BLASTN 2.2.24 [Aug-08-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= DPGLEAN14601 (UTR included)
(1453 letters)
Database: est
9484 sequences; 8,280,457 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
BF01019A1H08 98 5e-20
BF14_335_C4 82 3e-15
BF01033A1F05 76 2e-13
BF01010B1B03 76 2e-13
BF01049B1F01 76 2e-13
BF01040A1G09 74 7e-13
BF14_1626_C1 74 7e-13
BF01044A1E01 72 3e-12
BF01060A1A06 70 1e-11
BF01012A2F10 70 1e-11
BF01051B2F02 68 4e-11
>BF01019A1H08
Length = 504
Score = 97.6 bits (49), Expect = 5e-20
Identities = 87/99 (87%), Gaps = 3/99 (3%)
Strand = Plus / Minus
Query: 204 ccttaaacctacacctgggtcgcgagtcccaggtactgtcgaagctcctctccccgtaac 263
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Sbjct: 479 ccttaaacctacacctgggtcgcaactcccaggcactgttgaagctcctctccctgcaac 420
Query: 264 ---atggacctggtacccgcacggtgaatccatggaatg 299
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Sbjct: 419 gcgatggacccggcacccgcacggtgaatccattgaatg 381
>BF14_335_C4
Length = 1491
Score = 81.8 bits (41), Expect = 3e-15
Identities = 50/53 (94%)
Strand = Plus / Plus
Query: 204 ccttaaacctacacctgggtcgcgagtcccaggtactgtcgaagctcctctcc 256
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Sbjct: 1250 ccttaaacctacacctgggtcgcaagtcccaggcactgttgaagctcctctcc 1302
>BF01033A1F05
Length = 770
Score = 75.8 bits (38), Expect = 2e-13
Identities = 50/54 (92%)
Strand = Plus / Minus
Query: 369 tatatatatgtatgtatatatatacatacatatatatacatatatatatatatt 422
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Sbjct: 534 tatatatatatatatatatatatatatacatatatatatatatatatatatatt 481
Score = 73.8 bits (37), Expect = 7e-13
Identities = 49/53 (92%)
Strand = Plus / Minus
Query: 369 tatatatatgtatgtatatatatacatacatatatatacatatatatatatat 421
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Sbjct: 544 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatacatatatatatatat 492
Score = 73.8 bits (37), Expect = 7e-13
Identities = 49/53 (92%)
Strand = Plus / Plus
Query: 369 tatatatatgtatgtatatatatacatacatatatatacatatatatatatat 421
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Sbjct: 493 tatatatatatatgtatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 545
Score = 73.8 bits (37), Expect = 7e-13
Identities = 49/53 (92%)
Strand = Plus / Plus
Query: 369 tatatatatgtatgtatatatatacatacatatatatacatatatatatatat 421
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Sbjct: 497 tatatatatgtatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 549
Score = 69.9 bits (35), Expect = 1e-11
Identities = 50/55 (90%)
Strand = Plus / Plus
Query: 367 tgtatatatatgtatgtatatatatacatacatatatatacatatatatatatat 421
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Sbjct: 505 tgtatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 559
>BF01010B1B03
Length = 305
Score = 75.8 bits (38), Expect = 2e-13
Identities = 53/58 (91%)
Strand = Plus / Minus
Query: 369 tatatatatgtatgtatatatatacatacatatatatacatatatatatatattaatt 426
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Sbjct: 181 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatattaatt 124
>BF01049B1F01
Length = 840
Score = 75.8 bits (38), Expect = 2e-13
Identities = 50/54 (92%)
Strand = Plus / Minus
Query: 204 ccttaaacctacacctgggtcgcgagtcccaggtactgtcgaagctcctctccc 257
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Sbjct: 647 ccttacacctacacctgggtcgcaagtcccaggcactgttgaagctcctctccc 594
>BF01040A1G09
Length = 753
Score = 73.8 bits (37), Expect = 7e-13
Identities = 49/53 (92%)
Strand = Plus / Minus
Query: 369 tatatatatgtatgtatatatatacatacatatatatacatatatatatatat 421
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Sbjct: 635 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatacatatatatatatat 583
Score = 73.8 bits (37), Expect = 7e-13
Identities = 49/53 (92%)
Strand = Plus / Plus
Query: 369 tatatatatgtatgtatatatatacatacatatatatacatatatatatatat 421
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Sbjct: 584 tatatatatatatgtatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 636
Score = 73.8 bits (37), Expect = 7e-13
Identities = 49/53 (92%)
Strand = Plus / Plus
Query: 369 tatatatatgtatgtatatatatacatacatatatatacatatatatatatat 421
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Sbjct: 588 tatatatatgtatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 640
Score = 69.9 bits (35), Expect = 1e-11
Identities = 50/55 (90%)
Strand = Plus / Plus
Query: 367 tgtatatatatgtatgtatatatatacatacatatatatacatatatatatatat 421
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Sbjct: 596 tgtatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 650
>BF14_1626_C1
Length = 705
Score = 73.8 bits (37), Expect = 7e-13
Identities = 49/53 (92%)
Strand = Plus / Plus
Query: 369 tatatatatgtatgtatatatatacatacatatatatacatatatatatatat 421
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Sbjct: 640 tatatatatatatatatatatatatatacatatatatatatatatatatatat 692
Score = 73.8 bits (37), Expect = 7e-13
Identities = 49/53 (92%)
Strand = Plus / Plus
Query: 369 tatatatatgtatgtatatatatacatacatatatatacatatatatatatat 421
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Sbjct: 644 tatatatatatatatatatatatacatatatatatatatatatatatatatat 696
>BF01044A1E01
Length = 454
Score = 71.9 bits (36), Expect = 3e-12
Identities = 54/60 (90%)
Strand = Plus / Minus
Query: 369 tatatatatgtatgtatatatatacatacatatatatacatatatatatatattaattat 428
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Sbjct: 352 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatattgattat 293
>BF01060A1A06
Length = 737
Score = 69.9 bits (35), Expect = 1e-11
Identities = 50/55 (90%)
Strand = Plus / Plus
Query: 369 tatatatatgtatgtatatatatacatacatatatatacatatatatatatatta 423
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Sbjct: 651 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatta 705
>BF01012A2F10
Length = 722
Score = 69.9 bits (35), Expect = 1e-11
Identities = 50/55 (90%)
Strand = Plus / Minus
Query: 367 tgtatatatatgtatgtatatatatacatacatatatatacatatatatatatat 421
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Sbjct: 467 tgtatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 413
>BF01051B2F02
Length = 703
Score = 67.9 bits (34), Expect = 4e-11
Identities = 49/54 (90%)
Strand = Plus / Minus
Query: 369 tatatatatgtatgtatatatatacatacatatatatacatatatatatatatt 422
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Sbjct: 641 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatt 588
Database: est
Posted date: Jul 14, 2011 2:25 PM
Number of letters in database: 8,280,457
Number of sequences in database: 9484
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Sequences: 9484
Number of Hits to DB: 309,594
Number of extensions: 34406
Number of successful extensions: 34406
Number of sequences better than 1.0e-10: 12
Number of HSP's gapped: 34364
Number of HSP's successfully gapped: 20
Length of query: 1453
Length of database: 8,280,457
Length adjustment: 17
Effective length of query: 1436
Effective length of database: 8,119,229
Effective search space: 11659212844
Effective search space used: 11659212844
X1: 11 (21.8 bits)
X2: 15 (29.7 bits)
X3: 50 (99.1 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 34 (67.9 bits)