BLASTN 2.2.24 [Aug-08-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= DPGLEAN12208 (UTR included)
(2308 letters)
Database: est
9484 sequences; 8,280,457 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
BF14_2127_C1 3027 0.0
BF01047B1A04 353 8e-97
>BF14_2127_C1
Length = 1562
Score = 3027 bits (1527), Expect = 0.0
Identities = 1555/1563 (99%), Gaps = 1/1563 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 502 tgtgtataccttcaataaattcattttttagccaatggaggctatggattcgtccaatgt 561
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Sbjct: 1 tgtgtataccttcaataaattcattttttagccaatggaggctatggattcgtccaatgt 60
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Sbjct: 61 ttatagctacttatgttctattagtcataatattagtaccgctgttgatagttcattcga 120
Query: 622 taaataatggttttacaaagtcagaccaaagcactttgataggaggaggctttgttcttc 681
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Sbjct: 121 taaataatggttttacaaagtcagaccaaagcactttgataggaggaggctttgttcttc 180
Query: 682 tagctgtgcctatctcaatatggcagatcactcaacacatagttcactatacaaaaccat 741
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Sbjct: 181 tagctgtgcctatctcaatatggcagatcactcaacacatagttcactatacaaaaccat 240
Query: 742 ctttacagaaacatattattaggatattatggatggtaccaatctatgctttgaatgcat 801
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Sbjct: 241 ctttacagaaacatattattaggatattatggatggtaccaatctacgctttgaatgcat 300
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Sbjct: 301 ggataggattagaatttccagagcaatctatttatatggatgcattaagagagtgttacg 360
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Sbjct: 361 aggcttatgttatatacaactttatgaagtatttatttaactacctcaacgatggtcaag 420
Query: 922 atctggaggcattattggagaccaaacctcaagttaatcatatatttccactatgctgtt 981
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Sbjct: 421 atctggaggcattattggagaccaaacctcaagttaatcatatatttccactatgctgtt 480
Query: 982 taacaccatgggagatgggaagtgagtttgttcacaactgtaaacatggcattcttcaat 1041
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Sbjct: 481 taacaccatgggagatgggaagtgagtttgttcacaactgtaaacatggcattcttcaat 540
Query: 1042 ataccctaataaggcctctaacaaccgtcatatcaatcatatgcgacctttgcggagttt 1101
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Sbjct: 541 ataccctaataaggcctctaacaaccgtcatatcaatcatatgcgacctttgcggagttt 600
Query: 1102 atggagagagtgatttcagtcctaatgtggctttcccatatataatagccatcaataatt 1161
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Sbjct: 601 atggagagagtgatttcagtcctaatgtggctttcccgtatataatagccatcaataatt 660
Query: 1162 tgtcacagttcgtagctatgtactgtttggtattgttctatcgggcaaatcgtgccgagt 1221
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Query: 1222 taaaaccaatgaaacccattggcaaatttttatgtataaaagctgttgtcttcttctcgt 1281
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Sbjct: 721 taaaaccaatgaaacccattggcaaatttttatgtataaaagctgttgtcttcttctcgt 780
Query: 1282 ttttccaaggagttattatcaatatactggtatactgtggagtgatatctactatatttg 1341
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Sbjct: 781 ttttccaaggagttattatcaatatactggtatactgtggagtgatatctactatatttg 840
Query: 1342 atatatcagacaatgacaaaataaaaattatatcgtcaaaactacaggattttcttattt 1401
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Sbjct: 841 atatatcagacaatgacaaaataaaaattatatcgtcaaaactacaggattttcttattt 900
Query: 1402 gcattgagatgttcttagcggctatcgcacatcactatagcttctcatataagccgtaca 1461
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Sbjct: 901 gcattgagatgttcttagcggctatcgcacatcactatagcttctcatataagccgtaca 960
Query: 1462 tatcaccattggctccgacaaattcctgtcttggttctttcctggctatgtgggatgtgt 1521
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Sbjct: 961 tatcaccattggctccgacaaattcctgtcttggttctttcctggctatgtgggatgtgt 1020
Query: 1522 ctgatgtgaagagagatatatcggaacatttgggtgttgttgggagttcatttagtagac 1581
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Sbjct: 1021 ctgatgtgaagagagatatatcggaacatttgggtgttgttgggagttcatttagtagac 1080
Query: 1582 gatggcgtggcaaatctatgtatcatatggccagaggatatgatgaaagttctagactaa 1641
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Sbjct: 1081 gatggcgtggcaaatctatgtatcatatggccagaggatatgatgaaagttctagactaa 1140
Query: 1642 acgaaccaactgccagttcggcaccaaatatatcagttgagagtgtggaaccaactgttg 1701
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Sbjct: 1141 acgaaccaactgccagttcggcaccaaatatatcagttgagagtgtggaaccaactgttg 1200
Query: 1702 aagtaaggacatctgtgtacggatccctagagaacactatgacgacgggttcattgacct 1761
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Sbjct: 1201 aagtaaggacatctgtgtacggatccctagagaacactatgacgacgggttcattgacct 1260
Query: 1762 ccgaaacagaacctttgatacggaacgattcggaccccaatgtctaatttctgtattaag 1821
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Sbjct: 1261 ccgaaacagaacctttgatacggaacgattcggaccccaatgtctaatttctgtattaag 1320
Query: 1822 tattacaaaatataaatcataaagcttaaaagttatctctaagacaagatttgatcataa 1881
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Sbjct: 1321 tattacaaaatataaatcataaagctt-aaagttatctctaagacaagatttgatcataa 1379
Query: 1882 gtacttaaaaggatgctttcttgttttaaattatatcgaactacttattatataactctt 1941
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Sbjct: 1380 gtacttaaaaggatgctttcttgtttaaaattatgtcgaactacttattatataactctt 1439
Query: 1942 atatatactacacggattaaattcgatattcgccgtaatacaaattattgaatagttagg 2001
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Sbjct: 1440 atatatactacacggattaaattcgatattcgccgtaatacaaattattgaatagttagg 1499
Query: 2002 aaatattcaaaataaatattaatatgctttctgtcgaacaagcctgttggacgtttcctt 2061
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Sbjct: 1500 aaatattcaaaataaatattaatatgctttctgtcgaacaagcctgttgaacgtttcctt 1559
Query: 2062 cta 2064
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Sbjct: 1560 cta 1562
>BF01047B1A04
Length = 776
Score = 353 bits (178), Expect = 8e-97
Identities = 178/178 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1387 aggattttcttatttgcattgagatgttcttagcggctatcgcacatcactatagcttct 1446
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Sbjct: 260 aggattttcttatttgcattgagatgttcttagcggctatcgcacatcactatagcttct 319
Query: 1447 catataagccgtacatatcaccattggctccgacaaattcctgtcttggttctttcctgg 1506
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Sbjct: 320 catataagccgtacatatcaccattggctccgacaaattcctgtcttggttctttcctgg 379
Query: 1507 ctatgtgggatgtgtctgatgtgaagagagatatatcggaacatttgggtgttgttgg 1564
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Sbjct: 380 ctatgtgggatgtgtctgatgtgaagagagatatatcggaacatttgggtgttgttgg 437
Score = 230 bits (116), Expect = 8e-60
Identities = 116/116 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1563 gggagttcatttagtagacgatggcgtggcaaatctatgtatcatatggccagaggatat 1622
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Sbjct: 661 gggagttcatttagtagacgatggcgtggcaaatctatgtatcatatggccagaggatat 720
Query: 1623 gatgaaagttctagactaaacgaaccaactgccagttcggcaccaaatatatcagt 1678
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Sbjct: 721 gatgaaagttctagactaaacgaaccaactgccagttcggcaccaaatatatcagt 776
Score = 206 bits (104), Expect = 1e-52
Identities = 104/104 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1286 ccaaggagttattatcaatatactggtatactgtggagtgatatctactatatttgatat 1345
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Sbjct: 5 ccaaggagttattatcaatatactggtatactgtggagtgatatctactatatttgatat 64
Query: 1346 atcagacaatgacaaaataaaaattatatcgtcaaaactacagg 1389
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Sbjct: 65 atcagacaatgacaaaataaaaattatatcgtcaaaactacagg 108
Database: est
Posted date: Jul 14, 2011 2:25 PM
Number of letters in database: 8,280,457
Number of sequences in database: 9484
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Sequences: 9484
Number of Hits to DB: 384,519
Number of extensions: 9793
Number of successful extensions: 9793
Number of sequences better than 1.0e-10: 2
Number of HSP's gapped: 9792
Number of HSP's successfully gapped: 4
Length of query: 2308
Length of database: 8,280,457
Length adjustment: 17
Effective length of query: 2291
Effective length of database: 8,119,229
Effective search space: 18601153639
Effective search space used: 18601153639
X1: 11 (21.8 bits)
X2: 15 (29.7 bits)
X3: 50 (99.1 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 34 (67.9 bits)