BLASTN 2.2.24 [Aug-08-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= DPGLEAN21857 (UTR included)
(7624 letters)
Database: est
9484 sequences; 8,280,457 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
BF14_275_C1 2420 0.0
BF01014B2D12 88 2e-16
>BF14_275_C1
Length = 1221
Score = 2420 bits (1221), Expect = 0.0
Identities = 1221/1221 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 5432 cccgatcgtgccttgcaacgatgagacgtcgccgatattgacatcggaggactccccagt 5491
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Sbjct: 1 cccgatcgtgccttgcaacgatgagacgtcgccgatattgacatcggaggactccccagt 60
Query: 5492 aaaggacgactcgctatgtttagcgcgtcagtacaagaggaacatcatggacatgtacag 5551
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Sbjct: 61 aaaggacgactcgctatgtttagcgcgtcagtacaagaggaacatcatggacatgtacag 120
Query: 5552 tcgggacaggacgcgctcggacagcgggcaggggtcggacgaccagtgtaacatagacca 5611
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Sbjct: 121 tcgggacaggacgcgctcggacagcgggcaggggtcggacgaccagtgtaacatagacca 180
Query: 5612 cgacgtcctcaacgtcaacatcaagggagcccacgacaccgaacacatcaggcgaatcat 5671
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Sbjct: 181 cgacgtcctcaacgtcaacatcaagggagcccacgacaccgaacacatcaggcgaatcat 240
Query: 5672 aggagtccccacgcccgaggacgaggcgccgcccgagatcaccggctcgagctcaccggt 5731
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Sbjct: 241 aggagtccccacgcccgaggacgaggcgccgcccgagatcaccggctcgagctcaccggt 300
Query: 5732 caacaacaacaacaacctggagctggaggagagtctgtacgataaagtcgtacccatgga 5791
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Sbjct: 301 caacaacaacaacaacctggagctggaggagagtctgtacgataaagtcgtacccatgga 360
Query: 5792 catagacaccaccgtcatcacgcagaccaagatagagtccaacgacctgctggcggacat 5851
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Sbjct: 361 catagacaccaccgtcatcacgcagaccaagatagagtccaacgacctgctggcggacat 420
Query: 5852 gaagggcatcgagagccccaacgacaaggcgaacagctcccagtccgcagacaccagcgg 5911
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Sbjct: 421 gaagggcatcgagagccccaacgacaaggcgaacagctcccagtccgcagacaccagcgg 480
Query: 5912 caactcctcgccgcagagagacgagatggacgacatacagaaaaagatacactccttcca 5971
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Sbjct: 481 caactcctcgccgcagagagacgagatggacgacatacagaaaaagatacactccttcca 540
Query: 5972 caccgagaacatcatgatactgaagagcaggaacaagaaaccgcccaaggaaaagaggaa 6031
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Sbjct: 541 caccgagaacatcatgatactgaagagcaggaacaagaaaccgcccaaggaaaagaggaa 600
Query: 6032 gaaggtcaacctgaacttcgacctcaacatggtggacgaccgggtcagcatacagttgcg 6091
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Sbjct: 601 gaaggtcaacctgaacttcgacctcaacatggtggacgaccgggtcagcatacagttgcg 660
Query: 6092 gaccgacgacgactccagctccaagtcctcggagctcaacggagacggccacgacgaccc 6151
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Sbjct: 661 gaccgacgacgactccagctccaagtcctcggagctcaacggagacggccacgacgaccc 720
Query: 6152 tgacgacaagctgcacgtggcgccagagaacatcccgctgccgcccgtggagtccatccc 6211
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Sbjct: 721 tgacgacaagctgcacgtggcgccagagaacatcccgctgccgcccgtggagtccatccc 780
Query: 6212 gctgcccgcgccagagaccatcccgttgcccgaggaacccgccccgctggcgctcatctc 6271
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Sbjct: 781 gctgcccgcgccagagaccatcccgttgcccgaggaacccgccccgctggcgctcatctc 840
Query: 6272 ctcccccgagaccatcccgctgcccgaggagaccatgaagcctctcaaacccgtcaacgc 6331
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Sbjct: 841 ctcccccgagaccatcccgctgcccgaggagaccatgaagcctctcaaacccgtcaacgc 900
Query: 6332 catcccccacacggagagagccgaccggagagaaaaggagcccgccgacacgatgtcctt 6391
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Sbjct: 901 catcccccacacggagagagccgaccggagagaaaaggagcccgccgacacgatgtcctt 960
Query: 6392 ctccaccaggttcaattccaccggcctgttctcggggatattcagcaacatcgcgcacaa 6451
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Sbjct: 961 ctccaccaggttcaattccaccggcctgttctcggggatattcagcaacatcgcgcacaa 1020
Query: 6452 gtatagagtggacggctgcatcaacgaaaacatacccaacatgtcgatcattaagagtgc 6511
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Sbjct: 1021 gtatagagtggacggctgcatcaacgaaaacatacccaacatgtcgatcattaagagtgc 1080
Query: 6512 tatagacaggactacaagtttagataatagtttgttcgacaaggagagtgcgggtcaggt 6571
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Sbjct: 1081 tatagacaggactacaagtttagataatagtttgttcgacaaggagagtgcgggtcaggt 1140
Query: 6572 ggacgagctgaagagtgtacaggagatcctcacccgcgttaacaatatggactctaataa 6631
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Sbjct: 1141 ggacgagctgaagagtgtacaggagatcctcacccgcgttaacaatatggactctaataa 1200
Query: 6632 cagtgtgttgttgtcgggggt 6652
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Sbjct: 1201 cagtgtgttgttgtcgggggt 1221
>BF01014B2D12
Length = 734
Score = 87.7 bits (44), Expect = 2e-16
Identities = 47/48 (97%)
Strand = Plus / Plus
Query: 7546 cacacacacacgcaaacacacacacacacacacacacacacacacaca 7593
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Sbjct: 73 cacacacacacacaaacacacacacacacacacacacacacacacaca 120
Score = 87.7 bits (44), Expect = 2e-16
Identities = 75/84 (89%), Gaps = 1/84 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 7509 cacacacacacatactgcacacacatacacacgcgcgcacacacacacgcaaacacacac 7568
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Sbjct: 75 cacacacacacaaaca-cacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacac 133
Query: 7569 acacacacacacacacacacacac 7592
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Sbjct: 134 acacacacacacacacacacacac 157
Score = 87.7 bits (44), Expect = 2e-16
Identities = 62/68 (91%)
Strand = Plus / Plus
Query: 7526 cacacacatacacacgcgcgcacacacacacgcaaacacacacacacacacacacacaca 7585
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Sbjct: 79 cacacacaaacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca 138
Query: 7586 cacacaca 7593
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Sbjct: 139 cacacaca 146
Score = 87.7 bits (44), Expect = 2e-16
Identities = 62/68 (91%)
Strand = Plus / Plus
Query: 7526 cacacacatacacacgcgcgcacacacacacgcaaacacacacacacacacacacacaca 7585
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Sbjct: 89 cacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca 148
Query: 7586 cacacaca 7593
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Sbjct: 149 cacacaca 156
Score = 85.7 bits (43), Expect = 1e-15
Identities = 61/67 (91%)
Strand = Plus / Plus
Query: 7527 acacacatacacacgcgcgcacacacacacgcaaacacacacacacacacacacacacac 7586
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Sbjct: 88 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacac 147
Query: 7587 acacaca 7593
|||||||
Sbjct: 148 acacaca 154
Score = 81.8 bits (41), Expect = 1e-14
Identities = 56/61 (91%)
Strand = Plus / Plus
Query: 7533 atacacacgcgcgcacacacacacgcaaacacacacacacacacacacacacacacacac 7592
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Sbjct: 40 atacacacacacacacacacacacacaaacacacacacacacacacaaacacacacacac 99
Query: 7593 a 7593
|
Sbjct: 100 a 100
Score = 81.8 bits (41), Expect = 1e-14
Identities = 75/85 (88%), Gaps = 1/85 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 7509 cacacacacacatactgcacacacatacacacgcgcgcacacacacacgcaaacacacac 7568
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Sbjct: 43 cacacacacacacaca-cacacacaaacacacacacacacacacaaacacacacacacac 101
Query: 7569 acacacacacacacacacacacaca 7593
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Sbjct: 102 acacacacacacacacacacacaca 126
Score = 79.8 bits (40), Expect = 6e-14
Identities = 61/68 (89%)
Strand = Plus / Plus
Query: 7526 cacacacatacacacgcgcgcacacacacacgcaaacacacacacacacacacacacaca 7585
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Sbjct: 95 cacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca 154
Query: 7586 cacacaca 7593
||| ||||
Sbjct: 155 cactcaca 162
Score = 73.8 bits (37), Expect = 4e-12
Identities = 74/85 (87%), Gaps = 1/85 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 7509 cacacacacacatactgcacacacatacacacgcgcgcacacacacacgcaaacacacac 7568
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Sbjct: 113 cacacacacacacaca-cacacacacacacacacacacacacacactcacaaacacagac 171
Query: 7569 acacacacacacacacacacacaca 7593
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Sbjct: 172 acacacacaaacacacacacacaca 196
Score = 71.9 bits (36), Expect = 1e-11
Identities = 60/68 (88%)
Strand = Plus / Plus
Query: 7526 cacacacatacacacgcgcgcacacacacacgcaaacacacacacacacacacacacaca 7585
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Sbjct: 101 cacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacactca 160
Query: 7586 cacacaca 7593
|| |||||
Sbjct: 161 caaacaca 168
Score = 69.9 bits (35), Expect = 6e-11
Identities = 59/67 (88%)
Strand = Plus / Plus
Query: 7527 acacacatacacacgcgcgcacacacacacgcaaacacacacacacacacacacacacac 7586
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Sbjct: 42 acacacacacacacacacacacacaaacacacacacacacacacaaacacacacacacac 101
Query: 7587 acacaca 7593
|||||||
Sbjct: 102 acacaca 108
Database: est
Posted date: Jul 14, 2011 2:25 PM
Number of letters in database: 8,280,457
Number of sequences in database: 9484
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Sequences: 9484
Number of Hits to DB: 99,959
Number of extensions: 13583
Number of successful extensions: 13583
Number of sequences better than 1.0e-10: 2
Number of HSP's gapped: 13473
Number of HSP's successfully gapped: 12
Length of query: 7624
Length of database: 8,280,457
Length adjustment: 18
Effective length of query: 7606
Effective length of database: 8,109,745
Effective search space: 61682720470
Effective search space used: 61682720470
X1: 11 (21.8 bits)
X2: 15 (29.7 bits)
X3: 50 (99.1 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 35 (69.9 bits)