BLASTN 2.2.24 [Aug-08-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= DPGLEAN12209 (UTR included)
(1549 letters)
Database: est
9484 sequences; 8,280,457 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
BF14_612_C1 2940 0.0
BF14_612_C2 1219 0.0
BF01023A1D06 466 e-131
>BF14_612_C1
Length = 1638
Score = 2940 bits (1483), Expect = 0.0
Identities = 1526/1539 (99%), Gaps = 1/1539 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 ttaaataacaatagagtcaaaatcgttgtttaaaacaactggtactattcgaacgcaaac 60
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Query: 900 caggttggtgatactttatgggtagaagtgacagtggaatcagaagtgacaatggctcta 959
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Query: 1020 acgccaccacaagatgaccaaatgtgttgatataaaatattttattgttattatcagcta 1079
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Query: 1080 cttactttatatttatgacaacatgatttttttaaatttttttgactgtagctgttttta 1139
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Query: 1140 atgaaatgagacttaataaacaatgacgaatgtacaaatgctataaaaatacttggacca 1199
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Query: 1200 gtttaatacttggatgacttttatattctgagtagtttttttttctatttaattgaatat 1259
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Sbjct: 1300 gttgaatacttggatgacttttatattctgagtagtttttttttctatttaattgaatat 1359
Query: 1260 gaaatgatacaattattgaacaggttccaaggactgttacatagctgtaaggaatatatt 1319
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Sbjct: 1360 gaaatgatacaattattgaacaggttccaaggactgttacatagctgtaaggaatctatt 1419
Query: 1320 tgttattgttaaagatttacaaaatgtataagaaaacaattttattagcatcatcctaga 1379
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Sbjct: 1420 tgttattgttaaagatttacaaaatgtataagaaaacaattttattagcatcatcctaga 1479
Query: 1380 tataaattatgttgtagaattgggttttattttgtagaatgtattttaagtgaacagtgt 1439
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Query: 1440 cagcgtaagtttaattttatatataataaaatcaatatttaattttcctgtcatcttaat 1499
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Query: 1500 caagcaataattttttcatggaacatttttgattttaat 1538
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Sbjct: 1600 caagcaataattttttcatggaacatttttgattttaat 1638
>BF14_612_C2
Length = 832
Score = 1219 bits (615), Expect = 0.0
Identities = 615/615 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 68 caacattgcaacagcgtgtaggtcgaatttaattaagaagtaataataataataataatc 127
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Sbjct: 1 caacattgcaacagcgtgtaggtcgaatttaattaagaagtaataataataataataatc 60
Query: 128 agaagtgacagaatgccatcattcagaatatattttgtattaaataatgtaatttagtaa 187
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Sbjct: 61 agaagtgacagaatgccatcattcagaatatattttgtattaaataatgtaatttagtaa 120
Query: 188 ttaataatttgttcggtcacctttttttttaaataacattagtaatacttttaaaagtga 247
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Sbjct: 121 ttaataatttgttcggtcacctttttttttaaataacattagtaatacttttaaaagtga 180
Query: 248 caataaaaataacttttgttacttccattatattattgaatgaagtcagctgacgaatat 307
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Sbjct: 181 caataaaaataacttttgttacttccattatattattgaatgaagtcagctgacgaatat 240
Query: 308 aaacaaagggaatgttcataaccaagtcctgagacttactgaaagtgtctgtgatttaga 367
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Query: 368 tataagagagatggatattgacggttcatcttcggccggagagctcggccccaatcatgg 427
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Query: 428 agaaatagatcaaaatctacttctcctatttagctgtatgaatacaacagatagagaaga 487
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Sbjct: 361 agaaatagatcaaaatctacttctcctatttagctgtatgaatacaacagatagagaaga 420
Query: 488 acttataggtcaaatgcaaagattattagggccaagtttaacttacaatacagctagttt 547
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Sbjct: 421 acttataggtcaaatgcaaagattattagggccaagtttaacttacaatacagctagttt 480
Query: 548 tttcttggatatgagtaattggaatttacaagctgcaatatgttgttatttagattatag 607
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Query: 608 tctacctcctaaacctccatctatgtcattgaaggctgctcaagttcaagaatctgttgt 667
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Query: 668 aggacctggaacttt 682
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Sbjct: 601 aggacctggaacttt 615
>BF01023A1D06
Length = 331
Score = 466 bits (235), Expect = e-131
Identities = 307/331 (92%), Gaps = 2/331 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 819 aacattaccatgaagttaaaagcccccagtgttgccggcgttcatagaggcttcttccat 878
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Sbjct: 1 aacattaccatgaagttaaaagcccccnatgttgccggcgttcatagaggcttcttccat 60
Query: 879 ttggta-acagacaaaggagaccaggttggtgatactttatgggtagaagtgacagtgga 937
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Sbjct: 61 ttggtagacngacgaaggagaccatgttggtgatactttatgggaagaagtgacagtgga 120
Query: 938 atcagaagtgacaatggctctagccgaacaattagccgctctaccaataccaa-gcagta 996
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Sbjct: 121 atcagaagtgacaatggctctagccgaacaattagccgctctaccaataccaannnnnnn 180
Query: 997 gattggaagattcagtttcacagacgccaccacaagatgaccaaatgtgttgatataaaa 1056
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Sbjct: 181 gattggaagattcactttcacagacgccaccacaagatgaccaaatgtgttgatataaaa 240
Query: 1057 tattttattgttattatcagctacttactttatatttatgacaacatgatttttttaaat 1116
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Sbjct: 241 tattttattgttattatcagctacttactttatattgatgacgacatgaatgtgtttaat 300
Query: 1117 ttttttgactgtagctgtttttaatgaaatg 1147
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Sbjct: 301 ttctttgactgtaattgtttttaatgaaatg 331
Database: est
Posted date: Jul 14, 2011 2:25 PM
Number of letters in database: 8,280,457
Number of sequences in database: 9484
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Sequences: 9484
Number of Hits to DB: 273,704
Number of extensions: 6994
Number of successful extensions: 6994
Number of sequences better than 1.0e-10: 3
Number of HSP's gapped: 6982
Number of HSP's successfully gapped: 4
Length of query: 1549
Length of database: 8,280,457
Length adjustment: 17
Effective length of query: 1532
Effective length of database: 8,119,229
Effective search space: 12438658828
Effective search space used: 12438658828
X1: 11 (21.8 bits)
X2: 15 (29.7 bits)
X3: 50 (99.1 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 34 (67.9 bits)