BLASTN 2.2.24 [Aug-08-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= DPGLEAN16410 (UTR included)
(2359 letters)
Database: est
9484 sequences; 8,280,457 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
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BF01051B1C10 1433 0.0
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>BF14_1130_C1
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Strand = Plus / Plus
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Query: 1504 cattaatattctacgtgcctttagaaattctttggaagaggataaaaaataaatttcatg 1563
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Query: 1624 gccttgcctgtgcgatacctagactagaactctttatggagctggtcggagctgtatgtt 1683
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Query: 1684 tatcgatcctgggtattacatttcctgttattattgagactgttttcctctgggacaaag 1743
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Sbjct: 1262 tatcgatcctgggcattacatttcctgttattattgagactgtttttctctgggacaaag 1321
Query: 1744 atatggggaaatggaaatggatcttatggaaaaatacttttatcttaatattttcgattt 1803
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Sbjct: 1322 atatggggaaatggaaatggatcttatggaaaaatacttttatcttaatattttcgattt 1381
Query: 1804 tggttttaatatctggaatatcgtgttctattcagaccttgtttcaaaaattgtgatttt 1863
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Sbjct: 1382 tggttttaatatctggaatatcgtgttctattcagaccttgtttcaaaaattgtgatttt 1441
Query: 1864 ttaatgttaattcatgaaataga---aattttaatgccgtactgtaaggttgttgagtaa 1920
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Query: 1921 attaaaaataaaaattcttgaaagtctaataaatggttaataaatattaataaagtttta 1980
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Sbjct: 1502 attaaaaataaaaattcttgaaagtcttaaaaatggttaataaatattaataaagtttta 1561
Query: 1981 gtatataatacaattgtttataacattcttgtgttggaaatgtacatttttaatatgaaa 2040
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Sbjct: 1562 atatataatacaattgtttataacattcttgttttagaaatgtacatttttaatatgaaa 1621
Query: 2041 ttttaaaaact 2051
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Sbjct: 1622 ttttaaaaact 1632
>BF01051B1C10
Length = 808
Score = 1433 bits (723), Expect = 0.0
Identities = 785/809 (97%), Gaps = 20/809 (2%)
Strand = Plus / Plus
Query: 399 gactgttcattcagtgttaattgtcccacggaatgattatattacaccaatattttataa 458
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Query: 519 ataacgagtactcaaagtgttctgagagatataaggacagagataacagataatgatgca 578
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Query: 579 aaggaagatgttaatcgttatgtaccagccgaacataggccgcgggagtcaaacacatca 638
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Sbjct: 180 aaggaagatgttaatcgttatgtaccagccgaacataggccgcgggagtcaaacacatca 239
Query: 639 agtttcggagcgctggcccatcttcttaaagcttctttgagttcaggtgttttagcgatg 698
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Query: 699 ccagtggcgttcaagaatgctggactcatcactggaattattggaacaatatttgttggt 758
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Query: 759 ctgatttgcgttcacgtaactcatatatttgtaaaaacatcacaagctctatgtgtagat 818
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Query: 819 attaaaagaccatgtttaggatattctgaaacttgctattcagttttcaaaaatggacca 878
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Query: 879 aaatcggtccaaaaatttgcctctatagcc-------------------agatttctagc 919
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Query: 920 agattgttctctggctgtcacacatttaggagcttgctgtgtatatatcgtggttgttgc 979
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Query: 980 tgagagttttaaacaagtttctgatgagtattgtggtccatcgtggtcagtatcggcatt 1039
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Query: 1040 ctgtgctctgaccctgattgtgttaataccgctcacacaaatcacgaaactgaagtactt 1099
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Query: 1100 ggtcccattctcaacatttgcaaattttgtatggctcacctctatttgtatatcgttata 1159
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Query: 1160 ttactgtttgcgaaaatcacaaccgcttt 1188
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>BF01045B2H03
Length = 768
Score = 775 bits (391), Expect = 0.0
Identities = 391/391 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 909 agatttctagcagattgttctctggctgtcacacatttaggagcttgctgtgtatatatc 968
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Query: 969 gtggttgttgctgagagttttaaacaagtttctgatgagtattgtggtccatcgtggtca 1028
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Query: 1029 gtatcggcattctgtgctctgaccctgattgtgttaataccgctcacacaaatcacgaaa 1088
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Query: 1089 ctgaagtacttggtcccattctcaacatttgcaaattttgtatggctcacctctatttgt 1148
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Sbjct: 558 ctgaagtacttggtcccattctcaacatttgcaaattttgtatggctcacctctatttgt 617
Query: 1149 atatcgttatattactgtttgcgaaaatcacaaccgctttcgaaacggaatttatctaca 1208
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Sbjct: 618 atatcgttatattactgtttgcgaaaatcacaaccgctttcgaaacggaatttatctaca 677
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Query: 1269 gtggtgatgccgattgaaaatgaaatgttga 1299
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Sbjct: 738 gtggtgatgccgattgaaaatgaaatgttga 768
Score = 543 bits (274), Expect = e-154
Identities = 287/292 (98%)
Strand = Plus / Plus
Query: 619 cgcgggagtcaaacacatcaagtttcggagcgctggcccatcttcttaaagcttctttga 678
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Sbjct: 1 cgcgggagtcaaacacgtcaagtttcgganntctggcccatcttcttaaagcttctttga 60
Query: 679 gttcaggtgttttagcgatgccagtggcgttcaagaatgctggactcatcactggaatta 738
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Sbjct: 61 gttcaggtgttttagcgatgccagtggcgtttaagaatgctggactcatcactggaatta 120
Query: 739 ttggaacaatatttgttggtctgatttgcgttcacgtaactcatatatttgtaaaaacat 798
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Sbjct: 121 ttggaacaatatttgttggtctgatttgcgttcacgtaactcatatatttgtaaaaacat 180
Query: 799 cacaagctctatgtgtagatattaaaagaccatgtttaggatattctgaaacttgctatt 858
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Sbjct: 181 cacaagctctatgtgtagatattaaaagaccatgtttaggatattctgaaacttgctatt 240
Query: 859 cagttttcaaaaatggaccaaaatcggtccaaaaatttgcctctatagccag 910
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Sbjct: 241 cagttttcaaaaatggaccaaaatcggtccaaaaatttgcctctatagccag 292
Database: est
Posted date: Jul 14, 2011 2:25 PM
Number of letters in database: 8,280,457
Number of sequences in database: 9484
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Sequences: 9484
Number of Hits to DB: 361,374
Number of extensions: 21089
Number of successful extensions: 21089
Number of sequences better than 1.0e-10: 3
Number of HSP's gapped: 21087
Number of HSP's successfully gapped: 5
Length of query: 2359
Length of database: 8,280,457
Length adjustment: 17
Effective length of query: 2342
Effective length of database: 8,119,229
Effective search space: 19015234318
Effective search space used: 19015234318
X1: 11 (21.8 bits)
X2: 15 (29.7 bits)
X3: 50 (99.1 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 34 (67.9 bits)