BLASTN 2.2.24 [Aug-08-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= DPGLEAN10273 (UTR included)
(2641 letters)
Database: est
9484 sequences; 8,280,457 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
BF14_804_C1 2535 0.0
BF01010A2B05 1086 0.0
>BF14_804_C1
Length = 1335
Score = 2535 bits (1279), Expect = 0.0
Identities = 1320/1335 (98%)
Strand = Plus / Plus
Query: 263 attaatattgcttatatcaaatacagtatgtaagatatggttatcaaactgactttgtat 322
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Sbjct: 1 attaatcttgcttatatcaaatacagtatgtaagatatggtcattaaagtgactttgtat 60
Query: 323 tatgtagttctttaagctttacagtaactataaatcacgcagctcaaagatgaattccag 382
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Sbjct: 61 tatgtagttctttaagctttacagtaactataaatcacgcagctcaaagatgaattccag 120
Query: 383 taatagcaacaacgaaaatgtctattacgaagacattccccctggaactcttaatgaaga 442
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Sbjct: 121 taatagcaacaacgaaaatgtctattacgaagacattccccctggaactcttaatgaaga 180
Query: 443 agatttcttttgtacagaaaagattgtacccaggaaaattaaaccacaaaatattgttat 502
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Sbjct: 181 agatttcttttgtacagaaaagattgtacccaggaaaattaaaccacaaaatattgttat 240
Query: 503 gagattaatggacagggaaatttacggatctcgcaaaccgggttctcattttcatgtcgt 562
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Sbjct: 241 gagattaatggacagagaaatttacggatctcgcaaaccgggttctcattttcatgttgt 300
Query: 563 cagagaattttatcaaaatgtttttcctaacttgactattgtcaatgtggagaaaccccc 622
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Sbjct: 301 cagagaattttatcaaaatgtttttcctaacttgactattgtcaatgtggagaaaccccc 360
Query: 623 gtgttttttgagaaaatttagtccagacggaaagcattttattgctttctctgctgatca 682
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Sbjct: 361 gtgttttttgagaaaatttagtccagacggaaagcattttattgctttctctgctgatca 420
Query: 683 gacatccttggagatatatgaatacagaggagcctctgccgcaggagacctagtggctgg 742
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Sbjct: 421 gacatccttggagatatatgaatacagaggagcctctgccgcaggagacctagtggctgg 480
Query: 743 atatccttcagatttacttaatgctgatgctgatgcacaccatagaataagaacacatat 802
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Sbjct: 481 atatccttcagatttacttaatgctgatgctgatgcacaccatagaataagaacacacat 540
Query: 803 attttacagattctttaagcctaaatttactgtaaatgtttgccaacaaaggctaccctc 862
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Sbjct: 541 attttacagattctttaagcctaaatttactgtaaatgtttgccaacaaaggctaccctc 600
Query: 863 cagatctgaacgtaactccggccagcatccttttatggatcagcaactcaacagggaatg 922
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Sbjct: 601 cagatctgaacgtaactccggccagcatccttttatggatcagcaactcaacagggaatg 660
Query: 923 cagtctttttacagaggatgggagatatgttatagttggttcagcggcacacatccctga 982
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Sbjct: 661 cagtctttttacagaggatgggagatatgttatagttggttcagcggcacacatccctga 720
Query: 983 tgatctgagacctcatttctatcacatacacagtaacaatgaagcagtgacaccaactat 1042
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Sbjct: 721 tgatctaagacctcatttctatcacatacacagtaacaatgaagcagtgacaccaactat 780
Query: 1043 tagatctgccctagaagactactctctgcatttggtagatttacatcatgggaagctttg 1102
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Sbjct: 781 tagatctgccctagaagactactctctgcatttggtagatttacatcatgggaagctttg 840
Query: 1103 cgatacaaaacacttcagaactgacaaaatatacctgtctcataatcaaggaatttattt 1162
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Sbjct: 841 cgatacaaaacacttcaggaccgacaaaatatacctgtctcataatcaaggaatttattt 900
Query: 1163 atataaagaagttttagctgtactctctgtgcagcatcaaacgatacacttgttccagat 1222
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Sbjct: 901 atataaagaagtattagctgtactctctgtgcagcatcaaacgatacacttgttccagat 960
Query: 1223 tgttgagggtatgttgatagaaatacgaaaaattggtagattctgctacgatgatgatcc 1282
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Sbjct: 961 tgttgagggtatgttgatagaaatacgaaaaattggtagattctgctacgatgatgatcc 1020
Query: 1283 gttcattgtcagctcagtgtttgcgccaataacaaatgaaaggcccttccatgaagagac 1342
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Sbjct: 1021 gttcattgtcagctcagtgtttgcgccaataacaaatgaaaggcccttccatgaagagac 1080
Query: 1343 aattaacagtttgaagcatagactacttgtgttcctatttaaaagagctaaatctataag 1402
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Sbjct: 1081 aattaacagtttgaagcatagactacttgtgttcctatttaaaagagctaaatctataag 1140
Query: 1403 tgacaatacaaaggatccattggaattgaggaaattttataaatattttgacatgtttaa 1462
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Sbjct: 1141 tgacaatacaaaggatccattggaattgaggaaattttataaatattttgacatgtttaa 1200
Query: 1463 aagtttgaggatgtggaagatgcagctattggatgaagatcaccttttcattaagtacgc 1522
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Sbjct: 1201 aagtttgaggatgtggaagatgcagctattggatgaagatcaccttttcattaagtacgc 1260
Query: 1523 aagcgaagaggttgttacattaagagtggctgaaccgaatagccagtcatcgttctttgt 1582
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Sbjct: 1261 aagcgangnnnttgttacattaagagtggctgaaccgaatagccagtcatcgttctttgt 1320
Query: 1583 gatatataacataag 1597
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Sbjct: 1321 gatatataacataag 1335
>BF01010A2B05
Length = 745
Score = 1086 bits (548), Expect = 0.0
Identities = 580/592 (97%), Gaps = 2/592 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 232 gatgatttgtcctgttatttgtttatttagaattaatattgcttatatcaaatacagtat 291
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Sbjct: 1 gatgatttgtcctgttatttgtttatttagaattaatattgcttatatcaaatacagtat 60
Query: 292 gtaagatatggttatcaaactgactttgtattatgtagttctttaagctttacagtaact 351
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Sbjct: 61 gtaagatatggtcatcaaactgactttgtattatgtagttctttaagctttacagtaact 120
Query: 352 ataaatcacgcagctcaaagatgaattccagtaatagcaacaacgaaaatgtctattacg 411
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Sbjct: 121 ataaatcacgcagctcaaagatgaattccagtaatagcaacaacgaaaatgtctattacn 180
Query: 412 aagacattccccctgg--aactcttaatgaagaagatttcttttgtacagaaaagattgt 469
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Sbjct: 181 nannnnttccccccgnnnaactcttaatgaagaagatttcttttgtacagaaaagattgt 240
Query: 470 acccaggaaaattaaaccacaaaatattgttatgagattaatggacagggaaatttacgg 529
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Sbjct: 241 acccaggaaaattaaaccacaaaatattgttatgagattaatggacagagaaatttacgg 300
Query: 530 atctcgcaaaccgggttctcattttcatgtcgtcagagaattttatcaaaatgtttttcc 589
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Sbjct: 301 atctcgcaaaccgggttctcattttcatgtcgtcagagaattttatcaaaatgtttttcc 360
Query: 590 taacttgactattgtcaatgtggagaaacccccgtgttttttgagaaaatttagtccaga 649
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Sbjct: 361 taacttgactattgtcaatgtggagaaacccccgtgttttttgagaaaatttagtccaga 420
Query: 650 cggaaagcattttattgctttctctgctgatcagacatccttggagatatatgaatacag 709
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Sbjct: 421 cggaaagcattttattgctttctctgctgatcagacatccttggagatatatgaatacag 480
Query: 710 aggagcctctgccgcaggagacctagtggctggatatccttcagatttacttaatgctga 769
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Sbjct: 481 aggagcctctgccgcaggagacctagtggctggatatccttcagatttacttaatgctga 540
Query: 770 tgctgatgcacaccatagaataagaacacatatattttacagattctttaag 821
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Sbjct: 541 tgctgatgcacaccatagaataagaacacatatattttacagattctttaag 592
Database: est
Posted date: Jul 14, 2011 2:25 PM
Number of letters in database: 8,280,457
Number of sequences in database: 9484
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Sequences: 9484
Number of Hits to DB: 387,146
Number of extensions: 9466
Number of successful extensions: 9466
Number of sequences better than 1.0e-10: 2
Number of HSP's gapped: 9465
Number of HSP's successfully gapped: 2
Length of query: 2641
Length of database: 8,280,457
Length adjustment: 17
Effective length of query: 2624
Effective length of database: 8,119,229
Effective search space: 21304856896
Effective search space used: 21304856896
X1: 11 (21.8 bits)
X2: 15 (29.7 bits)
X3: 50 (99.1 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 34 (67.9 bits)