BLASTN 2.2.24 [Aug-08-2010] Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402. Query= DPGLEAN17977 (UTR included) (4018 letters) Database: est 9484 sequences; 8,280,457 total letters Searching..................................................done Score E Sequences producing significant alignments: (bits) Value BF01016A2B12 1572 0.0 BF01014B2D12 90 3e-17 BF01055B2E01 74 2e-12
>BF01016A2B12 Length = 821 Score = 1572 bits (793), Expect = 0.0 Identities = 808/812 (99%), Gaps = 1/812 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 2548 agatccacttgaagcggagcacggacttcataccgagctactaccggtacgtcgacatgg 2607 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 11 agatccacttgaagcggagcacggacttcataccgagctactaccggtacgtcgacatgg 70 Query: 2608 caagcttgaatctcaccgcagcgccatctgtcgccggtccgctggaactgaacttgacca 2667 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 71 caagcttgaatctcaccgcagcgccatctgtcgccggtccgctggaactgaacttgacca 130 Query: 2668 acaacaacctccgaagcgccccgctggctttgctggttactaactgctcgttatatctat 2727 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 131 acaacaacctccgaagcgccccgctggctttgctggttactaactgctcgttatacctat 190 Query: 2728 cgaacaatccgttcctgtgcggttgcgatgattacgagagcgttgaaaatcttattagat 2787 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 191 cgaacaatccgttcctgtgcggttgcgatgattacgagagcgttgaaaatcttattagat 250 Query: 2788 acaaacatttgatacgcgatttcaaagaaattagatgcgaggatggcgggctcgtctcta 2847 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 251 acaaacatttgatacgcgatttcaaagaaattagatgcgaggatggcgggctcgtctcta 310 Query: 2848 acgttaacaccggccagatctgcgtggcgagagatgccgccataatcggctcgacgatcg 2907 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 311 acgttaacaccggccagatctgcgtggcgagagatgccgccataatcggctcgacgatcg 370 Query: 2908 ccatgttcggcgtgattctggctattttcaccgcgacggcgtacaaatattcaacggaga 2967 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 371 ccatgttcggcgtgattctggctattttcaccgcgacggcgtacaaatattcaacggaga 430 Query: 2968 tacgaattctactgaggaaatatcatctctggtggggagacgagttcgactgcgagaagg 3027 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 431 tacgaattctactgaggaaatatcatctctggtggggagacgagttcgactgcgagaagg 490 Query: 3028 agtacgacgccttcgtgtcttactcgcaccaggacgagggttacgtagtggagcaactgg 3087 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 491 agtacgacgccttcgtgtcttactcgcaccaggacgagggttacgtagtggagcaactgg 550 Query: 3088 tcccgaacctggaaggggggaagccgcctctgagactgtgcgtccactaccggaactggg 3147 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 551 tcccgaacctggaaggcgggaagccgcctctgagactgtgcgtccactaccggaactggg 610 Query: 3148 tgataggcgacttcataccgagccagatagcgagatccgtggaacaatctagaaaaacca 3207 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 611 tgataggcgacttcataccgagccagatagcgagatccgtggaacaatctagaaaaacca 670 Query: 3208 taatagtgctttccaaacacttcgtgaactcgatatggggtcacatggaattcaggacgg 3267 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 671 taatagtgctttccaaacacttcgtgaactcgatatggggtcacatggaattcaggacgg 730 Query: 3268 cgcatggcaagggcaaggtgataatactcatgctggacgacctctccgccgatgacagcc 3327 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 731 cgcatggcaagggcaaggtgataatactcatgctggacgacctctccgccgatgacagcc 790 Query: 3328 tggacccggagctcaaggcctatatagccatg 3359 ||| |||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 791 tggncccggagctc-aggcctatatagccatg 821 >BF01014B2D12 Length = 734 Score = 89.7 bits (45), Expect = 3e-17 Identities = 45/45 (100%) Strand = Plus / Plus Query: 2 atacacacacacacacacacacacacaaacacacacacacacaca 46 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 40 atacacacacacacacacacacacacaaacacacacacacacaca 84 Score = 77.8 bits (39), Expect = 1e-13 Identities = 42/43 (97%) Strand = Plus / Plus Query: 4 acacacacacacacacacacacacaaacacacacacacacaca 46 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 62 acacaaacacacacacacacacacaaacacacacacacacaca 104 Score = 77.8 bits (39), Expect = 1e-13 Identities = 42/43 (97%) Strand = Plus / Plus Query: 4 acacacacacacacacacacacacaaacacacacacacacaca 46 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 88 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca 130 Score = 77.8 bits (39), Expect = 1e-13 Identities = 42/43 (97%) Strand = Plus / Plus Query: 4 acacacacacacacacacacacacaaacacacacacacacaca 46 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 90 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca 132 Score = 77.8 bits (39), Expect = 1e-13 Identities = 42/43 (97%) Strand = Plus / Plus Query: 4 acacacacacacacacacacacacaaacacacacacacacaca 46 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 92 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca 134 Score = 77.8 bits (39), Expect = 1e-13 Identities = 42/43 (97%) Strand = Plus / Plus Query: 4 acacacacacacacacacacacacaaacacacacacacacaca 46 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 94 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca 136 Score = 77.8 bits (39), Expect = 1e-13 Identities = 42/43 (97%) Strand = Plus / Plus Query: 4 acacacacacacacacacacacacaaacacacacacacacaca 46 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 96 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca 138 Score = 77.8 bits (39), Expect = 1e-13 Identities = 42/43 (97%) Strand = Plus / Plus Query: 4 acacacacacacacacacacacacaaacacacacacacacaca 46 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 98 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca 140 Score = 77.8 bits (39), Expect = 1e-13 Identities = 42/43 (97%) Strand = Plus / Plus Query: 4 acacacacacacacacacacacacaaacacacacacacacaca 46 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 100 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca 142 Score = 77.8 bits (39), Expect = 1e-13 Identities = 42/43 (97%) Strand = Plus / Plus Query: 4 acacacacacacacacacacacacaaacacacacacacacaca 46 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 102 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca 144 Score = 77.8 bits (39), Expect = 1e-13 Identities = 42/43 (97%) Strand = Plus / Plus Query: 4 acacacacacacacacacacacacaaacacacacacacacaca 46 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 104 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca 146 Score = 77.8 bits (39), Expect = 1e-13 Identities = 42/43 (97%) Strand = Plus / Plus Query: 4 acacacacacacacacacacacacaaacacacacacacacaca 46 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 106 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca 148 Score = 77.8 bits (39), Expect = 1e-13 Identities = 42/43 (97%) Strand = Plus / Plus Query: 4 acacacacacacacacacacacacaaacacacacacacacaca 46 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 108 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca 150 Score = 77.8 bits (39), Expect = 1e-13 Identities = 42/43 (97%) Strand = Plus / Plus Query: 4 acacacacacacacacacacacacaaacacacacacacacaca 46 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 110 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca 152 Score = 77.8 bits (39), Expect = 1e-13 Identities = 42/43 (97%) Strand = Plus / Plus Query: 4 acacacacacacacacacacacacaaacacacacacacacaca 46 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 112 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca 154 Score = 77.8 bits (39), Expect = 1e-13 Identities = 42/43 (97%) Strand = Plus / Plus Query: 4 acacacacacacacacacacacacaaacacacacacacacaca 46 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 114 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca 156 Score = 75.8 bits (38), Expect = 5e-13 Identities = 41/42 (97%) Strand = Plus / Plus Query: 4 acacacacacacacacacacacacaaacacacacacacacac 45 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 116 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacac 157 Score = 69.9 bits (35), Expect = 3e-11 Identities = 41/43 (95%) Strand = Plus / Plus Query: 4 acacacacacacacacacacacacaaacacacacacacacaca 46 ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| Sbjct: 44 acacacacacacacacacacacaaacacacacacacacacaca 86 Score = 69.9 bits (35), Expect = 3e-11 Identities = 41/43 (95%) Strand = Plus / Plus Query: 4 acacacacacacacacacacacacaaacacacacacacacaca 46 ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 68 acacacacacacacacacaaacacacacacacacacacacaca 110 Score = 69.9 bits (35), Expect = 3e-11 Identities = 41/43 (95%) Strand = Plus / Plus Query: 4 acacacacacacacacacacacacaaacacacacacacacaca 46 ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 70 acacacacacacacacaaacacacacacacacacacacacaca 112 Score = 69.9 bits (35), Expect = 3e-11 Identities = 41/43 (95%) Strand = Plus / Plus Query: 4 acacacacacacacacacacacacaaacacacacacacacaca 46 ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 72 acacacacacacacaaacacacacacacacacacacacacaca 114 Score = 69.9 bits (35), Expect = 3e-11 Identities = 41/43 (95%) Strand = Plus / Plus Query: 4 acacacacacacacacacacacacaaacacacacacacacaca 46 ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 74 acacacacacacaaacacacacacacacacacacacacacaca 116 Score = 69.9 bits (35), Expect = 3e-11 Identities = 41/43 (95%) Strand = Plus / Plus Query: 4 acacacacacacacacacacacacaaacacacacacacacaca 46 ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 76 acacacacacaaacacacacacacacacacacacacacacaca 118 Score = 69.9 bits (35), Expect = 3e-11 Identities = 41/43 (95%) Strand = Plus / Plus Query: 4 acacacacacacacacacacacacaaacacacacacacacaca 46 ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 78 acacacacaaacacacacacacacacacacacacacacacaca 120 Score = 69.9 bits (35), Expect = 3e-11 Identities = 41/43 (95%) Strand = Plus / Plus Query: 4 acacacacacacacacacacacacaaacacacacacacacaca 46 ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 80 acacacaaacacacacacacacacacacacacacacacacaca 122 Score = 69.9 bits (35), Expect = 3e-11 Identities = 41/43 (95%) Strand = Plus / Plus Query: 4 acacacacacacacacacacacacaaacacacacacacacaca 46 ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 82 acacaaacacacacacacacacacacacacacacacacacaca 124 Score = 69.9 bits (35), Expect = 3e-11 Identities = 41/43 (95%) Strand = Plus / Plus Query: 4 acacacacacacacacacacacacaaacacacacacacacaca 46 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| Sbjct: 120 acacacacacacacacacacacacacacacacacacactcaca 162 Score = 69.9 bits (35), Expect = 3e-11 Identities = 41/43 (95%) Strand = Plus / Plus Query: 4 acacacacacacacacacacacacaaacacacacacacacaca 46 |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| Sbjct: 138 acacacacacacacacacactcacaaacacagacacacacaca 180 Score = 69.9 bits (35), Expect = 3e-11 Identities = 41/43 (95%) Strand = Plus / Plus Query: 4 acacacacacacacacacacacacaaacacacacacacacaca 46 |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| Sbjct: 186 acacacacacacacacacactcacaaacacagacacacacaca 228 >BF01055B2E01 Length = 834 Score = 73.8 bits (37), Expect = 2e-12 Identities = 40/41 (97%) Strand = Plus / Plus Query: 337 aacctcgtctcgatcgtacgttcggttgccgagatcatctc 377 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 383 aacctcgtttcgatcgtacgttcggttgccgagatcatctc 423 Database: est Posted date: Jul 14, 2011 2:25 PM Number of letters in database: 8,280,457 Number of sequences in database: 9484 Lambda K H 1.37 0.711 1.31 Gapped Lambda K H 1.37 0.711 1.31 Matrix: blastn matrix:1 -3 Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2 Number of Sequences: 9484 Number of Hits to DB: 405,136 Number of extensions: 17710 Number of successful extensions: 17710 Number of sequences better than 1.0e-10: 3 Number of HSP's gapped: 17679 Number of HSP's successfully gapped: 31 Length of query: 4018 Length of database: 8,280,457 Length adjustment: 18 Effective length of query: 4000 Effective length of database: 8,109,745 Effective search space: 32438980000 Effective search space used: 32438980000 X1: 11 (21.8 bits) X2: 15 (29.7 bits) X3: 50 (99.1 bits) S1: 12 (24.3 bits) S2: 35 (69.9 bits)