BLASTN 2.2.24 [Aug-08-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= DPGLEAN14747 (UTR included)
(3325 letters)
Database: est
9484 sequences; 8,280,457 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
BF14_3147_C1 1844 0.0
BF01034B1B02 1047 0.0
BF01033B1H05 835 0.0
>BF14_3147_C1
Length = 1098
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Identities = 966/978 (98%)
Strand = Plus / Plus
Query: 289 aaattggatatacaaaaatatattaccaaatattatttatcatggcgcaacttgaaaata 348
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Query: 409 gtgtagccgtagaggagaaatatataaacagttttaaggataattgttgggatctgatat 468
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Query: 469 ccattatagtaagcaagattgacaataatacaatgacaattaaaccatcattatatggaa 528
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Query: 589 aatttattgaacaaatagaagttgctaaaaatgattctcaatttagcattatactgcagc 648
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Query: 649 ctttgcagcaacttttattaaagcttccccaaaagagaggaaggtcgttagaatggtgcc 708
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Query: 709 ttaattcaatcagcacatatattgaagctataccggtcaaagaacatcaactagaaggaa 768
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Query: 769 aagaacgccttttaatggattgtgataataatataagaagagtaataaaagtatacactc 828
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Sbjct: 601 aagaacgccttttaatggattgtgataataatataagaagagtaataaaagtatacactc 660
Query: 829 tattaccaccattctatagtccttttatacgagaagtaactatgcaggatactaatttga 888
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Sbjct: 661 tattaccaccattctatagtccttttataagagaagtaactatgcaggatactaatttga 720
Query: 889 aaacaaaagagattatatcagcatttcttataagcttacttggaaaaccattactttatg 948
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Sbjct: 721 aaacaaaagagattatatcagcatttcttataagcttacttggaaaaccattactttatg 780
Query: 949 tagatttggatccagaaaccaataaaaatagtgaggcaagatcatgtattgaaatagttg 1008
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Sbjct: 781 tagatttggatccagaaaccaataaaaatagtgaggcaagatcctgtattgatatagttg 840
Query: 1009 taaaagatatatgtacattggtcaaaaatgtatatatatttttaccatatgtacaattgc 1068
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Query: 1069 atcatcgggaaaacatgaaaacaaaatctaagaatacccttatggacaatgaagaagaaa 1128
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Query: 1129 tatctccatatgatcataaagaaaagataaacttaacgactttgtcaggattattctatg 1188
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Sbjct: 961 tatctccatatgatcataaagaaaagataaacttaacgactttgtcaggattattttatg 1020
Query: 1189 tgattctttccaaacactttgaaataccggaatcagcaattccacttgtctactccaaca 1248
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Sbjct: 1021 tgattctttccaaacactttgaaataccggaatcagcaattccacttgtctactccaaca 1080
Query: 1249 attatgtttgtcatactg 1266
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Sbjct: 1081 attatgtttgtcatactg 1098
Score = 137 bits (69), Expect = 1e-31
Identities = 69/69 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 aaaattcgcttgccctaaaatttttaaatcctgtatttataatgaataagttacacaggg 60
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Sbjct: 52 aaaattcgcttgccctaaaatttttaaatcctgtatttataatgaataagttacacaggg 111
Query: 61 ttatttatt 69
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Sbjct: 112 ttatttatt 120
>BF01034B1B02
Length = 854
Score = 1047 bits (528), Expect = 0.0
Identities = 537/540 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 2068 ccttaaggaatagtcgtaagttaacaccgcctcttgtaacaattccaataaatactaaac 2127
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Sbjct: 5 ccttaaggaatagtcgtaagctaacaccgcctcttgtaacaattccaataaatactaaac 64
Query: 2128 aaagaatcataagaagttacaatcaagcccacaatgataaggaatttgtgaaagtccctg 2187
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Sbjct: 65 aaagaatcataagaagttacaatcaagcccacaatgataaggaatttgtgaaagtccctg 124
Query: 2188 cagttataaatgaacaagaagaccaccaatatgaggaagatataaaaaagcgtattatat 2247
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Sbjct: 125 cagttataaatgaacaagaagaccaccaatatgaggaagatataaaaaagcgtattatat 184
Query: 2248 cgaaggctttagattttgtacccacaaaaggttggtcagtggacgctctagctcaggggg 2307
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Sbjct: 185 cgaaggctttagattttgtacccacaaaaggttggtcagtggacgctctagctcaggggg 244
Query: 2308 ctgaagctgcaggatatcctggcgtagctcatggcctatttcctaacggtggaggggacc 2367
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Sbjct: 245 ctgaagctgcaggatatcctggcgtagctcatggcctatttcctaacggtggaggggacc 304
Query: 2368 tggtacattatttcaatgtgtcatgtaatgaaagactggttaacgaaatgaagagctggc 2427
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Sbjct: 305 tggtacattatttcaatgtgtcatgtaatgaaagactggttaacgaaatgaagagctggc 364
Query: 2428 caaaggaagaattaaagggaaataaagttcccgcgcagatgattgagaatgccatagtat 2487
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Sbjct: 365 caaaggaagaattaaaggaaaataaagttcccgcgcaaatgattgagaatgccatagtat 424
Query: 2488 caagacttttgatgattgaaccctataagagtacatggcctaaagcaatggcaatccaaa 2547
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Sbjct: 425 caagacttttgatgattgaaccctataagagtacatggcctaaagcaatggcaatccaaa 484
Query: 2548 ctctgcctaacaatgtaccaaattgtctagcaacattgctgtctttagcagatgacatat 2607
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Sbjct: 485 ctctgcctaacaatgtaccaaattgtctagcaacattgctgtctttagcagatgacatat 544
Score = 505 bits (255), Expect = e-142
Identities = 258/259 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 2608 tgggactcgctggtatttataaagcatcagagttgttttatttgactgataatagccaga 2667
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Sbjct: 596 tgggactcgctggtatttataaagcatcagagttgttttatttgactgataacagccaga 655
Query: 2668 attgcacttcaacaagaaattttgttaaatctcgcatcagagacgcagagtttatacaga 2727
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Query: 2728 tggcgctgaatatgaatccagtggccgttgcaccacaaacactcacagcagcttttgtaa 2787
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Query: 2788 cggcaaagaatatattaggaatgaacacagttaaatgaattcagcaacagtatgataaat 2847
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Sbjct: 776 cggcaaagaatatattaggaatgaacacagttaaatgaattcagcaacagtatgataaat 835
Query: 2848 atgatacagtattgttata 2866
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Sbjct: 836 atgatacagtattgttata 854
>BF01033B1H05
Length = 529
Score = 835 bits (421), Expect = 0.0
Identities = 430/433 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1635 tgtttcactgggctgcagctgatgggcatgatagaaaaaatgtgtcatttacctcacgga 1694
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Sbjct: 1 tgtttcactgggctgcagctgatgggcatgatagaaaaaatgtgtcatttacctcacgga 60
Query: 1695 gctgaatctgaccttgtggaattagctgatcaaataatcagttcactaaacttcttgaga 1754
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Sbjct: 61 gctgaatctgaccttgtggaattagctgatcaaataatcagttcactaaacttcttgaga 120
Query: 1755 tatttggtaataaaagatactaccaataagacaggaattaaggaacaattttcaacaatt 1814
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Sbjct: 121 tatttggtaataaaagatactaccaataagacaggaattaaggaacaattttcaacaatt 180
Query: 1815 gatagagattatttagatgtgcttagaatgggtctgaatatgtccaaggctcattatgaa 1874
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Sbjct: 181 gatagagattatttagatgtgcttagaatgggtctgaatatgtccaaagctcattatgaa 240
Query: 1875 gtaaaattaaaagatattaaggaggaatctaataaaaaaccagaaaatcaagtggaaatt 1934
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Sbjct: 241 gtaaaattaaaagatattaaggaggaatctaataaaaaaccagaaaatcaagtggaaatt 300
Query: 1935 tcactcaatgtgggaggaaatgtattagacaaaataccaacagaaaataaggaacaaata 1994
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Sbjct: 301 tcactcaatgtgggaggaaatgtattagacaaaataccaacagaaaataaggaacaaata 360
Query: 1995 atatattctgctcttaatgcttttcacttgatagaaggtttagtggctaggctctctgaa 2054
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Sbjct: 361 atatattctgctcttaatgcttttcatttgatagaaggtttagtggctaggctctctgaa 420
Query: 2055 tgtatagccatga 2067
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Sbjct: 421 tgtgtagccatga 433
Database: est
Posted date: Jul 14, 2011 2:25 PM
Number of letters in database: 8,280,457
Number of sequences in database: 9484
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Sequences: 9484
Number of Hits to DB: 462,881
Number of extensions: 9414
Number of successful extensions: 9414
Number of sequences better than 1.0e-10: 3
Number of HSP's gapped: 9414
Number of HSP's successfully gapped: 5
Length of query: 3325
Length of database: 8,280,457
Length adjustment: 18
Effective length of query: 3307
Effective length of database: 8,109,745
Effective search space: 26818926715
Effective search space used: 26818926715
X1: 11 (21.8 bits)
X2: 15 (29.7 bits)
X3: 50 (99.1 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 34 (67.9 bits)