BLASTN 2.2.24 [Aug-08-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= DPGLEAN21518 (UTR included)
(2584 letters)
Database: est
9484 sequences; 8,280,457 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
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BF14_770_C1 1152 0.0
>BF14_2055_C1
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Identities = 947/953 (99%), Gaps = 1/953 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 518 agatgggtacctccgcaattgcacgcctcctgccatcgacgactttccggcgggactttt 577
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Query: 997 aagccttcttcttggttctgctgtatggagtgtacatttgcattatgtactacgacaaat 1056
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Query: 1057 caattcaaaatttcgctaaagggagttggacgtgtgtgtccaatatgttaaaaaaagaca 1116
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Query: 1177 cttccattaagaatgaatcattagtagagcatcaccaacataatggtaatgtcaaaaaca 1236
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Query: 1237 taactctttatgcagatacaaacgaaaagaaaaatgttatcgatactgaactacaaattg 1296
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Query: 1297 acaaaactaaaattgaagaaacaaacgaagaggaacacagaattagtaatatggaaatag 1356
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Query: 1357 ctacaccagaagatggaaatcgcgaaaatattgaacaagggaacaaagaatcgatagatg 1416
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Query: 1417 agtatgaacactctctgtggaaatggccatcaggaagaagtaatctcacaaag 1469
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Sbjct: 1011 agtatgaacactctctgtggaaatggccatcaggaagaagtaatctcacaaag 1063
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Identities = 205/206 (99%)
Strand = Plus / Plus
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Query: 1692 tctgtacccgaagcagtatcaagtgttatagttgcaaaacaaggacatggctcaatgggc 1751
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Query: 1752 atcagtaattcgattggatcaaacacatttgatattcttctgtgtctaggtctaccatgg 1811
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Sbjct: 1183 atcagtaattcgattggatcaaacacatttgatattcttctgtgtctaggtctaccgtgg 1242
Query: 1812 cttattaaagcttcgttaacacccgc 1837
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Sbjct: 1243 cttattaaagcttcgttaacacccgc 1268
Score = 222 bits (112), Expect = 2e-57
Identities = 112/112 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 130 tttcccattatgtgccgccgagcgctggccgcggcatttggacgccactgacaacgctct 189
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Sbjct: 1 tttcccattatgtgccgccgagcgctggccgcggcatttggacgccactgacaacgctct 60
Query: 190 cggtcgtatccgtgtgatccctccgtcaacgagatgaatgcctccgaacgag 241
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Sbjct: 61 cggtcgtatccgtgtgatccctccgtcaacgagatgaatgcctccgaacgag 112
>BF01032B1H10
Length = 658
Score = 1296 bits (654), Expect = 0.0
Identities = 657/658 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1310 tgaagaaacaaacgaagaggaacacagaattagtaatatggaaatagctacaccagaaga 1369
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Sbjct: 1 tgaagaaacaaacgaagaggaacacagaattagtaatatggaaatagctacaccagaaga 60
Query: 1370 tggaaatcgcgaaaatattgaacaagggaacaaagaatcgatagatgagtatgaacactc 1429
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Sbjct: 61 tggaaatcgcgaaaatattgaacaagggaacaaagaatcgatagatgagtatgaacactc 120
Query: 1430 tctgtggaaatggccatcaggaagaagtaatctcacaaagataacatggattattacatg 1489
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Sbjct: 121 tctgtggaaatggccatcaggaagaagtaatctcacaaagataacatggattattacatg 180
Query: 1490 gccgatacatctcgtctttttctttacgattccagattgtgagaaaccgcgatttaagaa 1549
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Query: 1550 ttggtttcccttaacttttatcatgtgtatagtttggataggatcactttcatacatcgt 1609
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Sbjct: 241 ttggtttcccttaacttttatcatgtgtatagtttggataggatcactttcatacatcgt 300
Query: 1610 agcttggatgataactataattggtgataccttaatgataccagattcagttatgggaat 1669
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Sbjct: 301 agcttggatgataactataattggtgataccttaatgataccagattcagttatgggaat 360
Query: 1670 aacatttttagcagcgggtacatctgtacccgaagcagtatcaagtgttatagttgcaaa 1729
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Query: 1730 acaaggacatggctcaatgggcatcagtaattcgattggatcaaacacatttgatattct 1789
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Query: 1790 tctgtgtctaggtctaccatggcttattaaagcttcgttaacacccgctgaacctggtca 1849
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Query: 1850 ttattgggtgaagataaactctatgggtcttgagtattcggcgatatcgctgctatcaac 1909
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Query: 1910 tttgttgctgctttatcttacgttttggttcaacaagtttaagctcgatgcagctgtc 1967
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Sbjct: 601 tttgttgctgctttatcttacgttttggttcaacaagtttaagctcgatgcagctgtc 658
>BF14_770_C1
Length = 1383
Score = 1152 bits (581), Expect = 0.0
Identities = 599/605 (99%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1980 ttagccatgtatgccatgtttttagttcttgctactcttattgagttaaatgttttcttc 2039
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Query: 2040 cctgtaaatgttcgcacttgcaggagaaacgaattaaaatcttaaagtataaaagtgcta 2099
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Sbjct: 1322 cctgtaaatgttcgcacttgcaggagaaacgaattaaaatcttaaagtgtaaaagtgcta 1263
Query: 2100 acgattggcttttcttaaagatcattatttggagatactcgtacaacgctaaaatttcaa 2159
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Sbjct: 1262 acgattggcttttcttaaagatcattatttggagatactcgtacaacgctaaaatttcaa 1203
Query: 2160 attattactaattaatattatttaattacccacttgaatgtacaatacgtttagcatagg 2219
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Sbjct: 1202 attattactaattaatattatttaattacccacttgaatgtacaatacgtttagcatagg 1143
Query: 2220 atgttctgattaaagtattttcttttatataaaatatttttattaagtatcatagtttct 2279
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Query: 2280 tttatcacataaaattcccgaactagatatttccaaattatctttagtttgtgatgaaag 2339
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Sbjct: 1082 tttatcacataaaattcccgaactagatatttccaaattatctttagtttgtgatgaaag 1023
Query: 2340 aagtgactatttatcattgttatattaagtaggactttgattaagtactacttttcatgt 2399
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Sbjct: 1022 aagtgactatttatcattgttatattaagtaggactttgattaagtactacttttcatgt 963
Query: 2400 aaacagcaatgaaaaatgtagtttaattagaatagataagtataattgagagcaattttt 2459
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Sbjct: 962 aaacagcaatgaaaaatgtagtttaattagaatatataagaataattgagagcaattttt 903
Query: 2460 tttgtttttaagatatacccttatcaatttctaacgtagtattgttttgctgctaattta 2519
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Sbjct: 902 tttgtttttaagatatacccttatcaatttctaacgtagtattgttttgctgctaattta 843
Query: 2520 tgtgcactttttaaccgattttaaatttcattgattatttcagtgtcaattaaaatattt 2579
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Sbjct: 842 tgtgcactttttaaccgattttaaatttcaatgattatttcaatgtcaattaaaatattt 783
Query: 2580 ttctt 2584
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Sbjct: 782 ttctt 778
Database: est
Posted date: Jul 14, 2011 2:25 PM
Number of letters in database: 8,280,457
Number of sequences in database: 9484
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Sequences: 9484
Number of Hits to DB: 291,157
Number of extensions: 5857
Number of successful extensions: 5857
Number of sequences better than 1.0e-10: 3
Number of HSP's gapped: 5854
Number of HSP's successfully gapped: 5
Length of query: 2584
Length of database: 8,280,457
Length adjustment: 17
Effective length of query: 2567
Effective length of database: 8,119,229
Effective search space: 20842060843
Effective search space used: 20842060843
X1: 11 (21.8 bits)
X2: 15 (29.7 bits)
X3: 50 (99.1 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 34 (67.9 bits)