BLASTN 2.2.24 [Aug-08-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= DPGLEAN11112 (UTR included)
(2071 letters)
Database: est
9484 sequences; 8,280,457 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
BF14_1651_C1 2387 0.0
BF01025A1F07 971 0.0
>BF14_1651_C1
Length = 1208
Score = 2387 bits (1204), Expect = 0.0
Identities = 1207/1208 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 357 tgttactgtagtataatatgtttttagataagataggaaatgttagattggtgtagtata 416
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 tgttactgtagtataatatgtttttagataagataggaaatgttagattggtgtagtata 60
Query: 417 tcgataaaacattataatgggataagtcaattgtaaatattaatatatgtgttgtagtga 476
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 tcgataaaacattataatgggataagtcaattgtaaatattaatatatgtgttgtagtga 120
Query: 477 cgtttgtcctggctcaaaaagacaatggaacattttggcctatcacatattttattcgaa 536
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 cgtttgtcctggctcaaaaagacaatggaacattttggcctatcacatattttattcgaa 180
Query: 537 ccggataaatatagtcccgatacgttggacttattagctgatgaagaagccagagaatat 596
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 ccggataaatatagtcccgatacgttggacttattagctgatgaagaagccagagaatat 240
Query: 597 tggctaaatacgtgtgaaaaacttgttgagaaatatgtaaattttgctctttctaataat 656
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 tggctaaatacgtgtgaaaaacttgttgagaaatatgtaaattttgctctttctaataat 300
Query: 657 gaagatccaactgttgaaataagagctttaaaatttaaaacttgttacgttgaggctttg 716
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 gaagatccgactgttgaaataagagctttaaaatttaaaacttgttacgttgaggctttg 360
Query: 717 aaagagcttcgagttaatccccttgctcatggacagttgactatacgattacttctcgac 776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 aaagagcttcgagttaatccccttgctcatggacagttgactatacgattacttctcgac 420
Query: 777 gtcaacgagacttgccttcgctctcagggattttttgacctatggaaacaacagaaaaag 836
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 gtcaacgagacttgccttcgctctcagggattttttgacctatggaaacaacagaaaaag 480
Query: 837 tatgaaaatgaaacagctcttgccagtttgtcaaccagattgtcagagttggatgcattg 896
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 tatgaaaatgaaacagctcttgccagtttgtcaaccagattgtcagagttggatgcattg 540
Query: 897 cctgataatagacagagatggaccgaattatgcagaggtgttttagctgggaatatgttt 956
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 cctgataatagacagagatggaccgaattatgcagaggtgttttagctgggaatatgttt 600
Query: 957 gattggggtgctcaagctgttacttcaattttaaattgtggcctctatgaagccctacag 1016
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 gattggggtgctcaagctgttacttcaattttaaattgtggcctctatgaagccctacag 660
Query: 1017 aagatacaaaaaagaccttggttgtatgatggtttagataaatggattgagaagttagag 1076
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661 aagatacaaaaaagaccttggttgtatgatggtttagataaatggattgagaagttagag 720
Query: 1077 aaaacagttcatcactgtgctgctgtttttgtagataacagtggtgttgatattgttttg 1136
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 721 aaaacagttcatcactgtgctgctgtttttgtagataacagtggtgttgatattgttttg 780
Query: 1137 ggaatactaccatttgtaagggctttgttactaagaggcacatcagtaatattatgtgct 1196
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 781 ggaatactaccatttgtaagggctttgttactaagaggcacatcagtaatattatgtgct 840
Query: 1197 aatgagtggccagctctaaatgatgttaccaatgttgagttgcaagaagttcttcaacat 1256
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 841 aatgagtggccagctctaaatgatgttaccaatgttgagttgcaagaagttcttcaacat 900
Query: 1257 gcatctcaaatttgtccagttttagctgccgcaatggctactggcgatttagttgttagg 1316
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 901 gcatctcaaatttgtccagttttagctgccgcaatggctactggcgatttagttgttagg 960
Query: 1317 tctaatggacaaagaggtccttgccttgactttagaacagtcagtgtagatctgtgtact 1376
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 961 tctaatggacaaagaggtccttgccttgactttagaacagtcagtgtagatctgtgtact 1020
Query: 1377 gaaatgaagatgcgtggagtagatttaattatattagagggtatggggagagctctacat 1436
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1021 gaaatgaagatgcgtggagtagatttaattatattagagggtatggggagagctctacat 1080
Query: 1437 acaaatttaaatgctcgtcttgctgtagattcactcaaactggctgtagtaaagaatgca 1496
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1081 acaaatttaaatgctcgtcttgctgtagattcactcaaactggctgtagtaaagaatgca 1140
Query: 1497 tggctagctcagcgactaggtggtccactgttttcagtgatttttatatatgaagaaaaa 1556
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1141 tggctagctcagcgactaggtggtccactgttttcagtgatttttatatatgaagaaaaa 1200
Query: 1557 cctttagt 1564
||||||||
Sbjct: 1201 cctttagt 1208
>BF01025A1F07
Length = 827
Score = 971 bits (490), Expect = 0.0
Identities = 496/498 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 339 gagttttcctagacgtagtgttactgtagtataatatgtttttagataagataggaaatg 398
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 gagttttcctagacgtagtgttactgtagtataatatgtttttagataagataggaaatg 60
Query: 399 ttagattggtgtagtatatcgataaaacattataatgggataagtcaattgtaaatatta 458
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 ttagattggtgtagtatatcgataaaacattataatgggataagtcaattgtaaatatta 120
Query: 459 atatatgtgttgtagtgacgtttgtcctggctcaaaaagacaatggaacattttggccta 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 atatatgtgttgtagtgacgtttgtcctggctcaaaaagacaatggaacattttggccta 180
Query: 519 tcacatattttattcgaaccggataaatatagtcccgatacgttggacttattagctgat 578
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 tcacatattttattcgaaccggataaatatagtcccgatacgttggacttattagctgat 240
Query: 579 gaagaagccagagaatattggctaaatacgtgtgaaaaacttgttgagaaatatgtaaat 638
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 gaagaagccagagaatattggctaaatacgtgtgaaaaacttgttgagaaatatgtaaat 300
Query: 639 tttgctctttctaataatgaagatccaactgttgaaataagagctttaaaatttaaaact 698
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 tttgctctttctaataatgaagatccgactgttgaaataagagctttaaaatttaaaact 360
Query: 699 tgttacgttgaggctttgaaagagcttcgagttaatccccttgctcatggacagttgact 758
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 361 tgttacgttgaggctttgaaagagcttcgagttaatccccttgctcatggacagttaact 420
Query: 759 atacgattacttctcgacgtcaacgagacttgccttcgctctcagggattttttgaccta 818
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 atacgattacttctcgacgtcaacgagacttgccttcgctctcagggattttttgaccta 480
Query: 819 tggaaacaacagaaaaag 836
||||||||||||||||||
Sbjct: 481 tggaaacaacagaaaaag 498
Score = 654 bits (330), Expect = 0.0
Identities = 330/330 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 946 ggaatatgtttgattggggtgctcaagctgttacttcaattttaaattgtggcctctatg 1005
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 498 ggaatatgtttgattggggtgctcaagctgttacttcaattttaaattgtggcctctatg 557
Query: 1006 aagccctacagaagatacaaaaaagaccttggttgtatgatggtttagataaatggattg 1065
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 558 aagccctacagaagatacaaaaaagaccttggttgtatgatggtttagataaatggattg 617
Query: 1066 agaagttagagaaaacagttcatcactgtgctgctgtttttgtagataacagtggtgttg 1125
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 618 agaagttagagaaaacagttcatcactgtgctgctgtttttgtagataacagtggtgttg 677
Query: 1126 atattgttttgggaatactaccatttgtaagggctttgttactaagaggcacatcagtaa 1185
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 678 atattgttttgggaatactaccatttgtaagggctttgttactaagaggcacatcagtaa 737
Query: 1186 tattatgtgctaatgagtggccagctctaaatgatgttaccaatgttgagttgcaagaag 1245
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 738 tattatgtgctaatgagtggccagctctaaatgatgttaccaatgttgagttgcaagaag 797
Query: 1246 ttcttcaacatgcatctcaaatttgtccag 1275
||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 798 ttcttcaacatgcatctcaaatttgtccag 827
Database: est
Posted date: Jul 14, 2011 2:25 PM
Number of letters in database: 8,280,457
Number of sequences in database: 9484
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Sequences: 9484
Number of Hits to DB: 286,576
Number of extensions: 6023
Number of successful extensions: 6023
Number of sequences better than 1.0e-10: 2
Number of HSP's gapped: 6023
Number of HSP's successfully gapped: 3
Length of query: 2071
Length of database: 8,280,457
Length adjustment: 17
Effective length of query: 2054
Effective length of database: 8,119,229
Effective search space: 16676896366
Effective search space used: 16676896366
X1: 11 (21.8 bits)
X2: 15 (29.7 bits)
X3: 50 (99.1 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 34 (67.9 bits)