BLASTN 2.2.24 [Aug-08-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= DPGLEAN11850 (UTR included)
(3574 letters)
Database: est
9484 sequences; 8,280,457 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
BF14_1519_C1 3503 0.0
BF01028A1A09 1261 0.0
>BF14_1519_C1
Length = 1810
Score = 3503 bits (1767), Expect = 0.0
Identities = 1779/1783 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1628 ggagggattcaattgctctgcggaacaattcaacatttatctctttgatgcatcaaactg 1687
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2 ggagggattcaattgctctgcggaacaattcaacatttatctctttgatgcatcaaactg 61
Query: 1688 tgggctggaagaaatattcgacgattctctgaaaacgtttacggcgctatcccaaataaa 1747
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 62 tgggctggaagaaatattcgacgattctctgaaaacgtttacggcgctatcccaaataaa 121
Query: 1748 cctctctggaaacaaaattaaaactataagtagcaaagtattttccagatcccccaaatt 1807
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 122 cctctctggaaacaaaattaaaactataagtagcaaagtattttcgagatcccccaaatt 181
Query: 1808 gattgatattaatttgtcttataatcaaattacttctctggacagcaaagtttttgagaa 1867
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 182 gattgatattaatttgtcttataatcaaattacttctctggacagcaaagtttttgagaa 241
Query: 1868 aaacagcgatttaggaaaattaaaccttcaaggaaaccctctaaaagttctttctactga 1927
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 242 aaacagcgatttaggaaaattaaaccttcaaggaaaccctctaaaagttctttctactga 301
Query: 1928 aatatttagttatacaccaatactgacttggttagatatgagtcatgcggagctgactgc 1987
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 302 aatatttagttatacaccaatactgacttggttagatatgagtcatgcggagctgactgc 361
Query: 1988 tctttggaaggtagaaaagactcaaccagcaacgctgctcaacaacttaaatttcctgaa 2047
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 362 tctttggaaggtagaaaagactcaaccagcaacgctgctcaacaacttaaatttcctgaa 421
Query: 2048 cgtttcatataaccgcatcactgagatcaagcaaaccgaattagacacgcttaacaaatt 2107
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 422 cgtttcatataaccgcattactgagatcaagcaaaccgaattagacacgcttaacaaatt 481
Query: 2108 acgcacacttgatataagtaacaatttacttgcttgtagccgggacttcgaaaacctcat 2167
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 482 acgcacacttgatataagtaacaatttacttgcttgtagccgggacttcgaaaacctcat 541
Query: 2168 gtcttggttgagccaacataaggtgtcccctaattccaacacggccagcattgctaactt 2227
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 542 gtcttggttgagccaacataaggtgtcccctaattccaacacagccagcattgctaactt 601
Query: 2228 agctaaggatacaaaagatgaagagactaactatagttgggaattcctgtcacgaaaaac 2287
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 602 agctaaggatacaaaagatgaagagactaactatagttgggaattcctgtcacgaaaaac 661
Query: 2288 atgtggaacagcaatgccacagccagtcgaacccttgccatccgtgtccgatgaagaaat 2347
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 662 atgtggaacagcaatgccacacccagtcgaacccttgccatccgtgtccgatgaagaaat 721
Query: 2348 ttgggaaagaatcgacaaagatgctgagggtaacttcgatttgaaggacacccttgatga 2407
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 722 ttgggaaagaatcgacaaagatgctgagggtaacttcgatttgaaggacacccttgatga 781
Query: 2408 tggcaagatagccgatgatactaaactaacaaatgatgaatcaaacgaaaagatcgatga 2467
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 782 tggcaagatagccgatgatactaaactaacaaatgatgaatcaaacgaaaagatcgatga 841
Query: 2468 cgacaacgcagacaatgacgccgatgatgaagatgaagacggggaagatgatgacgatga 2527
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 842 cgacaacgcagacaatgacgccgatgatgaagatgaagacggggaagatgatgacgatga 901
Query: 2528 cgagacaggagaagattatgatgataatgatgataatctcgatcttaaagtcaatttgat 2587
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 902 cgagacaggagaagattatgatgataatgatgataatctcgatcttaaagtcaatttgat 961
Query: 2588 tgacaaaacggtctctcagtctacggctaaacctacagcttcatctcaaaaggacaaggt 2647
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 962 tgacaaaacggtctctcagtctacggctaaacctacagcttcatctcaaaaggacaaggt 1021
Query: 2648 ggatattgcaatcaaacttctggaaaacgacagcgtctacgatgacctggaacctgaagt 2707
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1022 ggatattgcaatcaaacttctggaaaacgacagcgtctacgatgacctggaacctgaagt 1081
Query: 2708 atatgttcaagaatcaatgaaagatcaagaacacggccgttatgagtatctgtggccgat 2767
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1082 atatgttcaagaatcaatgaaagatcaagaacacggccgttatgagtatctgtggccgat 1141
Query: 2768 gttgatcgctattttgggagcgctacttcttttgattgtcctcggaaaggtcgtcatgat 2827
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1142 gttgatcgctattttgggagcgctacttcttttgattgtcctcggaaaggtcgtcatgat 1201
Query: 2828 gatatgccagagaaggaacaagcaaataagatacaacagtgccataatcgccgccatgag 2887
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1202 gatatgccagagaaggaacaagcaaataagatacaacagtgccataatcgccgccatgag 1261
Query: 2888 caatgctggtcgcacaaagaaggactgcggtctcgtttaccagcagctatcagaggaatt 2947
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1262 caatgctggtcgcacaaagaaggactgcggtctcgtttaccagcagctatcagaggaatt 1321
Query: 2948 aacaggacctacgacacctaaactcaaccgctatgcaccgttgcacaacgttacagtgaa 3007
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1322 aacaggacctacgacacctaaactcaaccgctatgcaccgttgcacaacgttacagtgaa 1381
Query: 3008 cgcatctaacatgtcctacgaaagcagtcctttccaccacagcaacattgtgccagaggc 3067
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1382 cgcatctaacatgtcctacgaaagcagtcctttccaccacagcaacattgtgccagaggc 1441
Query: 3068 tgtgtgactggaccgcacaaaacaaacatcatttaattattaacataacaactgcgttaa 3127
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1442 tgtgtgactggaccgcacaaaacaaacatcatttaattattaacataacaactgcgttaa 1501
Query: 3128 cttttatataagcagtaagtgatagatgttagcgctagtcagagctacctacatattgta 3187
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1502 cttttatataagcagtaagtgatagatgttagcgctagtcagagctacctacatattgta 1561
Query: 3188 ccaaatttgtgcatcttttaagtgccttcaaacaattttcgaatactatcgcgtccgaat 3247
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1562 ccaaatttgtgcatcttttaagtgccttcaaacaattttcgaatactatcgcgtccgaat 1621
Query: 3248 cctcatatctagcgcttgtcttatgattttaagaagaaagtaacaaatggaagtcaaatt 3307
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1622 cctcatatctagcgcttgtcttatgattttaagaagaaagtaacaaatggaagtcaaatt 1681
Query: 3308 ttcaacaaattaatgtaagatatacataattatatattatacaaattagttgataggtat 3367
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1682 ttcaacaaattaatgtaagatatacataattatatattatacaaattagttgataggtat 1741
Query: 3368 tattttatgtacttaaaattaataaagataaaacattaattgt 3410
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1742 tattttatgtacttaaaattaataaagataaaacattaattgt 1784
>BF01028A1A09
Length = 756
Score = 1261 bits (636), Expect = 0.0
Identities = 648/652 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 486 agagttcgctacgatatgggggctaagtcccaggagttagtcctgctcctggcagtatgt 545
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 105 agagttcgctacgatatgggggctaagtcccaggagttagtcctgctcctggcagtatgt 164
Query: 546 gctcttgcaatctgcgagactgtcaacaaaactgcgaagaaagataacaaagatgcagac 605
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 165 gctcttgcaatctgcgagactgtcaacaaaactgcgaagaaagataacaaagatgcagac 224
Query: 606 aatttcctcttccaatatgaagattatgattcatcagataaccaggaagtcctgtttaac 665
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 225 aatttcctcttccaatatgaagattatgattcatcagataaccaggaagtcctgtttaac 284
Query: 666 gaagacaggccctgccctagagactgtctatgcactgtatctcaaggatatagaacagct 725
||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 285 gaagacaggccttgccctagagattgtctatgcactgtatctcaaggatatagaacagct 344
Query: 726 aagtgtaatcgtctagaactaggaacacaaaagtttggagacgacataaccgaccttgtc 785
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 345 aagtgtaatcgtctagaactaggaacacagaagtttggagacgacataaccgaccttgtc 404
Query: 786 atagaaaacgcggatccaaactctcctataacattggatgattttattttcaaaaaatta 845
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 405 atagaaaacgcggatccaaactctcctataacattggatgattttattttcaaaaaatta 464
Query: 846 ggtttgcatcaaattgcaactatcaaaattgtaaacagcaccatcacatcagttggggct 905
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 465 ggtttgcatcaaattgcaactatcaaaattgtaaacagcaccatcacatcagttggggct 524
Query: 906 aatgctttccacggacttcacgaactttacgcagtaaacctgtccaataataaactaaaa 965
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 525 aatgctttccacggacttcacgaactttacgcagtaaacctgtccaataataaactaaaa 584
Query: 966 agcattcactcagaaacgtttgcaaataataaaaaattattactgctaacactttctaac 1025
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 585 agcattcactcagaaacgtttgcaaataataaaaaattattactgctaacactttctaac 644
Query: 1026 aacccacttaagtttcctgcacctggctcacaagaatattttctaaatgcttcatccgtt 1085
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 645 aacccacttaagtttcctgcacctggctcacaagaatattttctaaatgcttcatccgta 704
Query: 1086 caagaatttgatatttcatattgcaacatgcaatacctaacagcgaatacga 1137
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 705 caagaatttgatatttcatattgcaacatgcaatacctaacagcgaatacga 756
Database: est
Posted date: Jul 14, 2011 2:25 PM
Number of letters in database: 8,280,457
Number of sequences in database: 9484
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Sequences: 9484
Number of Hits to DB: 396,001
Number of extensions: 7322
Number of successful extensions: 7322
Number of sequences better than 1.0e-10: 2
Number of HSP's gapped: 7322
Number of HSP's successfully gapped: 2
Length of query: 3574
Length of database: 8,280,457
Length adjustment: 18
Effective length of query: 3556
Effective length of database: 8,109,745
Effective search space: 28838253220
Effective search space used: 28838253220
X1: 11 (21.8 bits)
X2: 15 (29.7 bits)
X3: 50 (99.1 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 35 (69.9 bits)