BLASTN 2.2.24 [Aug-08-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= DPGLEAN16452 (UTR included)
(1807 letters)
Database: est
9484 sequences; 8,280,457 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
BF14_3176_C1 2553 0.0
>BF14_3176_C1
Length = 1325
Score = 2553 bits (1288), Expect = 0.0
Identities = 1316/1324 (99%), Gaps = 1/1324 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 374 atcaaaaatgaaatttgaattttgttttattataagtcaataatattagatagttatttt 433
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Sbjct: 2 atcaaaaatgaaatttgaattttgttttattataagtcaataatattagatagttatttt 61
Query: 434 actatatttataaaaaactagtttctaatataagttattagttggatctgaataaaattg 493
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Sbjct: 62 actatatttataaaaaactagtttctaatataagttattagttggatctgaataaaattg 121
Query: 494 caaaaacatgttgtcccggtttcaccattatcatggttcaaatattattttattcgaaga 553
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Sbjct: 122 caaaaacatgttgtcccggtttcaccattatcatggttcaaatattattttattcgaaga 181
Query: 554 caatacagtggcatacagaaaaacaagttttgctcacggcctgactttcagcgagaagcc 613
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Sbjct: 182 caatacagtggcatacagaaaaacaagttttgctcacggcctgacttttagcgagaagcc 241
Query: 614 tctattacccggtgaaatatttttagttgaaatagaaaaaacggaacgagggtggagtgg 673
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Sbjct: 242 tctattacccggtgaaatatttttagttgaaatagaaaaaacggaacgagggtggagtgg 301
Query: 674 tcatatgcgcctcggtctaacactacttgacccacagaccgccgcgctaggtgataaagg 733
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Sbjct: 302 tcatatgcgcctcggtctaacactacttgacccacagaccgccgcgctaggtgataaagg 361
Query: 734 tttaccccaatacgcactacccgatctcgctaataccggtatgtcatggatctttcctat 793
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Sbjct: 362 tttaccccaatacgcactacccgatctcgctaatacgggtatgtcatggatctttcctat 421
Query: 794 atcgaaatctcagaacaatgttataagtacttttgagcttgtaaatcaaggatcagttcg 853
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Sbjct: 422 atcgaaatctcagaataatgttataagtacttttgagcttgtaaatcaaggatcagttcg 481
Query: 854 tcgcgataacgactccagagtatcggttcttggaaatggtcacagtgtccgaactcctag 913
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Sbjct: 482 tcgcgataacgactccagagtatcggttcttggaaatggtcacagtgtccgaactcctag 541
Query: 914 aggatttgtttccaaaatgattctaaggcctcagaatttgtctcaaaaggggtcaccaca 973
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Sbjct: 542 aggatttgtttccaaaatgattctaaggcctcagaatttgtctcaaaaggggtcaccaca 601
Query: 974 gggtattttgcctatggacgcaggaagtcgcattggagttatgtatgtaccatgcccaaa 1033
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Sbjct: 602 gggtattttgcctatggacgcaggaagtcgcattggagttatgtatgtaccatgcccaaa 661
Query: 1034 gactagcaaagatgaacctgacctggcagaaatgcatttcataataaatggcgaagaaca 1093
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Sbjct: 662 gactagcaaagatgaacctgacctggcagaaatgcatttcataataaatggcgaagaaca 721
Query: 1094 gggtccttgtgctaaagctataccttacatgagtgggcccttacatgcagtggtagacgt 1153
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Sbjct: 722 gggtccttgtgctaaagctataccttacatgagtgggcccttacatgcagtggtagacgt 781
Query: 1154 atatgggacaacaaaacgagtaaaaattattcaattatatggagtgaatagtctacagaa 1213
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Sbjct: 782 atatgggacaacaaaacgagtaaaaattattcaattatatggagtgaatagtctacagaa 841
Query: 1214 catatgcagagatgccatacttcaatatgttaaaaataattctgttaaatcattacctct 1273
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Sbjct: 842 tatatgccgagatgccatacttcaatatgttaaaaataattctgttaaatcattacctct 901
Query: 1274 gccccagtgtttgaaggattacctgctctcgtagatatgtgcaggaaatttgattttttt 1333
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Sbjct: 902 gccccagtgtttgaaggattacctgctctcgtagatatgtgcaggaaatttgattttttt 961
Query: 1334 gtgatgacaataaggctgttgataaattttactttttattggtcatttggtgtttgtatt 1393
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Sbjct: 962 gtgatgacaataaggctgttgataaattttactttttattggtcatttggtgtttgtatt 1021
Query: 1394 ctcaaggtttgtaaatatttggtactttataataatattttaagtattgataaatttatg 1453
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Sbjct: 1022 ctcaaggtttgtaaatatttggtactttataataatattttaagtattgataaatttatg 1081
Query: 1454 atattctgtgtaatgatttgatattagcattttaaattttcttcaaaggagatattaaaa 1513
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Sbjct: 1082 atattctgtgtaatgatttgatattagcattttaaattttctttaaaggagatattaaaa 1141
Query: 1514 ccagccagatatcgaccattttatttgagctttgttacaaaacaatatttcttattgaac 1573
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Sbjct: 1142 ccaaccagatatcgaccattttatttgagctttgttacaaaacaatatttcttattgaac 1201
Query: 1574 ataattaaggaatggattaggtctaaatattattattaaataaattgtctttaagatttt 1633
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Sbjct: 1202 ataattaaggaatggattaggtctaaatattattattaaataaattgtctttaagatttt 1261
Query: 1634 aacactttgaaggtaactgtaccagtcacaatgtttatttaagta-ctctatcaattgaa 1692
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Sbjct: 1262 aacactttgaaggtaactgtaccagtcacaatgtttatttaagtatctctatcaattgaa 1321
Query: 1693 tgtg 1696
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Sbjct: 1322 tgtg 1325
Database: est
Posted date: Jul 14, 2011 2:25 PM
Number of letters in database: 8,280,457
Number of sequences in database: 9484
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Sequences: 9484
Number of Hits to DB: 274,351
Number of extensions: 6065
Number of successful extensions: 6065
Number of sequences better than 1.0e-10: 1
Number of HSP's gapped: 6064
Number of HSP's successfully gapped: 1
Length of query: 1807
Length of database: 8,280,457
Length adjustment: 17
Effective length of query: 1790
Effective length of database: 8,119,229
Effective search space: 14533419910
Effective search space used: 14533419910
X1: 11 (21.8 bits)
X2: 15 (29.7 bits)
X3: 50 (99.1 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 34 (67.9 bits)