BLASTN 2.2.24 [Aug-08-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= DPGLEAN14622 (UTR included)
(1846 letters)
Database: est
9484 sequences; 8,280,457 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
BF14_1362_C1 3128 0.0
>BF14_1362_C1
Length = 1740
Score = 3128 bits (1578), Expect = 0.0
Identities = 1659/1684 (98%), Gaps = 4/1684 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 catcgcattacatagtaaatgccgtgatgtttggaatttaaaatttatagtgcagtctcg 60
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Sbjct: 46 catcgcattacatagtaaatgccgtgatgtttggaatttaaaatttatagtgcagtctcg 105
Query: 61 cagtaaatatcacattagtggtttaaatattctatttcaaaatgggttg---taatttta 117
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Sbjct: 106 cagtaaatatcacattagtggtttaaatattctatttcaaaatgggttgttgtaatttta 165
Query: 118 tgccttttttaattgtgctgtggacattttttgcatcttgttgcaacacacaacttccgg 177
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Sbjct: 166 tgcctgttttaattgtgctgtggacattttttgcatcttgttgcaacacacaacttccgg 225
Query: 178 ctgagccaacaattaaccttcatacaggtttaacagaaagaataggaaatttctcgatag 237
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Sbjct: 226 ctgagccaacaattaaccttcatacaggtttaacagaaagaataggaaatttctcgatag 285
Query: 238 agttattatattatgccacaaaagaacaagtcgagggaagtaatttaattatttccccaa 297
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Sbjct: 286 agttattatattatgccacaaaagaacaagtcgagggaagtaatttaattatttccccaa 345
Query: 298 taactgtgtggacctcattagcagtggttagcgaaggtgcccacggaaatacgaaaaaag 357
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Sbjct: 346 taactgtgtggacctccttagcagtggttagcgaaggtgcccacggaaatacgaaaaaag 405
Query: 358 agttacgtcaagcccttcgaatatcctcaaagaaagccaatcaaattaaggaagattacc 417
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Sbjct: 406 agttacgtcaagcccttcgaatatcctcaaagaaagccaatcaaattaaggaagattacc 465
Query: 418 agaaaattataaaatatctcacagtccacactgacactattgttctaaataaattcaatg 477
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Sbjct: 466 agaaaattataaaatatctcacagtccacactgacactattgttctaaataaattcaatg 525
Query: 478 gtctatttatgaattctaaaaatatgccattacagagtttccaaaactcagcaaaagaat 537
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Sbjct: 526 gtctatttatgaattctaaaaatatgccattgcagagtttccaaaactcagcaaaagaat 585
Query: 538 acgacacgcgtttaattgaagctgacttttcgaaatcagtggaaacagcagatcggataa 597
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Sbjct: 586 acgacacacgtttaatagaagctgacttttcgaaatctgtggaaacagcagagcgaataa 645
Query: 598 atactgccatcgcaaacctcacagacaacaggatatcgaaattagtggaacccgcagaca 657
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Sbjct: 646 atactgccatcgcaaacctcacagacaacaggatatcgaaattagtggaacccgcagaca 705
Query: 658 tagaaaatagtaatttaatattgacgagcgctatatattttaaaggtcaatggagaacgc 717
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Sbjct: 706 tagaaaatagtaatttaatattgacaagcgctatatattttaaaggtcaatggagaacgc 765
Query: 718 cgtttaatcccaaaaacacaaggagggaaaagttttgcgacagtaacggcgttgaagtgg 777
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Sbjct: 766 cgtttaatcccaaaaacacaaggagggaaaagttttgcgacagtaacggcgttgaagtgg 825
Query: 778 gacaagttaatatgatgtacattcgtgatacattcccctttgccaaaattgacgatctcc 837
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Sbjct: 826 gacaagttaatatgatgtacattcgtgatacattcccctttgccaaaattgacgatctcc 885
Query: 838 aggctagagtcatcgagttaccgtacggcaaatataatcgtacatccatgctcataatgc 897
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Sbjct: 886 aggctagagtcatcgagttaccgtacggcaaatataatcgtacatcaatgctcataatgc 945
Query: 898 taccagaaaaaggtgtgtccttagataaaatgtattcaaatttccaaaaactaacattag 957
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Sbjct: 946 taccagaaaaaggcgtatctttagataaaatgtattcaaatttccaaaaactaacattag 1005
Query: 958 acgacgtatttgaagtgttgaagaagaatcaggaggaattcggcgatgacgaaatagatt 1017
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Sbjct: 1006 acgacgtatttgaagtgttaaagaagaatcaggaggaattcggcgatgacgaaatagatt 1065
Query: 1018 gttacataccgagattcaaaatcgagacgagcttggatttaaaatcgtctctagaataca 1077
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Sbjct: 1066 gttacataccgagattcaaaatcgagacgagcttggatttaaaatcgtctctagaataca 1125
Query: 1078 tggatatcatcgatgttttcagtgagagtaaagccgatctgagtgacgtttcaattatac 1137
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Sbjct: 1126 tggatatcatcgatgttttcagtgagagtaaagccgatctgagtgacgtttcaattatac 1185
Query: 1138 atacatacgtatccaaagttatacacaaagctgaaattgaagtcaccgaagaaggcacaa 1197
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Sbjct: 1186 atacatacgtatccaaagttatacacaaagctgaaattgaagtcaccgaagaaggcacaa 1245
Query: 1198 cagcatctggtgtaacgagatcagatttcggcaacaggattggtgctatccgctttgagg 1257
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Sbjct: 1246 cagcatctggtgtaacgagatcagatttcggcaacaggattggtgctatccgctttgagg 1305
Query: 1258 ctaaccgaccattttgttacatgatcatagagaaaattacaaacacaatagcatttggcg 1317
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Sbjct: 1306 ctaaccgaccattttgttacatgatcatagagaaaattacaaacacaatagcatttggcg 1365
Query: 1318 gtttctaccaaacacctactttatattagattactcatatgtgatattaaataacttatt 1377
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Sbjct: 1366 gtttctaccaaacacctactttatattagattactcatatgtgatattaaataacttatt 1425
Query: 1378 atataaaaatatattcattgttacaaacaaagtaacattttatacacggcaatacaatta 1437
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Sbjct: 1426 atataaaaatatattcattgttccaaacaaagtaacattttatacacggcaatacaatta 1485
Query: 1438 atgagatctgttttatcctttttcatacatatacgctttttgataattttacaattgcaa 1497
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Sbjct: 1486 atgagatctgatttatcctttttaatacatatacgctttttgattattttacaattgtaa 1545
Query: 1498 atctttattgttgattctaatttccttgacaatggctgtacgaggcgttgtttgtcacaa 1557
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Sbjct: 1546 atctttattgttgattctaatttccttgacaatggctgtacgaggcgttgtttgtcacaa 1605
Query: 1558 cgctcgacccattttcctgtttgtattgttagcatagatttaagctttactttatattga 1617
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Sbjct: 1606 cgctcgacccattttcctgtttgtattgttagcatagatttaagctttactttatattga 1665
Query: 1618 gagtataacaattcttgctgtttaatctccaatgaataa-ttaatttaataataaattga 1676
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Sbjct: 1666 gagtataacaattcttactgtttaatctccaatgaataatttaatttaataataaattaa 1725
Query: 1677 aaaa 1680
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Sbjct: 1726 aaaa 1729
Database: est
Posted date: Jul 14, 2011 2:25 PM
Number of letters in database: 8,280,457
Number of sequences in database: 9484
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Sequences: 9484
Number of Hits to DB: 247,254
Number of extensions: 5199
Number of successful extensions: 5199
Number of sequences better than 1.0e-10: 1
Number of HSP's gapped: 5197
Number of HSP's successfully gapped: 1
Length of query: 1846
Length of database: 8,280,457
Length adjustment: 17
Effective length of query: 1829
Effective length of database: 8,119,229
Effective search space: 14850069841
Effective search space used: 14850069841
X1: 11 (21.8 bits)
X2: 15 (29.7 bits)
X3: 50 (99.1 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 34 (67.9 bits)