BLASTN 2.2.24 [Aug-08-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= DPGLEAN11844 (UTR included)
(3964 letters)
Database: est
9484 sequences; 8,280,457 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
BF14_1694_C1 1671 0.0
BF01048A1G03 1455 0.0
>BF14_1694_C1
Length = 1123
Score = 1671 bits (843), Expect = 0.0
Identities = 864/871 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 2440 ggtttcttcgaaatccaaactcgaatgaatataaggcgtatcgggaactggtgaataaga 2499
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 253 ggtttcttcgaaatccaaactcgaatgaatataaggcgtatcgcgaactggtgaataaga 312
Query: 2500 tgcggggtgaagttcaagacaggaagccggaagtgaaacccgaagacaaatatgaaccag 2559
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 313 tgcggggtgaagttcaagacaggaagccggaagtgaaacccgaagacaaatatgaaccag 372
Query: 2560 aattctctttagaagatgatgacagtaatgataatagaccaatcaaagatgaatataaat 2619
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 373 aattctctttagaagatgatgacagtaatgataatagaccaatcaaagatgaatataaat 432
Query: 2620 atagcaaccaagagagttacaataaacgtgagcagacgagctcccagagcgatgaggaat 2679
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 433 atagcaaccaagagagttacaataaacgtgagcagacgagctcccagagcgatgaggaat 492
Query: 2680 cagatgttaagagagagagaaggaagaggaagaagtcaagatggggggacgacccacctg 2739
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 493 cagatgttaagagagagagaaggaagaggaagaagtcaagatggggggacgacccacctg 552
Query: 2740 ttgatattaaaccacctggtgttgtattacccactggaataaccggtgcaaagttatcga 2799
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
Sbjct: 553 ttgacattaaaccacctggtgttgtattacccactggaataaccggtgcaaaattatcaa 612
Query: 2800 aattagaagaagaaggattaaagctgactacagttaataaaaataatcaagcattaatgc 2859
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 613 aattagaagaagaaggattaaagctgactacagttaataaaaataatcaagcattaatgc 672
Query: 2860 agtatgctatgattaattatggaacgactaatttgaatgccgaggattggaaaaaatgcg 2919
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 673 agtatgctatgattaattatggaacgactaatttgaatgccgaggattggaaaaaatgcg 732
Query: 2920 aagacaattttaaactaaatctgctttaccaggacatgttgaagaaacgccaggaagtgg 2979
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 733 aagacaattttaaactaaatctgctttaccaggacatgttgaagaaacgccaggaagtgg 792
Query: 2980 agcgtttagctgcggctgggaaacacaagtacgaatatgacagtgatgaagatgtagcag 3039
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 793 agcgtttagctgcggctgggaaacacaagtacgaatatgacagtgatgaagatgtagcag 852
Query: 3040 acggaacatgggaacataaattacgtgccaaggaaatgaatgcaactgaaagatgggcaa 3099
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 853 acggaacatgggaacataaattacgtgccaaggaaatgaatgcaactgaaagatgggcaa 912
Query: 3100 cggaactaacaaaacaagccgccggtaaacatcacattggagactttctacctccggaag 3159
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct: 913 cggaactaacaaaacaagccgctggtaaacatcacattggagactttctacctccggagg 972
Query: 3160 aacttaagaaatttatggaaaagtattcagctttcaaaagcggtaaagagccagatttga 3219
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 973 aacttaagaaatttatggaaaagtattcagcgttcaaaagcggtaaagagccagatttga 1032
Query: 3220 gtgactacaaagagtacaaactgaaagaggacaatgttggatttaaaatgcttcaaaaac 3279
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1033 gtgactacaaagagtacaaactgaaagaggacaatgttggatttaaaatgcttcaaaaac 1092
Query: 3280 tcggttggaatgaaggtcagggactcggggc 3310
|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1093 tcggttggaatgaaggtcagggactcggggc 1123
Score = 89.7 bits (45), Expect = 3e-17
Identities = 45/45 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 2398 aaaatgtcctgaatgctatacactcacaagaccaaaatatgtggt 2442
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 aaaatgtcctgaatgctatacactcacaagaccaaaatatgtggt 45
>BF01048A1G03
Length = 738
Score = 1455 bits (734), Expect = 0.0
Identities = 737/738 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1756 caggtccaaatatgagttcaggtcctatgatgggccctggagggccaaacatgccgccaa 1815
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 caggtccaaatatgagttcaggtcctatgatgggccctggagggccaaacatgccgccaa 60
Query: 1816 tgcccccctttatgaatggccctcctaacttttctatgccaccaaactttatgggcccca 1875
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 tgcccccctttatgaatggccctcctaacttttctatgccaccaaactttatgggcccca 120
Query: 1876 acggtccttgtggtccgggccaaatgccgccaaatatgtgcggagctaacatgcgcgggc 1935
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 acggtccttgtggtccgggtcaaatgccgccaaatatgtgcggagctaacatgcgcgggc 180
Query: 1936 ctagaccaaatgctccaatgccaccattctttccgccatttaacaatccacaaatgggta 1995
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 ctagaccaaatgctccaatgccaccattctttccgccatttaacaatccacaaatgggta 240
Query: 1996 acaacgcccccccaaattctatgaataatgtacgtttcggtcctaacggccctaactttg 2055
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 acaacgcccccccaaattctatgaataatgtacgtttcggtcctaacggccctaactttg 300
Query: 2056 gatcacgaccaccctttgggccaaatggctctaacttcggccccaacaacggacctctaa 2115
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 gatcacgaccaccctttgggccaaatggctctaacttcggccccaacaacggacctctaa 360
Query: 2116 atatgggtcaacctccgaacatgcctttcatgcatccaaattcattaccccctaatgtca 2175
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 atatgggtcaacctccgaacatgcctttcatgcatccaaattcattaccccctaatgtca 420
Query: 2176 tgtcggactcgaaacccttggatataccaccgcctgatcctatgaagctcggaaacatac 2235
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 tgtcggactcgaaacccttggatataccaccgcctgatcctatgaagctcggaaacatac 480
Query: 2236 cacctcctatgcccatgacccttaaccacattcctcaaccgaatgaccttgaaccaggaa 2295
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 cacctcctatgcccatgacccttaaccacattcctcaaccgaatgaccttgaaccaggaa 540
Query: 2296 acataccagctccgaacacatctcaagttctctctgcagatacgttcccgccggctgtac 2355
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 acataccagctccgaacacatctcaagttctctctgcagatacgttcccgccggctgtac 600
Query: 2356 tacgagccgcaaccgaagtggcaaccaacggcgaccactgggaaaatgtcctgaatgcta 2415
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 tacgagccgcaaccgaagtggcaaccaacggcgaccactgggaaaatgtcctgaatgcta 660
Query: 2416 tacactcacaagaccaaaatatgtggtttcttcgaaatccaaactcgaatgaatataagg 2475
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661 tacactcacaagaccaaaatatgtggtttcttcgaaatccaaactcgaatgaatataagg 720
Query: 2476 cgtatcgggaactggtga 2493
||||||||||||||||||
Sbjct: 721 cgtatcgggaactggtga 738
Database: est
Posted date: Jul 14, 2011 2:25 PM
Number of letters in database: 8,280,457
Number of sequences in database: 9484
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Sequences: 9484
Number of Hits to DB: 468,960
Number of extensions: 10838
Number of successful extensions: 10838
Number of sequences better than 1.0e-10: 2
Number of HSP's gapped: 10836
Number of HSP's successfully gapped: 3
Length of query: 3964
Length of database: 8,280,457
Length adjustment: 18
Effective length of query: 3946
Effective length of database: 8,109,745
Effective search space: 32001053770
Effective search space used: 32001053770
X1: 11 (21.8 bits)
X2: 15 (29.7 bits)
X3: 50 (99.1 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 35 (69.9 bits)