BLASTN 2.2.24 [Aug-08-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= DPGLEAN18607 (UTR included)
(1561 letters)
Database: est
9484 sequences; 8,280,457 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
BF14_1318_C1 1802 0.0
BF01023A1H11 252 1e-66
>BF14_1318_C1
Length = 922
Score = 1802 bits (909), Expect = 0.0
Identities = 918/922 (99%)
Strand = Plus / Minus
Query: 465 agaacattttacaatattataaaatcagattcggatatgattattaaattgttttatgtc 524
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Sbjct: 922 agaacattttacaatattataaaatcagattcggatatgattattaaattgttttatgtc 863
Query: 525 gtctttgttataacatgttcaactttagtctcggcttcgtatgaagataaaagatgcaaa 584
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Sbjct: 862 gtctttgttataacatgttcaactttagtctcggcttcgtatgaagataaaagatgcaaa 803
Query: 585 tgtgtgtgccccagtccagccgctgtcctcaacaacacagtgggttcagaccggaagtta 644
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Sbjct: 802 tgtgtgtgccccagtccagccgctgtcctcaacaacacagtgggttcagaccggaagtta 743
Query: 645 tacattggcaatgtcccacccaataaatgtaactgtgatggcgttattcttccacgagta 704
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Sbjct: 742 tacattggcaatgtcccacccaataaatgtaactgtgatggcgttattcttccacgagta 683
Query: 705 ggtgaattaatcaaaggccgtgagcaagaattttgtccccgctgtgaatgcaaatatgaa 764
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Sbjct: 682 ggtgaattaatcaaaggccgtgagcaagaattttgtccccgctgtgaatgcaaatatgaa 623
Query: 765 aacaggaacaccacaattataaaggttgtagtcataattgtaatttgggttattatgctt 824
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Sbjct: 622 aacaggaacaccacaattataaaggttgtagtcataattgtaatttgggttattatgctt 563
Query: 825 cttgtggcatacatgggattcctcatatgtctggatcccctcatcaacaaacgtgcaaaa 884
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Sbjct: 562 cttgtggcatacatgggattcctcatatgtctggatcccctcatcaacaaacgtgcaaaa 503
Query: 885 gcttcataccaagagcacactaatgaggatgatgaaagtacaatcagtgagccatcacat 944
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Sbjct: 502 gcttcataccaagagcacactaatgaggatgatgaaagtacaatcagtgagccatcacat 443
Query: 945 cacatgggtacccgaggaaatgttctgaaccgcgtcacacatcagcaagacaaatggaag 1004
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Sbjct: 442 cacatgggtacccgaggaaatgttctgaaccgcgtcacacatcagcaagacaaatggaag 383
Query: 1005 cgccaggtcagggaacagcgccgtaacatttatgataggcacactatgctcaattaggaa 1064
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Sbjct: 382 cgccaggtcagggaacagcgccgtaacatttatgataggcacactatgctcaattaggaa 323
Query: 1065 agagctatggtgacgagtcgattaaccaacccgaaatctgaataacatttgtcatttttt 1124
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Sbjct: 322 agagctatggtgacgagtcgattaaccaacccgaaatctgaataacatttgtcatttttt 263
Query: 1125 gtttacttataaatgaaatatttatttatcatgcagtcattatttatattatttacttta 1184
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Sbjct: 262 gtttacttataaatgaaatatttatttatcatgcagtcattatttatattatttacttta 203
Query: 1185 ttaatacaatgtttatcaattccaatttacactaattatcatcactcaactgataattac 1244
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Sbjct: 202 ttaatacaatgtttatcaattccaatttacaccaattatcatcactcaactgataattac 143
Query: 1245 aattgacactctctctaagtcccttattggtacaacttcatttaggttggtcaatcaatg 1304
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Sbjct: 142 aattgacactctctctaagtcccttattggtacaacttcatttaggttggtcaatcaatg 83
Query: 1305 tgggcccattaatgaaataagctatgtaaatttgaatgttcatcaagattttatacaaac 1364
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Sbjct: 82 tgggcccattaatgaaataagctatgtaaattnnnatgttcatcaagattttatacaaac 23
Query: 1365 atattacatgttcatattatac 1386
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Sbjct: 22 atattacatgttcatattatac 1
>BF01023A1H11
Length = 732
Score = 252 bits (127), Expect = 1e-66
Identities = 127/127 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1435 tcactggaactgttattgttcattgagatgtaataaatgtaaatgttatattccacatat 1494
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Sbjct: 1 tcactggaactgttattgttcattgagatgtaataaatgtaaatgttatattccacatat 60
Query: 1495 acatgtttcatgttaaaataagaaacattttgagatctacaaattaacttagtttataaa 1554
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Sbjct: 61 acatgtttcatgttaaaataagaaacattttgagatctacaaattaacttagtttataaa 120
Query: 1555 acattag 1561
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Sbjct: 121 acattag 127
Database: est
Posted date: Jul 14, 2011 2:25 PM
Number of letters in database: 8,280,457
Number of sequences in database: 9484
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Sequences: 9484
Number of Hits to DB: 265,882
Number of extensions: 6894
Number of successful extensions: 6894
Number of sequences better than 1.0e-10: 2
Number of HSP's gapped: 6894
Number of HSP's successfully gapped: 2
Length of query: 1561
Length of database: 8,280,457
Length adjustment: 17
Effective length of query: 1544
Effective length of database: 8,119,229
Effective search space: 12536089576
Effective search space used: 12536089576
X1: 11 (21.8 bits)
X2: 15 (29.7 bits)
X3: 50 (99.1 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 34 (67.9 bits)