BLASTN 2.2.24 [Aug-08-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= DPGLEAN11698 (UTR included)
(2950 letters)
Database: est
9484 sequences; 8,280,457 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
BF14_161_C1 3824 0.0
>BF14_161_C1
Length = 1995
Score = 3824 bits (1929), Expect = 0.0
Identities = 1977/1993 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 428 aaacgttgctctattttcctcttagtcaatgtctgttaatcctagtgataagatctaaaa 487
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Query: 1328 tcaatttgaatctaaatgctacgaggatttcataccttacttagtacatgacaacggctt 1387
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Query: 1508 cacacgcgttacattaactgatgaaaacttcgttgatctactatcaaaattaattagggt 1567
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Query: 1568 aaatttggaaagcgtgtctatggcaaaaataataagatctctttatggttacggaggcaa 1627
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Query: 1688 gctgcgcgatcccatgtattggtatataattcaaactatgctagattactttacggatta 1747
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Query: 2048 ttcaaaatattttgaacttgatactttcacttattacatggaagaagggcttaacctcat 2107
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Query: 2108 taaatggtccccagaagcttcaaataaatattcgtatgatgattatttcaatgtagggtt 2167
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Query: 2168 aaagtctttgagaaaaaataagtttgatttgttcagatttccggaaaatatgttaatacc 2227
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Query: 2228 taaaggaactgaacagggattgaacattacattgttcgtcttacttatgcctgagcaata 2287
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Sbjct: 1803 taaaggaactgaacagggattgaacattacattgttcgtcttactgatgcctgagcaata 1862
Query: 2288 tataactgaatttaaagagacagacattttaggttttccattccaccgacaagcattagt 2347
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Query: 2348 aaatgataaattgctttacaaaaattacaagttttataacattgcgatataccataaaga 2407
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Sbjct: 1923 aaatgataaattgctttacaaaaattacaagttttataacattgcgatataccataaaga 1982
Query: 2408 aattaataacccg 2420
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Sbjct: 1983 aattaataacccg 1995
Database: est
Posted date: Jul 14, 2011 2:25 PM
Number of letters in database: 8,280,457
Number of sequences in database: 9484
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Sequences: 9484
Number of Hits to DB: 412,414
Number of extensions: 8416
Number of successful extensions: 8416
Number of sequences better than 1.0e-10: 1
Number of HSP's gapped: 8414
Number of HSP's successfully gapped: 1
Length of query: 2950
Length of database: 8,280,457
Length adjustment: 18
Effective length of query: 2932
Effective length of database: 8,109,745
Effective search space: 23777772340
Effective search space used: 23777772340
X1: 11 (21.8 bits)
X2: 15 (29.7 bits)
X3: 50 (99.1 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 34 (67.9 bits)