BLASTN 2.2.24 [Aug-08-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= DPGLEAN16188 (UTR included)
(1085 letters)
Database: est
9484 sequences; 8,280,457 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
BF01014B2D12 86 1e-16
BF01015A2C08 72 2e-12
BF01053B2C07 68 3e-11
>BF01014B2D12
Length = 734
Score = 85.7 bits (43), Expect = 1e-16
Identities = 43/43 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 765 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca 807
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 88 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca 130
Score = 85.7 bits (43), Expect = 1e-16
Identities = 43/43 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 765 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca 807
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 90 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca 132
Score = 85.7 bits (43), Expect = 1e-16
Identities = 43/43 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 765 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca 807
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 92 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca 134
Score = 85.7 bits (43), Expect = 1e-16
Identities = 43/43 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 765 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca 807
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 94 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca 136
Score = 85.7 bits (43), Expect = 1e-16
Identities = 43/43 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 765 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca 807
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 96 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca 138
Score = 85.7 bits (43), Expect = 1e-16
Identities = 43/43 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 765 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca 807
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 98 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca 140
Score = 85.7 bits (43), Expect = 1e-16
Identities = 43/43 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 765 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca 807
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 100 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca 142
Score = 85.7 bits (43), Expect = 1e-16
Identities = 43/43 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 765 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca 807
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 102 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca 144
Score = 85.7 bits (43), Expect = 1e-16
Identities = 43/43 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 765 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca 807
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 104 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca 146
Score = 85.7 bits (43), Expect = 1e-16
Identities = 43/43 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 765 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca 807
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 106 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca 148
Score = 85.7 bits (43), Expect = 1e-16
Identities = 43/43 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 765 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca 807
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 108 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca 150
Score = 85.7 bits (43), Expect = 1e-16
Identities = 43/43 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 765 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca 807
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 110 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca 152
Score = 85.7 bits (43), Expect = 1e-16
Identities = 43/43 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 765 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca 807
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 112 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca 154
Score = 85.7 bits (43), Expect = 1e-16
Identities = 43/43 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 765 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca 807
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 114 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca 156
Score = 83.8 bits (42), Expect = 5e-16
Identities = 42/42 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 765 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacac 806
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 116 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacac 157
Score = 81.8 bits (41), Expect = 2e-15
Identities = 44/45 (97%)
Strand = Plus / Plus
Query: 765 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaaa 809
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 44 acacacacacacacacacacacaaacacacacacacacacacaaa 88
Score = 81.8 bits (41), Expect = 2e-15
Identities = 44/45 (97%)
Strand = Plus / Plus
Query: 765 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaaa 809
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct: 120 acacacacacacacacacacacacacacacacacacactcacaaa 164
Score = 79.8 bits (40), Expect = 8e-15
Identities = 43/44 (97%)
Strand = Plus / Plus
Query: 764 tacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca 807
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 41 tacacacacacacacacacacacacaaacacacacacacacaca 84
Score = 77.8 bits (39), Expect = 3e-14
Identities = 42/43 (97%)
Strand = Plus / Plus
Query: 765 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca 807
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 68 acacacacacacacacacaaacacacacacacacacacacaca 110
Score = 77.8 bits (39), Expect = 3e-14
Identities = 42/43 (97%)
Strand = Plus / Plus
Query: 765 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca 807
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 70 acacacacacacacacaaacacacacacacacacacacacaca 112
Score = 77.8 bits (39), Expect = 3e-14
Identities = 42/43 (97%)
Strand = Plus / Plus
Query: 765 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca 807
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 72 acacacacacacacaaacacacacacacacacacacacacaca 114
Score = 77.8 bits (39), Expect = 3e-14
Identities = 42/43 (97%)
Strand = Plus / Plus
Query: 765 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca 807
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 74 acacacacacacaaacacacacacacacacacacacacacaca 116
Score = 77.8 bits (39), Expect = 3e-14
Identities = 42/43 (97%)
Strand = Plus / Plus
Query: 765 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca 807
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 76 acacacacacaaacacacacacacacacacacacacacacaca 118
Score = 77.8 bits (39), Expect = 3e-14
Identities = 42/43 (97%)
Strand = Plus / Plus
Query: 765 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca 807
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 78 acacacacaaacacacacacacacacacacacacacacacaca 120
Score = 77.8 bits (39), Expect = 3e-14
Identities = 42/43 (97%)
Strand = Plus / Plus
Query: 765 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca 807
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 80 acacacaaacacacacacacacacacacacacacacacacaca 122
Score = 77.8 bits (39), Expect = 3e-14
Identities = 42/43 (97%)
Strand = Plus / Plus
Query: 765 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca 807
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 82 acacaaacacacacacacacacacacacacacacacacacaca 124
Score = 69.9 bits (35), Expect = 8e-12
Identities = 41/43 (95%)
Strand = Plus / Plus
Query: 765 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca 807
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 50 acacacacacacacacaaacacacacacacacacacaaacaca 92
Score = 69.9 bits (35), Expect = 8e-12
Identities = 41/43 (95%)
Strand = Plus / Plus
Query: 765 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca 807
||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 52 acacacacacacacaaacacacacacacacacacaaacacaca 94
Score = 69.9 bits (35), Expect = 8e-12
Identities = 41/43 (95%)
Strand = Plus / Plus
Query: 765 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca 807
||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 54 acacacacacacaaacacacacacacacacacaaacacacaca 96
Score = 69.9 bits (35), Expect = 8e-12
Identities = 41/43 (95%)
Strand = Plus / Plus
Query: 765 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca 807
||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct: 56 acacacacacaaacacacacacacacacacaaacacacacaca 98
Score = 69.9 bits (35), Expect = 8e-12
Identities = 41/43 (95%)
Strand = Plus / Plus
Query: 765 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca 807
||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 58 acacacacaaacacacacacacacacacaaacacacacacaca 100
Score = 69.9 bits (35), Expect = 8e-12
Identities = 41/43 (95%)
Strand = Plus / Plus
Query: 765 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca 807
||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 60 acacacaaacacacacacacacacacaaacacacacacacaca 102
Score = 69.9 bits (35), Expect = 8e-12
Identities = 41/43 (95%)
Strand = Plus / Plus
Query: 765 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca 807
||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 62 acacaaacacacacacacacacacaaacacacacacacacaca 104
Score = 69.9 bits (35), Expect = 8e-12
Identities = 41/43 (95%)
Strand = Plus / Plus
Query: 765 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca 807
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||
Sbjct: 126 acacacacacacacacacacacacacacacactcacaaacaca 168
Score = 69.9 bits (35), Expect = 8e-12
Identities = 41/43 (95%)
Strand = Plus / Plus
Query: 767 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaaa 809
||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct: 170 acacacacacaaacacacacacacacacacacacactcacaaa 212
Score = 67.9 bits (34), Expect = 3e-11
Identities = 40/42 (95%)
Strand = Plus / Plus
Query: 765 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacac 806
||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 164 acacagacacacacacaaacacacacacacacacacacacac 205
>BF01015A2C08
Length = 709
Score = 71.9 bits (36), Expect = 2e-12
Identities = 42/44 (95%)
Strand = Plus / Minus
Query: 764 tacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca 807
|||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct: 515 tacacacacacacagacacacacagacacacacacacacacaca 472
Score = 69.9 bits (35), Expect = 8e-12
Identities = 41/43 (95%)
Strand = Plus / Minus
Query: 767 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaaa 809
||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct: 500 acacacacagacacacacacacacacacacagacacacacaaa 458
Score = 69.9 bits (35), Expect = 8e-12
Identities = 41/43 (95%)
Strand = Plus / Minus
Query: 765 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca 807
||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 512 acacacacacagacacacacagacacacacacacacacacaca 470
>BF01053B2C07
Length = 572
Score = 67.9 bits (34), Expect = 3e-11
Identities = 37/38 (97%)
Strand = Plus / Minus
Query: 773 acacacacacacacacacacacacacacacacacaaat 810
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 53 acacacacacacacacacacacacacacatacacaaat 16
Database: est
Posted date: Jul 14, 2011 2:25 PM
Number of letters in database: 8,280,457
Number of sequences in database: 9484
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Sequences: 9484
Number of Hits to DB: 130,559
Number of extensions: 4437
Number of successful extensions: 4437
Number of sequences better than 1.0e-10: 3
Number of HSP's gapped: 4380
Number of HSP's successfully gapped: 40
Length of query: 1085
Length of database: 8,280,457
Length adjustment: 17
Effective length of query: 1068
Effective length of database: 8,119,229
Effective search space: 8671336572
Effective search space used: 8671336572
X1: 11 (21.8 bits)
X2: 15 (29.7 bits)
X3: 50 (99.1 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 34 (67.9 bits)