BLASTN 2.2.24 [Aug-08-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= DPGLEAN21508 (UTR included)
(5836 letters)
Database: est
9484 sequences; 8,280,457 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
BF14_3501_C1 3081 0.0
BF01040B2E06 1328 0.0
BF14_1861_C1 214 1e-54
BF01005A2B10 194 1e-48
>BF14_3501_C1
Length = 1595
Score = 3081 bits (1554), Expect = 0.0
Identities = 1584/1594 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 794 tttggtaaattcatatggtcctgaactagacacacttagagaaggagatactcttggtgt 853
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2 tttggtaaattcatatggtcctgaactagacacacttagagaaggagatactcttggtgt 61
Query: 854 tatgagatcttgtaagggggagctgtttttttatataaatggtagatgcctaggtgtggc 913
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 62 tatgagatcttgtaagggggagctgtttttttatataaatggtagatgcctaggtgtggc 121
Query: 914 tgcttgtgatctacccccaagattgtttgctgtcattgatttgtacggacagtgtgtgca 973
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 122 tgcttgtgatctacccccaagattgtttgctgtcattgatttgtacggacagtgtgtgca 181
Query: 974 agtatcaataattcacacaactggtatgagaacaataatggagagtagtatggatcagat 1033
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 182 agtatcaataattcacacaactggtatgagaacaataatggagagtagtatggatcagat 241
Query: 1034 tgaggaagatccaaacaatgatgatacattaacacctactgaagaagccagtgctgtacc 1093
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 242 tgaggaagatccaaacaatgatgatacattaacacctactgaagaagccagtgctgtacc 301
Query: 1094 ggaatcatcaacatccaaggagcaacaggaagtctatatttcaatgcctgattcgtcatc 1153
||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||
Sbjct: 302 ggaatcatcgacatccaaggagcgacaggaagtctatatttctatgcccgattcgtcatc 361
Query: 1154 catcttagcttctcatgatcgtctacgtttccatcctagatgtggaattttagtcaaact 1213
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 362 catcttagcttctcatgatcgtctacgtttccatcctagatgtggaattttagtcaaact 421
Query: 1214 ttcttctaataacaagactgcggagagagctcgaccattagacgattacaacaacggcgt 1273
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 422 ttcttctaataacaagactgcggagagagctcgaccattagacgattacaacaacggcgt 481
Query: 1274 cgttatgacgcaccggccgctatacgacaacgagctttttgagattcgtatagacagact 1333
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 482 cgttatgacgcaccggccgctatacgacaacgagctttttgagattcgtatagacagact 541
Query: 1334 ggtggacaagtggagtggcagtatagaggtcggcgtgacaacccacaacccggcaaccat 1393
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 542 ggtggacaagtggagtggcagtatagaggtcggcgtgacaacccacaacccggcaaccat 601
Query: 1394 tcgcttcccgtcaactatgacgaacatcgacaccggcactattatgatgtcgggttgcaa 1453
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 602 tcgcttcccgtcaactatgacgaacatcgacaccggcactatcatgatgtcgggttgcaa 661
Query: 1454 ggtgttgctcaatggacatgggacatgtatggaatatgggaacttcaatcttgatgaact 1513
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 662 ggtgttgctcaatggacatgggacatgtatggaatatgggaacttcaatcttgatgaact 721
Query: 1514 tcgggaaggtgacacagtgggtatgctgaggaagtccacaggcaagctgcactacttcat 1573
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 722 tcgggaaggtgacacagtgggtatgctgaggaagtccacaggcaagctgcactacttcat 781
Query: 1574 taatggtatagatcaaggtgtagcgaccgacaaagtggagcagcaagtatggggcgtcgt 1633
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 782 taatggtatagatcaaggtgtagcgaccgacaaagtggagcagcaagtatggggcgtcgt 841
Query: 1634 cgacttgtatggcatgacagtcaaggtatctatagtggatccttgtgaggatatcgatag 1693
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 842 cgacttgtatggcatgacagtcaaggtatctatagtggatccttgtgaggatatcgatag 901
Query: 1694 taatatcaacaacatgcccactgtatcgactgtacccgatcttcctgctcctagtagatt 1753
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 902 taatatcaacaacatgcccactgtatcgactgtacccgatcttcctgctcctagtagatt 961
Query: 1754 cacaccgaggatagatgaagatagccttttatttcatacgctgcgtgattcgtatgttat 1813
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 962 cacaccgaggatagatgaagatagccttttatttcatacgctgcgtgattcgtatgttat 1021
Query: 1814 tattattaacgatggtaagactgctcataggcctaatgctttcgaatacttcaacaacgg 1873
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1022 tattattaacgatggtaagactgctcataggcctaatgctttcgaatacttcaacaacgg 1081
Query: 1874 cgtagtgatgacgaacagatctctacgaaccaacgagttgttccaagtgcgactcgatct 1933
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1082 cgtagtgatgacgaacagatctctacgtaccaacgagttgttccaagtgcgactcgatct 1141
Query: 1934 ggtggtgcccaaatgggctggaagcattgagataggagtcacgcagcacacttctaatga 1993
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1142 ggtggtgcccaaatgggctggaagcattgagataggagtcacgcagcacacttctaatga 1201
Query: 1994 tattaaaattccatttaaaatgagcaatgccaaatcaggcacttgggtcatgtccggtga 2053
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1202 tattaaaattccatttaaaatgagcaatgccaaatcaggcacttgggtcatgtccggtga 1261
Query: 2054 agacgttatacaggacgcgatgattattataccaaaatacgtcagaaatctgaatagatt 2113
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1262 agacgttatacaggacgcgatgattattataccaaaatacgtcagaaatctgaatagatt 1321
Query: 2114 agtggaaggggacactgtaggagtgatgcgaaaagatatgggcattctacatttttttgt 2173
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1322 agtggaaggggacactgtaggagtgatgcgaaaagatatgggcattctacatttttttgt 1381
Query: 2174 gaatggggtcgatcaggggcctgctgcttttaatataccagaacacgtttttgggatcat 2233
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1382 gaatggagtcgatcaggggcctgctgcttttaatataccagaacacgtttttgggatcat 1441
Query: 2234 tgatttgtacggtcgtgtggctcaggctacaatagtggattgctattcaccaccgaccac 2293
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1442 tgatttgtacggtcgtgtggctcaggctacaatagtggattgctattcaccaccgaccac 1501
Query: 2294 ctactcgcccgactcgcctatttcaacggagtccaatgcaacgatttatcccgagatgtg 2353
|||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1502 ctactcgcccgagtctcctatttcaacggagtccaatgcaacgatttatcccgagatgtg 1561
Query: 2354 tttccatcgcgtgcacggtcgcaacgctcgtctg 2387
|||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 1562 tttccatcgcgtgcacggtcgcaatgctcgtctg 1595
>BF01040B2E06
Length = 674
Score = 1328 bits (670), Expect = 0.0
Identities = 673/674 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 4818 ggtttcgaggggcagagtctggagagcgaatgggaagcttttggtgaaggttgtgagcat 4877
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 ggtttcgaggggcagagtctggagagcgaatgggaagcttttggtgaaggttgtgagcat 60
Query: 4878 ctacatttagtattgaagtactggaattaccttgttctaccttatccggaattgcgtcag 4937
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 ctacatttagtattgaagtactggaattaccttgttctaccttatccggaattgcgtcag 120
Query: 4938 gcagtctcttggggtcaagtccgatgttattgcagcaactgccagcctgatgcccagccc 4997
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 gcagtctcttggggtcaagtccgatgttattgcagcaactgccagcctgatgcccagccc 180
Query: 4998 ccactagctgggtgggttcgtatagagcgtatagacggagttggtgcggccacacgaggc 5057
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 ccactagctgggtgggttcgtatagagcgtatagacggagttggtgcggccacacgaggc 240
Query: 5058 tggtggcacgtgacgcgaagtacgctcggcgcggctcaggctcaccgcaacgacgtcaac 5117
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 tggtggcacgtgacgcgaagtacgctcggcgcggctcaggctcaccgcaacgacgtcaac 300
Query: 5118 ccggctaagagaccgcgagcactcgctccagcaccgaccagcggatcacttggtgacata 5177
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 ccggctaagagaccgcgagcactcgctccagcaccgaccagcggatcacttggtgacata 360
Query: 5178 tggctggatgaagaagggaaacctcatcatacgatattggctatagaaattgacatcgaa 5237
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 tggctggatgaagaagggaaacctcatcatacgatattggctatagaaattgacatcgaa 420
Query: 5238 ggaaatgaagctgagaaagatcgacttttagctttcttaatccacatgaagtcacatgca 5297
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 ggaaatgaagctgagaaagatcgacttttagctttcttaatccacatgaagtcacatgca 480
Query: 5298 gttttcgtcgatgataatccttctagtatagatgaataaataaaacaaaccacaatattt 5357
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 gttttcgtcgatgataatccttctagtatagatgaataaataaaacaaaccacaatattt 540
Query: 5358 aaaaagtaaatacgaaatgttacaagcagaaggtcctaagtgcctaaacttcagagtact 5417
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 aaaaagtaaagacgaaatgttacaagcagaaggtcctaagtgcctaaacttcagagtact 600
Query: 5418 acttaagtgggataatttgaactaagtttaggtagggcctcaataagtgatttcaattaa 5477
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 acttaagtgggataatttgaactaagtttaggtagggcctcaataagtgatttcaattaa 660
Query: 5478 aaaaacacaaagct 5491
||||||||||||||
Sbjct: 661 aaaaacacaaagct 674
>BF14_1861_C1
Length = 998
Score = 214 bits (108), Expect = 1e-54
Identities = 108/108 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 5729 tttaatattcatgaatttaatgacatagaaatttattatggaagttgaggttgagaagtt 5788
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 tttaatattcatgaatttaatgacatagaaatttattatggaagttgaggttgagaagtt 60
Query: 5789 ttatgaaatacttatgtatacatctttgttttataaaaatatgatata 5836
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 ttatgaaatacttatgtatacatctttgttttataaaaatatgatata 108
>BF01005A2B10
Length = 440
Score = 194 bits (98), Expect = 1e-48
Identities = 137/150 (91%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3753 ttccgtgtggacaagatcgactccagctgggacggcagtctggccatcggtggcgtagcg 3812
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || |
Sbjct: 225 ttccgtgtggacaagatcgactccagctgggacggtagtctggccatcggtggtgcaggg 284
Query: 3813 tgtctccccgacggcgtgcccgagagcgccatgagactcgacccgcccgtctggctgctg 3872
|| | ||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 285 tgcccccccgacggcgtgcccgggagcgccgtgaaattcgacccgcccgtctggttgctg 344
Query: 3873 tccagtgatttacactacgatggaaataat 3902
||||| ||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 345 tccagcgatttacgctacgatggaaataat 374
Database: est
Posted date: Jul 14, 2011 2:25 PM
Number of letters in database: 8,280,457
Number of sequences in database: 9484
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Sequences: 9484
Number of Hits to DB: 555,783
Number of extensions: 10296
Number of successful extensions: 10296
Number of sequences better than 1.0e-10: 4
Number of HSP's gapped: 10292
Number of HSP's successfully gapped: 4
Length of query: 5836
Length of database: 8,280,457
Length adjustment: 18
Effective length of query: 5818
Effective length of database: 8,109,745
Effective search space: 47182496410
Effective search space used: 47182496410
X1: 11 (21.8 bits)
X2: 15 (29.7 bits)
X3: 50 (99.1 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 35 (69.9 bits)