BLASTN 2.2.24 [Aug-08-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= DPGLEAN19460 (UTR included)
(1363 letters)
Database: est
9484 sequences; 8,280,457 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
BF01014B2D12 135 2e-31
BF14_314_C1 78 4e-14
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>BF01014B2D12
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Query: 147 a 147
|
Sbjct: 181 a 181
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|
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Query: 147 a 147
|
Sbjct: 249 a 249
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Sbjct: 197 cacacacactcacaaacacagacacacacacaaacacacaaacacagacacaaacacaca 256
Query: 147 acata 151
|||||
Sbjct: 257 acata 261
Score = 67.9 bits (34), Expect = 4e-11
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Query: 18 agacacgcgcacacacacacacacattcacacacatacacacatacccacacacacacac 77
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Query: 78 acacacacatacacacatacactcacac-acatacacacacacatacacacaca 130
| ||||||| ||||| | ||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||
Sbjct: 228 aaacacacaaacacagacacaaacacacaacatactcacacacaaacacacaca 281
>BF14_314_C1
Length = 765
Score = 77.8 bits (39), Expect = 4e-14
Identities = 66/75 (88%)
Strand = Plus / Plus
Query: 68 acacacacacacacacacatacacacatacactcacacacatacacacacacatacacac 127
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Sbjct: 328 acacacacacacacacaaatacaaatacacacacacacaaatacaaatacacacacacac 387
Query: 128 acacacacatacaca 142
|||||||||||||||
Sbjct: 388 acacacacatacaca 402
Score = 69.9 bits (35), Expect = 1e-11
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Strand = Plus / Plus
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Sbjct: 300 acacacacacacacacacaagaacaaatacacacacacacacacaaatacaaatacacac 359
Query: 94 atacactcacacacatacacacacacatacacacacacacaca 136
| |||| | ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||
Sbjct: 360 acacacaaatacaaatacacacacacacacacacacatacaca 402
>BF01015A2C08
Length = 709
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Identities = 49/54 (90%)
Strand = Plus / Minus
Query: 65 cacacacacacacacacacacatacacacatacactcacacacatacacacaca 118
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Sbjct: 513 cacacacacacagacacacacagacacacacacacacacacacagacacacaca 460
Database: est
Posted date: Jul 14, 2011 2:25 PM
Number of letters in database: 8,280,457
Number of sequences in database: 9484
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Sequences: 9484
Number of Hits to DB: 185,541
Number of extensions: 5729
Number of successful extensions: 5729
Number of sequences better than 1.0e-10: 3
Number of HSP's gapped: 5604
Number of HSP's successfully gapped: 39
Length of query: 1363
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Length adjustment: 17
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Effective length of database: 8,119,229
Effective search space: 10928482234
Effective search space used: 10928482234
X1: 11 (21.8 bits)
X2: 15 (29.7 bits)
X3: 50 (99.1 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 34 (67.9 bits)