BLASTN 2.2.24 [Aug-08-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= DPGLEAN14572 (UTR included)
(3457 letters)
Database: est
9484 sequences; 8,280,457 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
BF01031B2D11 1051 0.0
BF14_904_C1 789 0.0
BF14_2805_C1 94 2e-18
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BF01022A1E12 76 4e-13
BF01014B1E09 74 2e-12
BF01057B2A11 72 7e-12
>BF01031B2D11
Length = 715
Score = 1051 bits (530), Expect = 0.0
Identities = 533/534 (99%)
Strand = Plus / Plus
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Query: 2154 ggtaatggaccacaaggatacccaacaaatccccaagcaccatctcaaaattatcaagga 2213
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Query: 2214 aacatgggacataatccccaaacatatcaaaatgtacctggacaaccacctcaaggttac 2273
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Query: 2274 caagtgaatacaacatcttcgtctcaagtgtgtcaacctaacattgctcaatcaccaaga 2333
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Query: 2334 aactatcagcccgcacaatctcctaactatggagccaataatgccctgtccccgccaggc 2393
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Sbjct: 542 aactatcagcctgcacaatctcctaactatggagccaataatgccctgtccccgccaggc 601
Query: 2394 tacagacaagttcaaccacaatcgccacctgtgcaacaagtccatcctgctatgcagtat 2453
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Sbjct: 602 tacagacaagttcaaccacaatcgccacctgtgcaacaagtccatcctgctatgcagtat 661
Query: 2454 catcactcccaacaaatgcagcaagtacatcaagtccaataccagcagcaacaa 2507
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Sbjct: 662 catcactcccaacaaatgcagcaagtacatcaagtccaataccagcagcaacaa 715
>BF14_904_C1
Length = 898
Score = 789 bits (398), Expect = 0.0
Identities = 401/402 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3056 atgacaatcaaactcagatcatgaccagggagatgaattacaatatattacataaaatac 3115
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Query: 3116 tgtattttctgatagatattagcaatatttattgcacaaaaatatgagtgccttgttaat 3175
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Query: 3236 ctttaaaacttgtaataatctctcggtattcatgatcatgtttacatacatttttttaaa 3295
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Sbjct: 181 ctttaaaacttgtaataatctctcggtattcatgatcatgtttacatacatttttttaaa 240
Query: 3296 acaaattccattatgttgcattacttgatgtgagacgttatatttaattatactgtgtac 3355
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Query: 3356 ttttggtaatgtaaaaagttgtttataattttcacttgttttattgcaatgtacaagtta 3415
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Query: 3416 ttcctatctatcaattagtgtattaaatagaatttagtgagt 3457
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Sbjct: 361 ttcctatctatcaattagtgtattaaatagaatttagtgagt 402
>BF14_2805_C1
Length = 816
Score = 93.7 bits (47), Expect = 2e-18
Identities = 93/107 (86%), Gaps = 6/107 (5%)
Strand = Plus / Plus
Query: 2541 caacatcagcaacagcaacaacaccagcagcagcagcaacaacaacatcagcagcagcag 2600
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Query: 2601 caacatcaacagcaacaacaccagcagcagcagcatcagcaacaaca 2647
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Sbjct: 415 caa---caacagcaacaccaacagcaacatcatcaacagcaacaaca 458
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Identities = 65/72 (90%)
Strand = Plus / Plus
Query: 2540 gcaacatcagcaacagcaacaacaccagcagcagcagcaacaacaacatcagcagcagca 2599
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Sbjct: 330 gcaacatcagcaacaacaacaacaacaacaacatcagcaacaacaacaacagcagcagca 389
Query: 2600 gcaacatcaaca 2611
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Sbjct: 390 gcaacaacaaca 401
Score = 73.8 bits (37), Expect = 2e-12
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Query: 2589 cagcagcagcagcaacatcaacagcaacaacaccagcagcagcagcatcagcaacaacat 2648
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Sbjct: 292 cagcaacagcagcaacatcaacagcaacatcaacagcagcaacatcagcaacaacaacaa 351
Query: 2649 caacaacaa 2657
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Sbjct: 352 caacaacaa 360
Score = 71.9 bits (36), Expect = 7e-12
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Strand = Plus / Plus
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Sbjct: 385 cagcagcaacaacaacatcagcagcagcatcaacaacagcaacaccaacagcaacatcat 444
Query: 2607 caacagcaacaacaccagca 2626
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Sbjct: 445 caacagcaacaacaacagca 464
Score = 69.9 bits (35), Expect = 3e-11
Identities = 92/111 (82%)
Strand = Plus / Plus
Query: 2540 gcaacatcagcaacagcaacaacaccagcagcagcagcaacaacaacatcagcagcagca 2599
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Sbjct: 294 gcaacagcagcaacatcaacagcaacatcaacagcagcaacatcagcaacaacaacaaca 353
Query: 2600 gcaacatcaacagcaacaacaccagcagcagcagcatcagcaacaacatca 2650
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Sbjct: 354 acaacaacatcagcaacaacaacaacagcagcagcagcaacaacaacatca 404
>BF01045B2F10
Length = 783
Score = 85.7 bits (43), Expect = 4e-16
Identities = 92/107 (85%), Gaps = 6/107 (5%)
Strand = Plus / Plus
Query: 2541 caacatcagcaacagcaacaacaccagcagcagcagcaacaacaacatcagcagcagcag 2600
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Sbjct: 598 caacatcagcaa---caacaacaacagcagcagcagcaacaacaacatcagcagcaacat 654
Query: 2601 caacatcaacagcaacaacaccagcagcagcagcatcagcaacaaca 2647
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Sbjct: 655 caa---caacagcaacaccaacagcaacatcatcaacagcaacaaca 698
Score = 73.8 bits (37), Expect = 2e-12
Identities = 61/69 (88%)
Strand = Plus / Plus
Query: 2589 cagcagcagcagcaacatcaacagcaacaacaccagcagcagcagcatcagcaacaacat 2648
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Query: 2649 caacaacaa 2657
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Sbjct: 589 caacaacaa 597
Score = 69.9 bits (35), Expect = 3e-11
Identities = 80/95 (84%)
Strand = Plus / Plus
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Query: 2610 cagcaacaacaccagcagcagcagcatcagcaaca 2644
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Sbjct: 607 caacaacaacaacagcagcagcagcaacaacaaca 641
Score = 69.9 bits (35), Expect = 3e-11
Identities = 89/107 (83%)
Strand = Plus / Plus
Query: 2550 caacagcaacaacaccagcagcagcagcaacaacaacatcagcagcagcagcaacatcaa 2609
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Sbjct: 583 caacaacaacaacaacaacatcagcaacaacaacaacagcagcagcagcaacaacaacat 642
Query: 2610 cagcaacaacaccagcagcagcagcatcagcaacaacatcaacaaca 2656
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Sbjct: 643 cagcagcaacatcaacaacagcaacaccaacagcaacatcatcaaca 689
>BF01022A1E12
Length = 657
Score = 75.8 bits (38), Expect = 4e-13
Identities = 68/78 (87%)
Strand = Plus / Plus
Query: 2541 caacatcagcaacagcaacaacaccagcagcagcagcaacaacaacatcagcagcagcag 2600
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Sbjct: 181 caacagcagcagcagcagcaagcccagcagcagcagcaacaacaccagcagcagcagcag 240
Query: 2601 caacatcaacagcaacaa 2618
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Sbjct: 241 caacagcagcaacaacaa 258
>BF01014B1E09
Length = 866
Score = 73.8 bits (37), Expect = 2e-12
Identities = 52/57 (91%)
Strand = Plus / Plus
Query: 2589 cagcagcagcagcaacatcaacagcaacaacaccagcagcagcagcatcagcaacaa 2645
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Sbjct: 810 cagcagcagcagcaacagcagcaacaacaacagcagcagcagcagcagcagcaacaa 866
>BF01057B2A11
Length = 843
Score = 71.9 bits (36), Expect = 7e-12
Identities = 51/56 (91%)
Strand = Plus / Plus
Query: 2598 cagcaacatcaacagcaacaacaccagcagcagcagcatcagcaacaacatcaaca 2653
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Sbjct: 260 cagcaacaacaacagcaacaacaacagcagcagcagcagcaacaacaacaacaaca 315
Database: est
Posted date: Jul 14, 2011 2:25 PM
Number of letters in database: 8,280,457
Number of sequences in database: 9484
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Sequences: 9484
Number of Hits to DB: 380,740
Number of extensions: 8202
Number of successful extensions: 8202
Number of sequences better than 1.0e-10: 7
Number of HSP's gapped: 8176
Number of HSP's successfully gapped: 14
Length of query: 3457
Length of database: 8,280,457
Length adjustment: 18
Effective length of query: 3439
Effective length of database: 8,109,745
Effective search space: 27889413055
Effective search space used: 27889413055
X1: 11 (21.8 bits)
X2: 15 (29.7 bits)
X3: 50 (99.1 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 35 (69.9 bits)