BLASTN 2.2.24 [Aug-08-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= DPGLEAN11457 (UTR included)
(2494 letters)
Database: est
9484 sequences; 8,280,457 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
BF14_530_C1 2389 0.0
BF01017B1G05 751 0.0
>BF14_530_C1
Length = 1746
Score = 2389 bits (1205), Expect = 0.0
Identities = 1227/1233 (99%), Gaps = 1/1233 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 385 aaatttggtttaaaaacttaatattatacctatatattttaatgttatattattattatt 444
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Sbjct: 1 aaatttggtttaaaaacttaatattatacctatatattttaatgttatattattattatt 60
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Sbjct: 121 ctcgacaacttggtagagtagtttcgcaaattttgaataggtattttggagaaatcgtcg 180
Query: 565 aaaaagtgggaaacgatctgttcatgtatggttgtaaacccatgggtatgataataaaga 624
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Query: 685 tagctacatttgaagctaaagatgttattgttgattacaaattacagccagaaaatatat 744
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Query: 745 tactgctcatacgatacccaaggtatcttttgcaaatgaaaactaagtatggcagtgagg 804
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Query: 805 ctgaaatgttggttgaggaattgttacaacaggcatcttgtactgcaacggtactaatag 864
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Query: 865 tcagcgtcatgaacaaatacaaagacgataaggaaaagaatttaaatatagtgaaattaa 924
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Sbjct: 481 tcagcgtcatgaacaaatacaaagacgataaggaaaagaatttaaatatagtgaaattaa 540
Query: 925 aagacacattcattagtctggcgactgcaggatatattcagcaagctccggtggcagaaa 984
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Sbjct: 541 aagacacattcattagtctggcgactgcaggatatattcagcaagctccggtggcagaaa 600
Query: 985 ttaacaatgaaatacctgttttagtacccgtggccaccatagtaccagatttagatgtta 1044
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Sbjct: 601 ttaacaatgaaatacctgttttagtacccgtggccaccatagtaccagatttagatgtta 660
Query: 1045 gagaattaattaatgctatgaacagcaatctcaacaatgttagtgacaatatttactgga 1104
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Sbjct: 661 gagaattaattaatgctatgaacagcaatctcaacaatgttagtgacaatatttactgga 720
Query: 1105 aagtaaactatgatagattccaccttgatttccgagatgaagttatgataaaggcagtga 1164
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Query: 1165 cacgtcgcattgatgataatgccggggaattgttaaagttgatgttagagcagatgtatt 1224
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Query: 1225 tatcgtcatcatcgtgggcatctgactcgtcaccggtcccgctaactgatctaaaggatg 1284
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Sbjct: 841 tatcgtcatcatcgtgggcatctgactcgtcaccggtcccgcttactgatctaaaggatg 900
Query: 1285 gatgtcagaggatcggagagaatatgaaaaaccatgtggaacaatatttaagagttatcg 1344
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Sbjct: 901 gatgtcagaggatcggagagaatatgaaaaaccatgtggaacaatatttaagagttatcg 960
Query: 1345 aggaaagtacaggattcattcgtcgtacgggtgacgccgggggcgggcaatatagtgtga 1404
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Sbjct: 961 aggaaagtacaggattcattcgtcgtacgggtgacgccgggggcgggcaatatagtgtga 1020
Query: 1405 ggatccaacacg-ctctgatacaactcgtggaagctgtgtgtgatcatacggtcactgag 1463
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Sbjct: 1021 ggatccaacacgnctctgatacaactcgtggaagctgtgtgtgatcatacggtcactgag 1080
Query: 1464 agactcgggggaaaagcagccagaatatttagattgataagatccaaaaagtacttagaa 1523
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Sbjct: 1081 agactcgggggaaaagcagccagaatatttagattgataagatccaaaaagtacttagaa 1140
Query: 1524 gaggacgatatacagaagaatgcgatgctacccaacaaggagtgtaaggaattgacttac 1583
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Sbjct: 1141 gaggacgatatacagaagaatgccatgctacccaacaaggagtgtaaggaactgacttac 1200
Query: 1584 aaattgttggaggaacattttattagtgttcag 1616
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Sbjct: 1201 aaattgttggaggaacattttattagtgttcag 1233
Score = 870 bits (439), Expect = 0.0
Identities = 445/447 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1615 agccgatgagaaaaacagcttcagcgggcggtatggccaaagcgatatatttataccacg 1674
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Sbjct: 1300 agccgatgagaaaaacagcttcagcgggcggtatggccaaagcgatatatttataccacg 1359
Query: 1675 tcaagttacatgatgtagcacacgtcgtccgtgacatgtgctatcggtcgctccacaacg 1734
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Sbjct: 1360 tcaagttacatgatgtagcacacgtcgtccgtgacatgtgctatcggtcgctccacaacg 1419
Query: 1735 tgatgtcggtgtcgcgtcacaggcgcgtgttaaacgcgcgtctcttggaaaaaaaacgcc 1794
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Sbjct: 1420 tgatgtcggtgtcgcgtcacaggcgcgtgttaaacgcgcgtctcttggaaaaaaaacgcc 1479
Query: 1795 gcgtccggacgatcgtgcacggcatgaggcttagaggggaaccccagcagaatattgacg 1854
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Sbjct: 1480 gcgtccggacgatcgtgcacggcatgaggcttagaggggaaccccagcagaatattgacg 1539
Query: 1855 atgtgctggataccctgactccgccggaagtgacgtcagcggcggaagcggagcgtcgcc 1914
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Sbjct: 1540 atgtgctggataccctgactccgccggaagtgacgtcagcggcggaagcggagcgtcgcc 1599
Query: 1915 ttagtacgctcgcagcatccgagctccacctggaccgcgccctgttcatactcaccagct 1974
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Sbjct: 1600 ttagtacgctcgcagcatccgagctccacctggaccgcgccctgttcatactcaccagct 1659
Query: 1975 acttcacgtaccagagatgatccaacaacgtgtacttcattataataaagacctttatat 2034
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Sbjct: 1660 acttcacgtaccagagatgatccaacaacgtgtacttcattataataaagaactttatat 1719
Query: 2035 gttaatattaatctttatgttttattc 2061
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Sbjct: 1720 gttaatattaatccttatgttttattc 1746
>BF01017B1G05
Length = 732
Score = 751 bits (379), Expect = 0.0
Identities = 403/411 (98%), Gaps = 3/411 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 359 cgaaaagaaccatgtggaaaagaagtaaatttggtttaaaaacttaatattatacctata 418
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Sbjct: 1 cgaaaagaaccatgtggaaaagaagtaaatttnntttaaaaacttaatattatacctata 60
Query: 419 tattttaatgttatattattattattgaaacatatatcagagtttatcttatacaaccat 478
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Sbjct: 61 tattttaatgttatatt---attattgaaacatatatcagagtttaacttatacacccat 117
Query: 479 tactacaccaacacctaataatatgtctcgacaacttggtagagtagtttcgcaaatttt 538
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Sbjct: 118 tactacaccaacacctaataatatgtctcgacaacttggtagagtagtttcgcaaatttt 177
Query: 539 gaataggtattttggagaaatcgtcgaaaaagtgggaaacgatctgttcatgtatggttg 598
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Sbjct: 178 gaataggtattttggagaaatcgtcgaaaaagtgggaaacgatctgttcatgtatggttg 237
Query: 599 taaacccatgggtatgataataaagagtacaggcctacctcggacacaggtcatcgagag 658
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Sbjct: 238 taaacccatgggtatgataataaagagtacaggcctacctcggacacaggtcatcgagag 297
Query: 659 tttgagaactctccttaaatttgatctagctacatttgaagctaaagatgttattgttga 718
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Sbjct: 298 tttgagaactctccttaaatttgatctagctacatttgaagctaaagatgttattgttga 357
Query: 719 ttacaaattacagccagaaaatatattactgctcatacgatacccaaggta 769
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Sbjct: 358 ttacaaattacagccagaaaatatattactgctcatacgatatccaaggta 408
Score = 412 bits (208), Expect = e-114
Identities = 208/208 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 765 aggtatcttttgcaaatgaaaactaagtatggcagtgaggctgaaatgttggttgaggaa 824
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Sbjct: 525 aggtatcttttgcaaatgaaaactaagtatggcagtgaggctgaaatgttggttgaggaa 584
Query: 825 ttgttacaacaggcatcttgtactgcaacggtactaatagtcagcgtcatgaacaaatac 884
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Sbjct: 585 ttgttacaacaggcatcttgtactgcaacggtactaatagtcagcgtcatgaacaaatac 644
Query: 885 aaagacgataaggaaaagaatttaaatatagtgaaattaaaagacacattcattagtctg 944
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Sbjct: 645 aaagacgataaggaaaagaatttaaatatagtgaaattaaaagacacattcattagtctg 704
Query: 945 gcgactgcaggatatattcagcaagctc 972
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Sbjct: 705 gcgactgcaggatatattcagcaagctc 732
Database: est
Posted date: Jul 14, 2011 2:25 PM
Number of letters in database: 8,280,457
Number of sequences in database: 9484
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Sequences: 9484
Number of Hits to DB: 374,830
Number of extensions: 9138
Number of successful extensions: 9138
Number of sequences better than 1.0e-10: 2
Number of HSP's gapped: 9136
Number of HSP's successfully gapped: 4
Length of query: 2494
Length of database: 8,280,457
Length adjustment: 17
Effective length of query: 2477
Effective length of database: 8,119,229
Effective search space: 20111330233
Effective search space used: 20111330233
X1: 11 (21.8 bits)
X2: 15 (29.7 bits)
X3: 50 (99.1 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 34 (67.9 bits)