BLASTN 2.2.24 [Aug-08-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= DPGLEAN19304 (UTR included)
(2371 letters)
Database: est
9484 sequences; 8,280,457 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
BF14_1524_C1 3311 0.0
BF01019B2D06 565 e-160
>BF14_1524_C1
Length = 1719
Score = 3311 bits (1670), Expect = 0.0
Identities = 1709/1718 (99%), Gaps = 3/1718 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 514 tacctcgttcctttggtcttgccgaaacaatttttgttaaaaatgggacgaagttgttgg 573
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2 tacctcgttcctttggtcttgccgaaacaatttttgttaaaaatgggacgaagttgttgg 61
Query: 574 cagcaacaacatcccacaatctaccaaataatcaacaagttaggcatttgaatgtccatg 633
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 62 cagcaacaacatcccacaatctaccaaataatcaacaagttaggcatttgaatgtccatg 121
Query: 634 aatatgtgagctacacacttcttagggacaatggcattcctgtgcctaaatttaacattg 693
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct: 122 aatatgtgagctacacacttcttagggacaatggcattcccgtgcctaaatttaacattg 181
Query: 694 ccaagacccaggaagaggcagtcaagtatgcacaagaactgaacaccaaagatattgtac 753
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 182 ccaagacccaggaagaggcagtcaagtatgcacaagaactgaacaccaaagatattgtac 241
Query: 754 taaaggctcaggttctggctggaggtagaggaaaaggttcattcaaaaatgggctgaaag 813
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 242 taaaggctcaggttctggctggaggtagaggaaaaggttcattcaaaaatgggctgaaag 301
Query: 814 gtggtgttagaatggttgacaaacctgaggtggctggagatattgtcggcaagatgctca 873
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 302 gtggtgttagaatggttgacaaacctgaggtggctggagatatcgtcggcaagatgctca 361
Query: 874 agcagtacttggtgacgaagcagacaggtgcagcaggtcgtatttgtaacatggtcatgg 933
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct: 362 agcagtacttggtgacgaagcagacgggtgcagcaggtcgcatttgtaacatggtcatgg 421
Query: 934 ttaccgagaggaagttcccacgcagagaattctatgtagccatcatgatggaaaggagtt 993
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 422 ttaccgagaggaagttcccacgcagagagttctatgtagccatcatgatggaaaggagtt 481
Query: 994 ttaacggtccggtaatcattgcatcatctcaaggaggtgtcaacattgaggatgtggctg 1053
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 482 ttaacggtccggtaatcattgcatcatctcaaggaggtgtcaacattgaggatgtggctg 541
Query: 1054 ccgagaatcccgatgccatcacatatgaacccatagatattgtcaccggcatcactgatg 1113
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 542 ccgagaatcccgatgccatcacatatgaacccatagatattgtcaccggcatcactgatg 601
Query: 1114 aacaaatatcccgtgttattaacaagataggacttcaagaacatgctccagcggctagtg 1173
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 602 aacaaatatcccgtgttattaacaagataggacttcaagaacatgctccagcggctagtg 661
Query: 1174 atatgatgaagaaaatgtatgacttgttctgtaagaaagatgctttactgattgaagtca 1233
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 662 atatgatgaagaaaatgtatgacttgttctgtaagaaagatgctttactgattgaagtca 721
Query: 1234 acccttatgccgaggacgctctaacaggacaattcttctgcctggatgctaagtttagat 1293
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 722 acccttatgccgaggacgctctaacaggacaattcttctgcctggatgctaagtttagat 781
Query: 1294 ttgacgacaacgctcagtttagacagaaggaactcttcaagcttagagatatttcccaag 1353
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 782 ttgacgacaacgctcagtttagacagaaggaactcttcaagcttagagatatttcccaag 841
Query: 1354 aagaccccaaagagattgaggcagccaagtttgacttgaactacatcgctcttgacggta 1413
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 842 aagaccccaaagagattgaggcagccaagtttgacttgaactacatcgctcttgacggta 901
Query: 1414 gtatcggttgtatggtgaatggagctggtcttgctatggccactatggatatcatcaaac 1473
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 902 gtatcggttgtatggtgaatggagctggtcttgctatggccactatggatatcatcaaac 961
Query: 1474 tatacggaggggacccagccaacttcctcgacgttggaggaggcgccaccgctcaggccg 1533
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 962 tatacggaggggacccagccaacttcctcgacgttggaggaggcgccaccgctcaggccg 1021
Query: 1534 tctcggaggcattcaagattatcttatcagacccaaaggtgtctgctatcttagtgaaca 1593
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1022 tctcggaagcattcaagattatcttatcagacccaaaggtgtctgctatcttagtgaaca 1081
Query: 1594 tcttcggaggaattatgcgctgtgacgtcatcgccgagggtatcatcaacgctgcgaaga 1653
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1082 tcttcggaggaattatgcgctgtgacgtcatcgccgagggtatcatcaacgctgcgaaga 1141
Query: 1654 acctcaacatccaaataccagtgattgtacgacttcagggtaccaaagtcaatgaggctc 1713
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1142 acctcaacatccaaataccagtgattgtacgacttcagggtaccaaagtcaatgaggctc 1201
Query: 1714 gcaagttgatcgcggattcgggtctgcgcattgtacccagagacgacctggacgaggcgg 1773
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1202 gcaagttgatcgcggattcgggtctgcgcattgtacccagagacgacctggacgaggcgg 1261
Query: 1774 cccagctcgccgtacaactctccgagatcgtgtccctcgccaagaaagccggagtcgagg 1833
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1262 cccagctcgccgtacaactctccgagatcgtgtccctcgccaagaaagccggagtcgagg 1321
Query: 1834 tcaaattcgatatccctaaatacatgttagaaaagtaaagccataaagtattaccataat 1893
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1322 tcaaattcgatatccctaaatacatgttagaaaagtaaagccataaagtattaccataat 1381
Query: 1894 caaaaatgaatatt-aaaaaaaaaaatctgttaatctcattcacctctttcgaatatgga 1952
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1382 caaaaatgaatattaaaaaaaaaaaatctgttaatctcattcacctctttcgaatatgga 1441
Query: 1953 acaccacgcttgttgttgatatagttaatcatatgtaagaatcatgcgctgtgttattta 2012
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1442 acaccacgcttgttgttgatatagttaatcatatgtaagaatcatgcgctgtgttattta 1501
Query: 2013 ttgtagatgacatttagtttgtaggtacaaaatgtttcatttatatttttgatcgtttta 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1502 ttgtagatgacatttagtttgtaggtacaaaatgtttcatttatatttttgatcgtttta 1561
Query: 2073 tttgtaattgttgtattttatt-aaataagtaacagttcttgtttacatgtttattataa 2131
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1562 tttgtaattgttgtattttattaaaataagtaacagttcttgtttacatgtttattataa 1621
Query: 2132 cctttagtgtattaagcactgttctatgataattgtagtaaaa-ttttgaagccaaacat 2190
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 1622 cctttagtgtattaagcactgttctatgataattgtagtaaaatttttgaagccaaacat 1681
Query: 2191 ttactgtccactttggtgttccttgtactcgccttttt 2228
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1682 ttactgtccactttggtgttccttgtactcgccttttt 1719
>BF01019B2D06
Length = 608
Score = 565 bits (285), Expect = e-160
Identities = 288/289 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 547 ttgttaaaaatgggacgaagttgttggcagcaacaacatcccacaatctaccaaataatc 606
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 ttgttaaaaatgggacgaagttgttggcagcaacaacatcccacaatctaccaaataatc 60
Query: 607 aacaagttaggcatttgaatgtccatgaatatgtgagctacacacttcttagggacaatg 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 aacaagttaggcatttgaatgtccatgaatatgtgagctacacacttcttagggacaatg 120
Query: 667 gcattcctgtgcctaaatttaacattgccaagacccaggaagaggcagtcaagtatgcac 726
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 gcattcccgtgcctaaatttaacattgccaagacccaggaagaggcagtcaagtatgcac 180
Query: 727 aagaactgaacaccaaagatattgtactaaaggctcaggttctggctggaggtagaggaa 786
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 aagaactgaacaccaaagatattgtactaaaggctcaggttctggctggaggtagaggaa 240
Query: 787 aaggttcattcaaaaatgggctgaaaggtggtgttagaatggttgacaa 835
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 aaggttcattcaaaaatgggctgaaaggtggtgttagaatggttgacaa 289
Database: est
Posted date: Jul 14, 2011 2:25 PM
Number of letters in database: 8,280,457
Number of sequences in database: 9484
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Sequences: 9484
Number of Hits to DB: 347,744
Number of extensions: 9049
Number of successful extensions: 9049
Number of sequences better than 1.0e-10: 2
Number of HSP's gapped: 9046
Number of HSP's successfully gapped: 2
Length of query: 2371
Length of database: 8,280,457
Length adjustment: 17
Effective length of query: 2354
Effective length of database: 8,119,229
Effective search space: 19112665066
Effective search space used: 19112665066
X1: 11 (21.8 bits)
X2: 15 (29.7 bits)
X3: 50 (99.1 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 34 (67.9 bits)