BLASTN 2.2.24 [Aug-08-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= DPGLEAN18491 (UTR included)
(1537 letters)
Database: est
9484 sequences; 8,280,457 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
BF14_3313_C1 101 3e-21
BF01032A2F07 78 5e-14
BF14_1626_C1 78 5e-14
BF01040A1G09 74 7e-13
BF01033A1F05 74 7e-13
BF01046A1H05 72 3e-12
BF14_1547_C2 70 1e-11
BF01012A2F10 68 5e-11
BF01010B1B03 68 5e-11
>BF14_3313_C1
Length = 755
Score = 101 bits (51), Expect = 3e-21
Identities = 51/51 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 578 aacaagtagtggttcgtgtaacctgtccctggaggagacgatctccaggtc 628
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 705 aacaagtagtggttcgtgtaacctgtccctggaggagacgatctccaggtc 755
>BF01032A2F07
Length = 768
Score = 77.8 bits (39), Expect = 5e-14
Identities = 39/39 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 942 aagaatgaacgggcagaggagaacatagctgatgttaag 980
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 12 aagaatgaacgggcagaggagaacatagctgatgttaag 50
>BF14_1626_C1
Length = 705
Score = 77.8 bits (39), Expect = 5e-14
Identities = 57/63 (90%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1358 tatatacacatatatatatgtatatatatatgtatgtgtatatatatacatatatatata 1417
|||||| | |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||
Sbjct: 699 tatatatatatatatatatatatatatatatgtatatatatatatatatatatatatata 640
Query: 1418 tgt 1420
|||
Sbjct: 639 tgt 637
>BF01040A1G09
Length = 753
Score = 73.8 bits (37), Expect = 7e-13
Identities = 55/61 (90%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1358 tatatacacatatatatatgtatatatatatgtatgtgtatatatatacatatatatata 1417
|||||| | |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||||
Sbjct: 578 tatatatatatatatatatgtatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 637
Query: 1418 t 1418
|
Sbjct: 638 t 638
Score = 73.8 bits (37), Expect = 7e-13
Identities = 55/61 (90%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1358 tatatacacatatatatatgtatatatatatgtatgtgtatatatatacatatatatata 1417
|||||| | |||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 645 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatacatatatatata 586
Query: 1418 t 1418
|
Sbjct: 585 t 585
Score = 67.9 bits (34), Expect = 5e-11
Identities = 46/50 (92%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1369 atatatatgtatatatatatgtatgtgtatatatatacatatatatatat 1418
|||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 577 atatatatatatatatatatgtatatatatatatatatatatatatatat 626
Score = 67.9 bits (34), Expect = 5e-11
Identities = 55/62 (88%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1357 gtatatacacatatatatatgtatatatatatgtatgtgtatatatatacatatatatat 1416
||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||
Sbjct: 597 gtatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 656
Query: 1417 at 1418
||
Sbjct: 657 at 658
>BF01033A1F05
Length = 770
Score = 73.8 bits (37), Expect = 7e-13
Identities = 55/61 (90%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1358 tatatacacatatatatatgtatatatatatgtatgtgtatatatatacatatatatata 1417
|||||| | |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||||
Sbjct: 487 tatatatatatatatatatgtatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 546
Query: 1418 t 1418
|
Sbjct: 547 t 547
Score = 73.8 bits (37), Expect = 7e-13
Identities = 55/61 (90%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1358 tatatacacatatatatatgtatatatatatgtatgtgtatatatatacatatatatata 1417
|||||| | |||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 554 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatacatatatatata 495
Query: 1418 t 1418
|
Sbjct: 494 t 494
Score = 71.9 bits (36), Expect = 3e-12
Identities = 48/52 (92%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1367 atatatatatgtatatatatatgtatgtgtatatatatacatatatatatat 1418
|||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 484 atatatatatatatatatatatgtatatatatatatatatatatatatatat 535
Score = 67.9 bits (34), Expect = 5e-11
Identities = 46/50 (92%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1369 atatatatgtatatatatatgtatgtgtatatatatacatatatatatat 1418
|||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 482 atatatatatatatatatatatatgtatatatatatatatatatatatat 531
Score = 67.9 bits (34), Expect = 5e-11
Identities = 55/62 (88%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1357 gtatatacacatatatatatgtatatatatatgtatgtgtatatatatacatatatatat 1416
||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||
Sbjct: 506 gtatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 565
Query: 1417 at 1418
||
Sbjct: 566 at 567
>BF01046A1H05
Length = 918
Score = 71.9 bits (36), Expect = 3e-12
Identities = 54/60 (90%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1359 atatacacatatatatatgtatatatatatgtatgtgtatatatatacatatatatatat 1418
||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 807 atatacatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 866
Score = 69.9 bits (35), Expect = 1e-11
Identities = 56/63 (88%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1358 tatatacacatatatatatgtatatatatatgtatgtgtatatatatacatatatatata 1417
|||||| | |||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||||
Sbjct: 873 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 814
Query: 1418 tgt 1420
|||
Sbjct: 813 tgt 811
>BF14_1547_C2
Length = 723
Score = 69.9 bits (35), Expect = 1e-11
Identities = 50/55 (90%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1367 atatatatatgtatatatatatgtatgtgtatatatatacatatatatatatgtt 1421
|||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 703 atatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatgtt 649
Score = 67.9 bits (34), Expect = 5e-11
Identities = 49/54 (90%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1365 acatatatatatgtatatatatatgtatgtgtatatatatacatatatatatat 1418
|||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 650 acatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 703
>BF01012A2F10
Length = 722
Score = 67.9 bits (34), Expect = 5e-11
Identities = 49/54 (90%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1367 atatatatatgtatatatatatgtatgtgtatatatatacatatatatatatgt 1420
|||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 464 atatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatgt 411
Score = 67.9 bits (34), Expect = 5e-11
Identities = 49/54 (90%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1365 acatatatatatgtatatatatatgtatgtgtatatatatacatatatatatat 1418
|||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 411 acatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 464
>BF01010B1B03
Length = 305
Score = 67.9 bits (34), Expect = 5e-11
Identities = 58/66 (87%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1358 tatatacacatatatatatgtatatatatatgtatgtgtatatatatacatatatatata 1417
|||||| | |||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||||
Sbjct: 191 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 132
Query: 1418 tgttaa 1423
| ||||
Sbjct: 131 tattaa 126
Database: est
Posted date: Jul 14, 2011 2:25 PM
Number of letters in database: 8,280,457
Number of sequences in database: 9484
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Sequences: 9484
Number of Hits to DB: 262,414
Number of extensions: 13547
Number of successful extensions: 13547
Number of sequences better than 1.0e-10: 10
Number of HSP's gapped: 13367
Number of HSP's successfully gapped: 20
Length of query: 1537
Length of database: 8,280,457
Length adjustment: 17
Effective length of query: 1520
Effective length of database: 8,119,229
Effective search space: 12341228080
Effective search space used: 12341228080
X1: 11 (21.8 bits)
X2: 15 (29.7 bits)
X3: 50 (99.1 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 34 (67.9 bits)