BLASTN 2.2.24 [Aug-08-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= DPGLEAN17675 (UTR included)
(2242 letters)
Database: est
9484 sequences; 8,280,457 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
BF01019A2A09 234 5e-61
BF01014B2D12 131 5e-30
BF01015A2C08 72 4e-12
>BF01019A2A09
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>BF01014B2D12
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Sbjct: 118 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacactcacaaacacagacacacac 177
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Sbjct: 130 acacacacacacacacacacacacacactcacaaacacagacacacacacaaacacacac 189
Query: 2217 ccacacacacacacacccacacacac 2242
||||||||||||||| |||| ||||
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Score = 97.6 bits (49), Expect = 7e-20
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Strand = Plus / Plus
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Sbjct: 146 acacacacacactcacaaacacagacacacacacaaacacacacacacacacacacacac 205
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Strand = Plus / Plus
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Sbjct: 172 acacacacaaacacacacacacacacacacacactcacaaacacagacacacacacaaac 231
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Sbjct: 159 cacaaacacagacacacacacaaacacacacacacacacacacacactcacaaacacaga 218
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>BF01015A2C08
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||||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||
Sbjct: 514 acacacacacacagacacacacagacacacacacacacacacacagacacacaca 460
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Query: 2163 acacacacacacacacccacacacacacacacccacacacacacacacacacac 2216
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Sbjct: 514 acacacacacacagacacacacagacacacacacacacacacacagacacacac 461
Database: est
Posted date: Jul 14, 2011 2:25 PM
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Number of sequences in database: 9484
Lambda K H
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Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
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Number of Sequences: 9484
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Length of database: 8,280,457
Length adjustment: 17
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Effective search space: 18065284525
Effective search space used: 18065284525
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S2: 34 (67.9 bits)