BLASTN 2.2.24 [Aug-08-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= DPGLEAN20147 (UTR included)
(2197 letters)
Database: est
9484 sequences; 8,280,457 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
BF14_115_C1 3356 0.0
BF14_115_C2 178 2e-44
>BF14_115_C1
Length = 2477
Score = 3356 bits (1693), Expect = 0.0
Identities = 1717/1725 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 473 aacgtctagcactctgaaatggacgaacatgaagaaggaagcgatggataattatgtaac 532
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Sbjct: 1 aacgtctagcactctgaaatggacgaacatgaagaaggaagcgatggataattatgtaac 60
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Sbjct: 121 gcttcttggacaactcagacctgactacacatcttgcgctgtatcaggaactaagagtta 180
Query: 653 taatgtctttgaagtactagaaaatattgaaaacgcttcacttattatatgggaaccatg 712
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Sbjct: 181 taatgtctttgaagtactagaaaatattgaaaacgcttcacttattatatgggaaccatg 240
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Query: 1013 gaggaacgacgacgacgtcgctgcgaccgtcaccacagaaatagaatacaaatataatta 1072
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Query: 1073 cactttatcctggggtcacggtcatggtgtagccatcggtttgaatacgaccatagagat 1132
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Sbjct: 601 cactttatcctggggtcacggtcatggtgtagccatcggtttgaatacgaccatagagat 660
Query: 1133 gagcgacgggactgtgttcccgcaaatcgaatgggcaaatccatttacagaagaacgaaa 1192
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Query: 1193 ggaacttttcaaattggagaaatatctcgaaccggggacggcttgcaacgttaccttccg 1252
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Query: 1253 tggcaattacaccaatcgtgatgtacagtacaccgcgaaactggtgacgtactataaagg 1312
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Query: 1313 taacaacgcacgttcaagggaaatgaggggagagagaattgaaaataccgtcgaggtcga 1372
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Query: 1373 ggccgtattcggtgaaatatattacacggttaacaacacgcttgtccctacaacgacgac 1432
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Sbjct: 901 ggccgtattcggtgaaatatattacacggttaacaacacgcttgtccctacaacgacgac 960
Query: 1433 caccacgactactacgactaccaccagcaccactaccacccaggctccaccaccaccacc 1492
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Query: 1493 gccgttggatgagaaaaacgacgtgggcatgataatggacagcaatgacatattaggaga 1552
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Sbjct: 1021 gccgttggatgagaaaaacgacgtgggcatgataatggacagcaatgacatattaggaga 1080
Query: 1553 tagcagcgaagatatggttaaagcaccgcccgtcaaagaagacatcaatcgctcagtcgt 1612
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Sbjct: 1081 tagcagcgaagatatggttaaagcacctcccatcaaagaagacatcaatcgctcagtcgt 1140
Query: 1613 cggaggtctaggcagcaagcctaatggtgccaactttagaaccgcatcgcttttagtatt 1672
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Sbjct: 1141 cggaggtctaggcagcaagcctaatggtgccaactttagaaccgcatcgcttttagtatt 1200
Query: 1673 tttgccggtatttgcccttctatagattatgtaaccatatttagcttccctgtaaataga 1732
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Sbjct: 1201 tttgccgatatttgcccttctatagattatttaaccatatttagcttccctgtaaataga 1260
Query: 1733 aaatatatcactgatattatagttgcttgacgttactacatgtgttgcaactaggcttat 1792
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Sbjct: 1261 aaatatatcactgatattatagttgcttgacgttactacatgtgttgcaactaggcttat 1320
Query: 1793 tgcagttgttgattccgagtacagaaaacctgtatcggtttgttttgtaaataaagaaac 1852
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Sbjct: 1321 tgcagttgttgattccgagtacagaaaacctgtatcggtttgttttgtaaataaagaaac 1380
Query: 1853 gtttatgtttccgacacattcctgttaaataattccattccaattgtaaaaaaaaaagat 1912
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Sbjct: 1381 gtttatgtttccgacacattcctgttaaataattccattccaattgtaaaaaaaaaagat 1440
Query: 1913 aaaaatttggactaataaataccagatgtatataggttttgtatatagttaagattatat 1972
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Sbjct: 1441 aaaaatttggactaataaataccagatgtatataggttttgtatatagttaagattatat 1500
Query: 1973 ggaggtcgcagagcgactggaaaatcaatttgattgcaaacatcaatttggtagctgatc 2032
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Sbjct: 1501 ggaggtcgcagagcgactggaaaatcaatttgattgcaaacatcaatttggtagctgatc 1560
Query: 2033 aactggattgaggttagcgtatggcactgttaccaataacccacaacattcaattgcttt 2092
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Sbjct: 1561 aactggattgaggttagcgtatggcactgttaccaataacccacaacattcaattgcttt 1620
Query: 2093 ttcatacatttatctgttgcggtttcactaatattatctaacctataatgacttcatttc 2152
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Sbjct: 1621 ttcatacatttatctgttgcggtttcactaatattatctaacctataatgacttcatttc 1680
Query: 2153 aataccaaaaactttccccgcacaccttacggtaaacgtgattat 2197
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Sbjct: 1681 aataccaaaaactttccccgcacaccttacggtaaacgtgattat 1725
>BF14_115_C2
Length = 342
Score = 178 bits (90), Expect = 2e-44
Identities = 96/99 (96%)
Strand = Plus / Plus
Query: 2099 catttatctgttgcggtttcactaatattatctaacctataatgacttcatttcaatacc 2158
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Sbjct: 1 catttatctgttgcggtttcactaatattatctaacctataatgacttnnnttcaatacc 60
Query: 2159 aaaaactttccccgcacaccttacggtaaacgtgattat 2197
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Sbjct: 61 aaaaactttccccgcacaccttacggtaaacgtgattat 99
Database: est
Posted date: Jul 14, 2011 2:25 PM
Number of letters in database: 8,280,457
Number of sequences in database: 9484
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Sequences: 9484
Number of Hits to DB: 265,298
Number of extensions: 5294
Number of successful extensions: 5294
Number of sequences better than 1.0e-10: 2
Number of HSP's gapped: 5294
Number of HSP's successfully gapped: 2
Length of query: 2197
Length of database: 8,280,457
Length adjustment: 17
Effective length of query: 2180
Effective length of database: 8,119,229
Effective search space: 17699919220
Effective search space used: 17699919220
X1: 11 (21.8 bits)
X2: 15 (29.7 bits)
X3: 50 (99.1 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 34 (67.9 bits)