BLASTN 2.2.24 [Aug-08-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= DPGLEAN15510 (UTR included)
(2359 letters)
Database: est
9484 sequences; 8,280,457 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
BF14_3374_C1 1838 0.0
BF01050B1D07 1522 0.0
>BF14_3374_C1
Length = 957
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Identities = 948/955 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1187 agtcaaatgtgaagactgtggtttcatagctcactcgaaatgttctgagagagtacctaa 1246
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Sbjct: 1 agtcaaatgtgaagactgtggtttcatagctcactccaaatgttctgagagagtacctaa 60
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Query: 1307 actgaatgctcactcaagtacactgccatttgtagtaaggaagtgtgtgaacgaaattga 1366
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Sbjct: 121 actgaatgctcactcaagtacactgccatttgtagtaaggaagtgtgtgaacgaaattga 180
Query: 1367 agccaggggaatggattctgagggtatttacagagtatcaggatttgcagatgagattga 1426
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Query: 1487 cataaatgtgatagcggggacactaaagctttatcttcgactgttaccagtgcctcttat 1546
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Sbjct: 301 cataaatgtgatagcggggacactaaagctttatcttcgactgttaccagtgcctcttat 360
Query: 1547 tacctatgacgtacatccgaaactcattagtgccattcaaacgaaaacaacggccttgca 1606
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Query: 1607 agtgacaatgctgcgggagtgtctcgatttgcttcctccggcacatttcaactgcttaca 1666
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Sbjct: 481 gtacatggttcaacatttaaatagagtttctcagcatgcggatgtgaacaaaatgtcagc 540
Query: 1727 tcataacctgagtaccgtttttgctccaacattggtcgctaccccaccagctatcacaga 1786
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Sbjct: 541 tcataacctgagtaccgtttttgctccaacattggtcgctaccccaccagctatcacaga 600
Query: 1787 cttggcgtttgaaataagagcgttacaagctctcattgaattctgtccacagatttacta 1846
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Sbjct: 601 cttggcgtttgaaataagagctttacaagctctcatcgaattctgtccacagatttacta 660
Query: 1847 tggcagcaagtaaaattacgtgcaatgtttatattattgagaattatcggacttacctta 1906
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Query: 1907 tttattttacacagcaactgcttatactgttagtgtttgttacatcatctcagtaaaatg 1966
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Query: 1967 ttacttacaattgaatacttagcataatatttgctatactatatttgttttgtattttta 2026
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Sbjct: 781 ttacttacaattaaatacttagcataatatttgctatactatatttgttttgtattttta 840
Query: 2027 ttctatgttaagggaaataaataatctgttttttatatgtgatattggattgaactgtat 2086
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Sbjct: 841 ttctatgttaagggaaataaataatctgtttttcatatgtgatattggattgaactgtat 900
Query: 2087 aaatcattccgtggttgtgttgtagtgaccaaaattatcttaatgtttttttttt 2141
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Sbjct: 901 aaatcattccgtggttgtgttgtagtgaccaaaattatcttaatgtttttttttt 955
>BF01050B1D07
Length = 783
Score = 1522 bits (768), Expect = 0.0
Identities = 779/783 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 371 ggaaaggaaatcttgactttgattattgttttgtgatttgtttacgttaagatatacttg 430
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Sbjct: 1 ggaaaggaaatcttgactttgattattgtttcgtgatttgtttacgttaagatatacttg 60
Query: 431 tttatattttatttgttttcagtgttttgtctgcattggtatttaaataaaatactttag 490
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Sbjct: 61 tttatattttatttgttttcagtgttttgtctgcattggtatttaaataaaatactttag 120
Query: 491 aaactcaaccatggaaaatctgaaaaatatttggaaaccagaactttacagaattcagat 550
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Sbjct: 121 aaactcaaccatggaaaatctgaaaaatatttggaaaccagaactttacagaattcagat 180
Query: 551 ggaggctccaacgccgaagcgcataatttgtgagaattgtccatatagacctgaatttta 610
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Sbjct: 181 ggaggctccaacgccgaagcgcataatttgtgagaattgtccatatagacctgaatttta 240
Query: 611 tgggaaagaataccatggtgtaatgggacacaaggaggctacattattattagaagagga 670
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Sbjct: 241 tgggaaagaataccatggtgtaatgggacataaggaggctacattattattagaagagga 300
Query: 671 gcccaatggagcttttcttattaggaaaggcaatgagcttaatgatttttatacactctc 730
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Sbjct: 301 gcccaatggagcttttcttattaggaaaggcaatgagcttaatgatttttatacactctc 360
Query: 731 ttggaggttcaacgatagaatacatcactataaactatattacgatgggacacattatat 790
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Sbjct: 361 ttggaggttcaacgatagaatacatcactataaactatattacgatgggacacattatat 420
Query: 791 taaggacaagagatatgactgtatatatgatctagttgccgatggcctcatattctgtca 850
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Sbjct: 421 taaggacaagagatatgactgtatatatgatctagttgccgatggcctcatattctgtca 480
Query: 851 catggagctaaaggcacatcatatactagagatgattaactgtcgaacaaattacacaga 910
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Sbjct: 481 catggagctaaaggcacatcatatactagagatgattaactgtcgaacaaattacacaga 540
Query: 911 aagtccctatgttactcttaatagaagaaaactgaatactttgtctaaaatgcaacaggc 970
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Sbjct: 541 aagtccctatgttactcttaatagaagaaaactgaatactttgtctaaaatgcaacaggc 600
Query: 971 atccaataaatctagtccaattttccataaaaacgagaacaaaattgttgaagttgacaa 1030
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Sbjct: 601 atccaataaatctagtccaattttccataaaaacgagaacaaaattgtcgaagttgacaa 660
Query: 1031 tgatgtcaagaaaacattagatctaacaccaatgctagaagatagtccgttactatttaa 1090
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Sbjct: 661 tgatgtcaagaaaacattagatctaacaccaatgctagangatagtccgttactatttaa 720
Query: 1091 gtatctgaaagcgcatagttttaagttgcatacatttaaaggactaaattggtgtgaact 1150
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Sbjct: 721 gtatctgaaagcgcatagttttaagttgcatacatttaaaggactaaattggtgtgaact 780
Query: 1151 gtg 1153
|||
Sbjct: 781 gtg 783
Database: est
Posted date: Jul 14, 2011 2:25 PM
Number of letters in database: 8,280,457
Number of sequences in database: 9484
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Sequences: 9484
Number of Hits to DB: 337,094
Number of extensions: 7374
Number of successful extensions: 7374
Number of sequences better than 1.0e-10: 2
Number of HSP's gapped: 7374
Number of HSP's successfully gapped: 2
Length of query: 2359
Length of database: 8,280,457
Length adjustment: 17
Effective length of query: 2342
Effective length of database: 8,119,229
Effective search space: 19015234318
Effective search space used: 19015234318
X1: 11 (21.8 bits)
X2: 15 (29.7 bits)
X3: 50 (99.1 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 34 (67.9 bits)