BLASTN 2.2.24 [Aug-08-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= DPGLEAN11266 (UTR included)
(1420 letters)
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Query: 444 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 489
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Sbjct: 50 tatatacatatatacatatatatatctatatatatatatatatata 95
Score = 67.9 bits (34), Expect = 4e-11
Identities = 43/46 (93%)
Strand = Plus / Minus
Query: 444 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 489
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Sbjct: 95 tatatatatatatatatatagatatatatatgtatatatgtatata 50
>BF01050B2E02
Length = 795
Score = 67.9 bits (34), Expect = 4e-11
Identities = 43/46 (93%)
Strand = Plus / Plus
Query: 441 gtgtatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 486
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Sbjct: 458 gtgtatatatatatatttatatacatatatatttatatatatatat 503
>BF01051A2H01
Length = 752
Score = 67.9 bits (34), Expect = 4e-11
Identities = 43/46 (93%)
Strand = Plus / Plus
Query: 444 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 489
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Sbjct: 331 tatatacatacatatatgtatatatatatatatatatatatatata 376
Score = 67.9 bits (34), Expect = 4e-11
Identities = 43/46 (93%)
Strand = Plus / Minus
Query: 444 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 489
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Sbjct: 376 tatatatatatatatatatatatatatacatatatgtatgtatata 331
Database: est
Posted date: Jul 14, 2011 2:25 PM
Number of letters in database: 8,280,457
Number of sequences in database: 9484
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Sequences: 9484
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Length adjustment: 17
Effective length of query: 1403
Effective length of database: 8,119,229
Effective search space: 11391278287
Effective search space used: 11391278287
X1: 11 (21.8 bits)
X2: 15 (29.7 bits)
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S1: 12 (24.3 bits)
S2: 34 (67.9 bits)