BLASTN 2.2.24 [Aug-08-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= DPGLEAN18578 (UTR included)
(3904 letters)
Database: est
9484 sequences; 8,280,457 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
BF14_2206_C1 1657 0.0
BF01026A1D04 753 0.0
>BF14_2206_C1
Length = 1051
Score = 1657 bits (836), Expect = 0.0
Identities = 849/852 (99%), Gaps = 1/852 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3054 aaccttactgcgaaaatagaagaatatgagagtgacgatgatgatgaaagctatgagcca 3113
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Sbjct: 1 aaccttactgcgaaaatagaagaatatgagagtgaccatgatgatgaaagctatgagcca 60
Query: 3114 gatgagactgctattgaatgttacacaacaccacttgatgagaaagactgtaccgtggat 3173
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Sbjct: 61 gatgagactgctattgaatgttacacaacaccacttgatgagaaagactgtaccgtggat 120
Query: 3174 gaatacataaaattcaaaaacacattatctgcactatcaaccaatgaacctacattgtac 3233
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Sbjct: 121 gaatacataaaattcaaaaacacattatctgcactatcaaccaatgaacctacattgtac 180
Query: 3234 catgctctgacaagtgttctgactgaggaacagaggaaacaattacatgcagtttttgta 3293
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Sbjct: 181 catgctctgacaagtgttctgactgaggaacagaggaaacaattacatgcagtttttgta 240
Query: 3294 ctagctgatcaacgcaaggcacaacaagatagtaaacggattgaacaaagtggcggttac 3353
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Sbjct: 241 ctagctgatcaacgcaaggcacaacaagatagtaaacggattgaacaaagtggcggttac 300
Query: 3354 tcatttacggttcccgcacaagtacctacaacatttaaatttggttcataattacaatgt 3413
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Sbjct: 301 tcatttacggttcccgcacaagtacctacaacatttaaatttggttcataattacaatgt 360
Query: 3414 tgaacagacatacataaattatttataattttatttcaaattactcgccattgaattagc 3473
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Sbjct: 361 tgaacagacatacataaattatttataattttatttcaaattactcgccattgaattagc 420
Query: 3474 attatcaacatttagcagtcaaatgaacagtttacataggaggagaatatatgcaacact 3533
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Sbjct: 421 attatcaacatttagcagtcaaatgaacagtttacataggaggagaatatatgcaacact 480
Query: 3534 gtttcagttttcaaatctaattatgaatacctactataaggtataagttatataattgct 3593
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Sbjct: 481 gtttcagttttcaaatctaattatgaatacctactataaggtataagttatataattgct 540
Query: 3594 ctcagtagatagtgtgtagtgtgataatgtcattaagctgacatagtaaaattgttaaag 3653
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Sbjct: 541 ctcagtagatagtgtgtagtgtgataatgtcattaagctgacatagtaaaattgttaaag 600
Query: 3654 cagataaatgatgttatattcaattacatattttgacatttttaaagatttatgatttct 3713
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Sbjct: 601 cagataaatgatgttatattcaattacatattttgacatttttaaagatttatgatttct 660
Query: 3714 aatgatcagtttttattatattaactgttaaaaca-ttttttttggaacaacagttacaa 3772
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Sbjct: 661 aatgatcagtttttattatattaactgttaaaacatttttttttggaacaacagttacaa 720
Query: 3773 atacatattttgtgtgggtttaaataatttgatattaaacaagaccaatccttggtgtaa 3832
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Sbjct: 721 atacatattttgtgtgggtttaaataatttgatattaaacaacaccaatccttggtgtaa 780
Query: 3833 attggcttatgaacatatgtaatacatgtattaatattttgtagatgtcagcaaatattc 3892
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Sbjct: 781 attggcttatgaacatatgtaatacatgtattaatattttgtagatgtcagcaaatattc 840
Query: 3893 ttgtaactaaag 3904
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Sbjct: 841 ttgtaactaaag 852
>BF01026A1D04
Length = 783
Score = 753 bits (380), Expect = 0.0
Identities = 380/380 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 455 tgttaaaatataatttattaaaaagtttaatgttatatacgaaaacatggacaccagaaa 514
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Sbjct: 1 tgttaaaatataatttattaaaaagtttaatgttatatacgaaaacatggacaccagaaa 60
Query: 515 gctgacggaaattttgcgagctactattgatcctaaccaaaggcaacaagcagaagaaca 574
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Sbjct: 61 gctgacggaaattttgcgagctactattgatcctaaccaaaggcaacaagcagaagaaca 120
Query: 575 gctttcccagattcataaaataattggatttgctccctctttgctgcaagtggttatgct 634
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Sbjct: 121 gctttcccagattcataaaataattggatttgctccctctttgctgcaagtggttatgct 180
Query: 635 taatgatgttacaatccctgtccgtcaagctggagttgtatatctgaagaatttggtaac 694
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Sbjct: 181 taatgatgttacaatccctgtccgtcaagctggagttgtatatctgaagaatttggtaac 240
Query: 695 ctcgggttggttagagaaagaggcagaagatggagagccaataccatttagtattcatga 754
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Sbjct: 241 ctcgggttggttagagaaagaggcagaagatggagagccaataccatttagtattcatga 300
Query: 755 acaggacagagccatgataagagatatcattgtggatgccatagtacaggcacctgatat 814
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Sbjct: 301 acaggacagagccatgataagagatatcattgtggatgccatagtacaggcacctgatat 360
Query: 815 aatcaaagttcagctctgtg 834
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Sbjct: 361 aatcaaagttcagctctgtg 380
Score = 313 bits (158), Expect = 1e-84
Identities = 166/170 (97%)
Strand = Plus / Plus
Query: 834 gctgatcaatctccagaatctgttaccatacaaaaacaaatacttaagtgtttctatggt 893
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Sbjct: 614 gctgatcaatctccagaatctgttaccatacaaaaacaaatacttaagtgtttctatggt 673
Query: 894 ctcataaagtttaatttaccactgggtttaatcacaaaagaaatatttacgaaatggatg 953
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Sbjct: 674 ctcataaagtttaatttaccactgggtttaatcacaaaannnntatttacgaaatggatg 733
Query: 954 gaagttctccgttctgtaatggagcagcctgtcccagaacacactttgca 1003
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Sbjct: 734 gaagttctccgttctgtaatggagcagcctgtcccagaacacactttgca 783
Database: est
Posted date: Jul 14, 2011 2:25 PM
Number of letters in database: 8,280,457
Number of sequences in database: 9484
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Sequences: 9484
Number of Hits to DB: 455,789
Number of extensions: 8752
Number of successful extensions: 8752
Number of sequences better than 1.0e-10: 2
Number of HSP's gapped: 8751
Number of HSP's successfully gapped: 3
Length of query: 3904
Length of database: 8,280,457
Length adjustment: 18
Effective length of query: 3886
Effective length of database: 8,109,745
Effective search space: 31514469070
Effective search space used: 31514469070
X1: 11 (21.8 bits)
X2: 15 (29.7 bits)
X3: 50 (99.1 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 35 (69.9 bits)