BLASTN 2.2.24 [Aug-08-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= DPGLEAN21116 (UTR included)
(3625 letters)
Database: est
9484 sequences; 8,280,457 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
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>BF14_1179_C1
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>BF01060A1A06
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Sbjct: 1179 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 1139
>BF01010A2B06
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Strand = Plus / Minus
Query: 3568 atatatatatatatatatatatatatatttatatatatatat 3609
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Sbjct: 421 atatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 380
Score = 75.8 bits (38), Expect = 4e-13
Identities = 41/42 (97%)
Strand = Plus / Minus
Query: 3566 atatatatatatatatatatatatatatatttatatatatat 3607
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Sbjct: 421 atatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 380
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Query: 3566 atatatatatatatatatatatatatatatttatatatatat 3607
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Sbjct: 380 atatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 421
Score = 75.8 bits (38), Expect = 4e-13
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Query: 3568 atatatatatatatatatatatatatatttatatatatatat 3609
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Sbjct: 380 atatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 421
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Sbjct: 410 tatatatatatatatatatatatatatatattaatatatat 370
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Query: 3565 tatatatatatatatatatatatatatatatttatatatat 3605
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Sbjct: 420 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 380
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Score = 69.9 bits (35), Expect = 3e-11
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Query: 3572 atatatatatatatatatatatatttatatatatatatg 3610
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Sbjct: 770 atatatatatatatatatatatatatatatatatatatg 808
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Score = 69.9 bits (35), Expect = 3e-11
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Query: 3567 tatatatatatatatatatatatatatatttatatatatatat 3609
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Sbjct: 461 tatatatatatatttatatacatatatatttatatatatatat 503
Database: est
Posted date: Jul 14, 2011 2:25 PM
Number of letters in database: 8,280,457
Number of sequences in database: 9484
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Sequences: 9484
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Number of successful extensions: 20768
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Number of HSP's gapped: 19466
Number of HSP's successfully gapped: 1374
Length of query: 3625
Length of database: 8,280,457
Length adjustment: 18
Effective length of query: 3607
Effective length of database: 8,109,745
Effective search space: 29251850215
Effective search space used: 29251850215
X1: 11 (21.8 bits)
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S1: 12 (24.3 bits)
S2: 35 (69.9 bits)