatcttctggagtgacgtcatc 1820
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 721 tcggccacagccctcgactacgttttcagaaccggaatgatcttctggagtgacgtcatc 780
Query: 1821 gatgagaaaatttacaaggccccaatagacgaaggtagccaacgcacggtggtgatagga 1880
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 781 gatgagaaaatttacaaggccccaatagacgaaggtagccaacgcacggtggtgatagga 840
Query: 1881 gatcagctgatcacatccgatggtctcgctgtcgactggatctacaaccacctgtattgg 1940
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 841 gatcagctgatcacatccgatggtctcgctgtcgactggatctacaaccacctgtattgg 900
Query: 1941 acagatactggcaagaaccacatcgagctggccgaccttcaaggaaacatgaggaagata 2000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 901 acagatactggcaagaaccacatcgagctggccgaccttcaaggaaacatgaggaagata 960
Query: 2001 ctcatcagagacaagctcgaagaaccgagagccatagctctaaaccccctggatggatgg 2060
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 961 ctcatcagagacaagctcgaagaaccgagagccatagctctaaaccccctggatggatgg 1020
Query: 2061 atgtattggaccgattggggccaggttcctaagatcgaacgcgctggtatggacggatcc 2120
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1021 atgtattggaccgactggggccaggttcctaagatcgaacgcgctggtatggacggatcc 1080
Query: 2121 catagacagaccatcgtctcctatgacgtcaaatggcccaacggtctcactctcgacctc 2180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1081 catagacagaccatcgtctcctatgacgtcaaatggcccaacggtctcactctcgacctc 1140
Query: 2181 gtccggaaacgcgtatactgggtgga 2206
||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1141 gtccggaaacgcgtatactgggtgga 1166
>BF14_2515_C1
Length = 1573
Score = 983 bits (496), Expect = 0.0
Identities = 541/555 (97%), Gaps = 12/555 (2%)
Strand = Plus / Plus
Query: 2969 ggcccaggaaccactcaatacacctggtacaaatgactttgtatagtgtacgagctggca 3028
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 467 ggcccaggaaccactcaatacacctggtacaaatgactttgtatagtgtacgagctggca 526
Query: 3029 gtaaatataattgtatgtcattaaatgttaaaagaaaaaggaggaaatgtgataatttaa 3088
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 527 gtaaatataattgtatgtcattaaatgttaaaagaaaaaggaggaaatgtgataatttaa 586
Query: 3089 agtgtaaaccagtgttaatcagctaacgttatgtagtgagttgatagcatagtgcagtga 3148
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 587 agtgtaaaccagtgttaatcagctaacattatgtagtgagttgatagcatagtgcagtga 646
Query: 3149 atcgtggagcgcattggaacagagttcgctgtctgctatcaaacataatcaatttgttga 3208
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 647 atcgtggagcgcattggaacagagttcgctgtctgctatcaaacataatcaatttgttga 706
Query: 3209 ggatctcaaaattttataacccgattgtcacatgattgaatcttttctaacacgatatgt 3268
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 707 ggatctcaaaattttataacccgattgtcacatgattgaatcttttctaacacgatatgt 766
Query: 3269 ctgaatgccagatcagtttctctctcgcctttgcaattacatgataaaatgtggtcaaca 3328
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 767 ctgaatgccagatcagtttctctctcgcctttgcaattacatgataaaatgtggtcaaca 826
Query: 3329 tatcgcatactaaatacggtgtgatcttttaatatttctccatgatttttcttctttgat 3388
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 827 tatcgcatactaaatacggtgtgatcttttaatatttctccatgattt---ttctttgat 883
Query: 3389 tctatcctgtgaacaattttttatatgtaattgtattgatgtgtgcttgtgcctggtgca 3448
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 884 tctatcctgtgaacaattttttatatgtaattgtattgatgtgtgcttgtgcctggtgca 943
Query: 3449 ttgta--------ttatatattttttttt-tatatatattactttttactttaagttata 3499
||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 944 ttgtaatttaatgttatatatttttttttatatatatattactttttactttaagtcata 1003
Query: 3500 taaaattgtataaaa 3514
|||||||||||||||
Sbjct: 1004 taaaattgtataaaa 1018
>BF14_217_C1
Length = 909
Score = 728 bits (367), Expect = 0.0
Identities = 367/367 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 667 aggtggagtcatgcggcccagaggaattcacatgcagaggaaaacgtggagaatgcgtcc 726
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 543 aggtggagtcatgcggcccagaggaattcacatgcagaggaaaacgtggagaatgcgtcc 602
Query: 727 cattgacttggatgtgtgacgataacgttgattgctcagatggttctgacgagaaagcat 786
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 603 cattgacttggatgtgtgacgataacgttgattgctcagatggttctgacgagaaagcat 662
Query: 787 gcaatgaaacttgccggtccgatgagtttacatgtggaaatggtaaatgtatacaacaaa 846
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 663 gcaatgaaacttgccggtccgatgagtttacatgtggaaatggtaaatgtatacaacaaa 722
Query: 847 gatgggtttgtgatggtgatgacgactgtggtgatggaagcgatgaggtcaagtgtccag 906
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 723 gatgggtttgtgatggtgatgacgactgtggtgatggaagcgatgaggtcaagtgtccag 782
Query: 907 caccgacctgccaaccccacagccacttctcctgtgctgacggacattgtgtcacagcta 966
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 783 caccgacctgccaaccccacagccacttctcctgtgctgacggacattgtgtcacagcta 842
Query: 967 gatggcgctgcgacggtgacattgattgccctgatggtagtgatgaaatgggctgcgcga 1026
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 843 gatggcgctgcgacggtgacattgattgccctgatggtagtgatgaaatgggctgcgcga 902
Query: 1027 caacacc 1033
|||||||
Sbjct: 903 caacacc 909
>BF01017B1E11
Length = 770
Score = 418 bits (211), Expect = e-116
Identities = 211/211 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 790 atgaaacttgccggtccgatgagtttacatgtggaaatggtaaatgtatacaacaaagat 849
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 560 atgaaacttgccggtccgatgagtttacatgtggaaatggtaaatgtatacaacaaagat 619
Query: 850 gggtttgtgatggtgatgacgactgtggtgatggaagcgatgaggtcaagtgtccagcac 909
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 620 gggtttgtgatggtgatgacgactgtggtgatggaagcgatgaggtcaagtgtccagcac 679
Query: 910 cgacctgccaaccccacagccacttctcctgtgctgacggacattgtgtcacagctagat 969
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 680 cgacctgccaaccccacagccacttctcctgtgctgacggacattgtgtcacagctagat 739
Query: 970 ggcgctgcgacggtgacattgattgccctga 1000
|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 740 ggcgctgcgacggtgacattgattgccctga 770
Score = 240 bits (121), Expect = 1e-62
Identities = 121/121 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 547 cgtcgcagcgtagttgtactggtcacaattttgtttgtgcaaccgggcattgcatacccg 606
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 440 cgtcgcagcgtagttgtactggtcacaattttgtttgtgcaaccgggcattgcatacccg 499
Query: 607 gggcctggcgttgcgatgacaccccggattgccctgatggctctgatgagcatcattgtg 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 500 gggcctggcgttgcgatgacaccccggattgccctgatggctctgatgagcatcattgtg 559
Query: 667 a 667
|
Sbjct: 560 a 560
>BF01051B1A02
Length = 751
Score = 172 bits (87), Expect = 2e-42
Identities = 87/87 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 2611 attcagtaagacctgatgtggaggtgcataaaccaagtaatgattcaaagaaacttaata 2670
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 134 attcagtaagacctgatgtggaggtgcataaaccaagtaatgattcaaagaaacttaata 193
Query: 2671 tagttgaggaaaattctaagccaagtg 2697
|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 194 tagttgaggaaaattctaagccaagtg 220
Database: est
Posted date: Jul 14, 2011 2:25 PM
Number of letters in database: 8,280,457
Number of sequences in database: 9484
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Sequences: 9484
Number of Hits to DB: 349,735
Number of extensions: 7500
Number of successful extensions: 7500
Number of sequences better than 1.0e-10: 5
Number of HSP's gapped: 7497
Number of HSP's successfully gapped: 7
Length of query: 3514
Length of database: 8,280,457
Length adjustment: 18
Effective length of query: 3496
Effective length of database: 8,109,745
Effective search space: 28351668520
Effective search space used: 28351668520
X1: 11 (21.8 bits)
X2: 15 (29.7 bits)
X3: 50 (99.1 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 35 (69.9 bits)