BLASTN 2.2.24 [Aug-08-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= DPGLEAN18696 (UTR included)
(2641 letters)
Database: est
9484 sequences; 8,280,457 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
BF14_1481_C1 2680 0.0
>BF14_1481_C1
Length = 1388
Score = 2680 bits (1352), Expect = 0.0
Identities = 1379/1388 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 487 caaataactttaaaatggctttacatgtaccaaaagcaccgggtgtaccccaaatgttaa 546
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 caaataactttaaaatggctttacatgtaccaaaagcaccgggtgtaccccaaatgttaa 60
Query: 547 aagaaggagctcggatgttttccggtttagaagaagcagtataccgtaacataaatgcat 606
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 aagaaggagctcggatgttttccggtttagaagaagcagtataccgtaacataaatgcat 120
Query: 607 gcaaacaatttgcccaaagtgtgcgctcagcatatggcccgaatggcatgaataaaatga 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 gcaaacaatttgcccaaagtgtgcgctcagcatatggcccgaatggcatgaataaaatga 180
Query: 667 tcatcaatcacattgacaaacagtttgtcacaagtgatgctggtactatcatcagagaat 726
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 tcatcaatcacattgacaaacagtttgtcacaagtgatgctggtactatcatcagagaat 240
Query: 727 tagatgttgaacatccagctgccaagttaatggttctagctagtcaaatgcaagatgctg 786
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 tagatgttgaacatccagctgccaagttaatggttctagctagtcaaatgcaagatgctg 300
Query: 787 aggttggagatggtacaaactttgtaattgtattatctggagctcttcttgaggcagccg 846
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 aggttggagatggtacaaactttgtaattgtattatctggagctcttcttgaggcagccg 360
Query: 847 aagagcttctacgtctaggtgtgacgacgagcgaaattgcagaaggatacgaaaaggccc 906
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 aagagcttctacgtctaggtgtgacgacgagcgaaattgcagaaggatacgaaaaggccc 420
Query: 907 ttgataaatgcctagaaatcctaccccagttaatttgcgatgaaattaaagattgcagaa 966
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 ttgataaatgcctagaaatcctaccgcagttaatttgcgatgaaattaaagattgcagaa 480
Query: 967 atatggatactgttattaaaggcattaaaccatctatcatgtccaaacagtatggtaatg 1026
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 atatggatactgttattaaaggcattaaaccatctatcatgtccaaacagtatggtaatg 540
Query: 1027 aagacttcattgctgggctggtagcaaaagcttgtgtggctattctaccagaaaatacaa 1086
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 aagacttcattgctgggctggtagcaaaagcttgtgtggctattctaccagaaaatacaa 600
Query: 1087 catttaatgttgataatgtcaggatatgtaagatccttggtgctgggctactacagtctg 1146
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 601 catttaatgttgataatgtcaggatatgtaagatccttggtgctggactactacagtctg 660
Query: 1147 aggtattgtcaggaatggtgtttaagagagaagttgagggtgatgttgccagtgcatcaa 1206
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661 aggtattgtcaggaatggtgtttaagagagaagttgagggtgatgttgccagtgcatcaa 720
Query: 1207 aagccaaagtagctgtttattcctgtcctgttgacatcactcaaactgaaacaaagggaa 1266
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 721 aagccaaagtagctgtttattcctgtcctgtcgacatcactcaaactgaaacaaagggaa 780
Query: 1267 cagtactcatcaaaacagccgatgaactacttaactttagtaaaggagaggagtctttgt 1326
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 781 cagtactcatcaaaacagccgatgaactacttaacttcagtaaaggagaggagtctttgt 840
Query: 1327 tagaaaaacagattaaagctattgccgacactggtgtaaaagttattgttgctggagcta 1386
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 841 tagaaaaacagattaaagctattgccgacactggtgtaaaagttattgttgctggagcta 900
Query: 1387 agtttggtgatatggctttacatttccttaataaatataacattatggcggttcgtctca 1446
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 901 agtttggtgatatggctttacatttccttaataaatataacattatggcggttcgtctca 960
Query: 1447 actcaaagtttgatattcgtcgtctcgcaaagactgttaatgctactgtactgccaaaat 1506
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 961 actcaaagtttgatattcgtcgtctcgcaaagactgttaatgctactgtactgccaaaat 1020
Query: 1507 tgactactccaacggctgaagagcttggatactgtgacacggtcagagttgatgaagtcg 1566
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1021 tgacaactccaacggctgaagagcttggatactgtgacacggtcagagttgatgaagtcg 1080
Query: 1567 gtgatacaagagtagttgtcttcagtatggaaagcagtgaatctagaatttcaacagttg 1626
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1081 gtgatacaagagtagttgtcttcagtatggaaagcagtgaatctagaatttcaacagttg 1140
Query: 1627 ttatcagaggttcaactgacaattacatggatgacattgaaagagctattaatgacggtg 1686
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1141 ttatcagaggttcaactgacaattacatggatgacattgaaagagctattaatgacggtg 1200
Query: 1687 ttaacacattcaagggaatagcaagagacggacgattcttggctggcgctggagctactg 1746
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1201 ttaacacattcaagggaatagcaagagatggacgattcttggctggcgctggagctactg 1260
Query: 1747 aaattgaattagctcaacagcttttacagtatgcagatactcttccaggacttgagcaat 1806
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||
Sbjct: 1261 aaattgaattagctcaacagcttttacagtatgcagatactcttccgggactcgagcaat 1320
Query: 1807 atgcagttcgtaagtttgctgtagctcttgagggtgttccgaaagctcttgcagaaaatt 1866
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1321 atgcagttcgtaaatttgctgtagctcttgagggtgttccgaaagctcttgcagaaaatt 1380
Query: 1867 ctggagca 1874
||||||||
Sbjct: 1381 ctggagca 1388
Database: est
Posted date: Jul 14, 2011 2:25 PM
Number of letters in database: 8,280,457
Number of sequences in database: 9484
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Sequences: 9484
Number of Hits to DB: 407,501
Number of extensions: 14837
Number of successful extensions: 14837
Number of sequences better than 1.0e-10: 1
Number of HSP's gapped: 14835
Number of HSP's successfully gapped: 1
Length of query: 2641
Length of database: 8,280,457
Length adjustment: 17
Effective length of query: 2624
Effective length of database: 8,119,229
Effective search space: 21304856896
Effective search space used: 21304856896
X1: 11 (21.8 bits)
X2: 15 (29.7 bits)
X3: 50 (99.1 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 34 (67.9 bits)