BLASTN 2.2.24 [Aug-08-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= DPGLEAN11922 (UTR included)
(4744 letters)
Database: est
9484 sequences; 8,280,457 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
BF14_1224_C1 2450 0.0
BF01009A1H09 1433 0.0
BF01022B1A02 268 7e-71
>BF14_1224_C1
Length = 1268
Score = 2450 bits (1236), Expect = 0.0
Identities = 1260/1268 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3035 acttttacacagtgctccacagtatacatttagaatcaaacctgatgacataaaagctat 3094
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Query: 4055 gagtcagaaatctagcgaggaagttcgtactggaagtgatattcagcacttaccagacgg 4114
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Query: 4115 tggtattgcgcagaccactacaacaacaaccataaaaaaaattggaaaatcagccaaaac 4174
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Sbjct: 1081 tggtattgcgcagaccactacaacaacaaccataaaaaaaattggaaaatcagccaaaac 1140
Query: 4175 agcgaatgctacgaccacagtcactcgaaccaatactgttgtaactgcacgcgatgtcgg 4234
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Sbjct: 1141 agcgaatgctacgaccacagtcactcgaaccaatactgttgtaactgcacgcgatgtcgg 1200
Query: 4235 cgctaaatgattgaaatatttaacatagcgattaaacatacgacgggtcttatatgctta 4294
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Sbjct: 1201 cgctaaatgattgaaatatttaacatagcgattaaacatacgacgggtcttatatgctta 1260
Query: 4295 taagcctg 4302
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Sbjct: 1261 taagcctg 1268
>BF01009A1H09
Length = 753
Score = 1433 bits (723), Expect = 0.0
Identities = 744/753 (98%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1842 tcattagatagtacaccaaaatttaccatggcaggcagaggttcttctccgaaaattgaa 1901
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Sbjct: 1 tcattagatagtacaccaaaatttaccatggcaggcagaggttcttctccgaaaattgaa 60
Query: 1902 gatgtgccggctcctaatgcatactgccctgataaagctgacaaacttcttcacgactct 1961
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Sbjct: 61 gatgtgccggctcctaatgcatactgccctgataaagctgacaaacttcttcacgactct 120
Query: 1962 tctcctgcttatacgttaagacctaaaattttggaggggaaactcagtgacactccagca 2021
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Sbjct: 121 tctcctgcttatacgttaagacctaaaattttggaggggaaactcagtgacactccagca 180
Query: 2022 cctaatgcatatgaacctcgtcttaaagatgatgctccaaaatatagcttgtatggaaaa 2081
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Sbjct: 181 cctaatgcatatgaacctcgtcttaaagatgatgctccaaaatatagcttgtatggaaaa 240
Query: 2082 ggacatgatattaagccatctgatactcctggacctaacgtctatgagccgcgcttactt 2141
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Query: 2142 gataatactcctaaatactctttaacagggaaaggtcacgatgccaaaatattcaataca 2201
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Sbjct: 301 gataatactcctaaatactctttaacagggaaaggtcacgatgccaaagtattcaataca 360
Query: 2202 cctggacctaattgttacgatcctcatttaccttcaaactcgccaagattcactatgtca 2261
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Query: 2262 gggaaaggtccagatgaaaaatttcctgatgttcctgctccaaactcctataatgcttct 2321
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Sbjct: 421 gggaaaggtccagatgaaaaatttcctgatgttcctgctccaaactcctataatgcttct 480
Query: 2322 ttacctaataatgcacctaaattcacgataagtggaaaaggttatgatcccaaaatgttt 2381
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Query: 2382 attactcctggacctgattgttatgatccacatttacctcaaaatagtccaagatataca 2441
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Query: 2442 atgggtggtaaaagtaatgacccaaaatgttttgaagtcccagcacctaatgcatacgat 2501
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Sbjct: 601 atgggtggtaaaagtaatgacccaaaatgttttgaagtcccagcacctaatgcatacgat 660
Query: 2502 ccacatattataaatgaatctcctaaatatacaatgtgtggaaagggacaccccgataaa 2561
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Query: 2562 ataattgacacacctgctcctaatgcctatgat 2594
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Sbjct: 721 ataattgacacacctgctcctaatgcctatgat 753
>BF01022B1A02
Length = 802
Score = 268 bits (135), Expect = 7e-71
Identities = 135/135 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 440 aggtaaacctccgccggaatctagaaagactagagcaccagcgttcacgtttggacagaa 499
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Sbjct: 305 aggtaaacctccgccggaatctagaaagactagagcaccagcgttcacgtttggacagaa 364
Query: 500 attggaagctgcgggtaaggataagagtggccccggtcccgcttcttacaacacggaagg 559
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Sbjct: 365 attggaagctgcgggtaaggataagagtggccccggtcccgcttcttacaacacggaagg 424
Query: 560 catgacagctaaagg 574
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Sbjct: 425 catgacagctaaagg 439
Database: est
Posted date: Jul 14, 2011 2:25 PM
Number of letters in database: 8,280,457
Number of sequences in database: 9484
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Sequences: 9484
Number of Hits to DB: 533,998
Number of extensions: 9551
Number of successful extensions: 9551
Number of sequences better than 1.0e-10: 3
Number of HSP's gapped: 9539
Number of HSP's successfully gapped: 3
Length of query: 4744
Length of database: 8,280,457
Length adjustment: 18
Effective length of query: 4726
Effective length of database: 8,109,745
Effective search space: 38326654870
Effective search space used: 38326654870
X1: 11 (21.8 bits)
X2: 15 (29.7 bits)
X3: 50 (99.1 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 35 (69.9 bits)