BLASTN 2.2.24 [Aug-08-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= DPGLEAN22020 (UTR included)
(1825 letters)
Database: est
9484 sequences; 8,280,457 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
BF14_3232_C1 3178 0.0
>BF14_3232_C1
Length = 1631
Score = 3178 bits (1603), Expect = 0.0
Identities = 1624/1631 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 47 ttgagtgttttttgtggaataatttggttaaaatgtggaagaccttatcgttaccaataa 106
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 ttgagtgttttttgtggaataatttggttaaaatgtggaagaccttatcgttaccaataa 60
Query: 107 tttccttgtgaatagttaatgtaatttgaattatcgaatatttagcatatatcatcaatg 166
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 61 tttccttgtgaatagttaatgtaatttgaattatcgaatatttaacatatatcatcaatg 120
Query: 167 gccgcgtaactaatactgtttaacactgtttgacattgagtcttgagatgagattggaat 226
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 gccgcgtaactaatactgtttaacactgtttgacattgagtcttgagatgagattggaat 180
Query: 227 acaataggcaatacgcatttcctcttcttcaattattatttctcattgagatttaaacat 286
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 acaataggcaatacgcatttcctcttcttcaattattatttctcattgagatttaaacat 240
Query: 287 atagtattctttactaaacgtttaactttacaaaaactgtatccagcatatcttcaatat 346
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 atagtattctttactaaacgtttaactttacaaaaactgtatccagcatatcttcaatat 300
Query: 347 gacgaaccaattatctgttctaaaactttataatgctgtagtggatgatgtgatagccgg 406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 gacgaaccaattatctgttctaaaactttataatgctgtagtggatgatgtgatagccgg 360
Query: 407 agtgcgagactgttttctggacgatggtgtagatgaaacggtattacaagagttaaaaca 466
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 agtgcgagactgttttctggacgatggtgtagatgaaacggtattacaagagttaaaaca 420
Query: 467 gttatggaaaactaaattaacagcaagtggcgcaatggatcccccccatcccgatccacc 526
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 gttatggaaaactaaattaacagcaagtggcgcaatggatcccccccatcccgatccacc 480
Query: 527 aacgatgcctccgccacccgtattactacagaattttcctaaagctaatggaggcagtat 586
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 aacgatgcctccgccacctgtattactacagaattttcctaaagctaatggaggcagtat 540
Query: 587 attacctaaaagagctccagatatggcatctcaaagttcaagccactccggaggtgagca 646
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 attacctaaaagagctccagatatggcatctcaaagttcaagccactccggaggtgagca 600
Query: 647 tggtggtcctacaaacatagccggtgctcatcctcaccatggcattgacccaaataataa 706
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 tggtggtcctacaaacatagccggtgctcatcctcaccatggcattgacccaaataataa 660
Query: 707 agtgccagtgcaattgacattacctgctcagcctggtgtgcctggttcacagccacggtc 766
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661 agtgccagtgcaattgacattacctgctcagcctggtgtgcctggttcacagccacggtc 720
Query: 767 atttactattcaaattccagcatctgccttaaatgggaacaaacttcaccaagttttgac 826
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 721 atttactattcaaattccagcatctgccttaaatgggaacaaacttcaccaagttttgac 780
Query: 827 aggccctataataaatgcaacaattagtttgccgcaacccctagctgcgactcttttaca 886
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 781 aggccctataataaatgcaacaattagtttgcctcaacccctagctgcgactcttttaca 840
Query: 887 gcaacatataaattcaacattagccggtcaacaaaatgaatttgatggaggcgggggagg 946
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 841 gcaacatataaattcaacattagccggtcaacaaaatgaatttgatggaggcgggggagg 900
Query: 947 tagaagtggagcggcaccattttctcttgacggtgcattagattcttctgatgatgaggg 1006
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 901 tagaagtggagcggcaccattttctcttgacggtgcattagattcttctgatgatgaggg 960
Query: 1007 ttcaatagttggcgatggttcagaagagggtgctggtgacgaggacgaagatgaggaatc 1066
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 961 ttcaatagttggcgatggttcagaagagggtgctggtgacgaggacgaagatgaggaatc 1020
Query: 1067 tgcggaagagagagcagaggaagaagaggaggaaagagatgaaagtggtggggcagagga 1126
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1021 tgcggaagagagagcagaggaagaagaggaggaaagagatgaaagtggtggggcagagga 1080
Query: 1127 ggaaccactcaactcgggggatgatgtgtccgatgaggaaccaggtgacatgttcgacac 1186
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1081 ggaaccactcaactcgggggatgatgtgtccgatgaggaaccaggtgacatgttcgacac 1140
Query: 1187 tgacaatgtagtggtttgtcaatacgataaaatcacacgcagccgtaacaagtggaagtt 1246
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1141 tgacaatgtagtggtttgtcaatacgataaaatcacacgcagccgtaacaagtggaagtt 1200
Query: 1247 ccatttaaaagatggtataatgaatttatcgggtaaagattatgtctttcaaaaagccaa 1306
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1201 ccatttaaaagatggtataatgaatttatcgggtaaagattatgtctttcaaaaagccaa 1260
Query: 1307 cggtgatgcggaatggtgagatgtgatttgtacttgtgtataaagagtgtaatgtggaaa 1366
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1261 cggtgatgcagaatggtgagatgtgatttgtacttgtgtataaagagtgtaatgtggaaa 1320
Query: 1367 tgattgccaggaattaggtaaatgcggatttaaaggcacattaactttgccttcatacac 1426
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||
Sbjct: 1321 tgattgccaggaattaggtaaatgcggatttaaaggcacattaactttgcctgcttacac 1380
Query: 1427 atacatgtaagattcattaaaaaaatataactgtttatttatgtaaagtctttggcaagt 1486
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1381 atacatgtaagattcattaaaaaaatataactgtttatttatgtaaagtctttggcaagt 1440
Query: 1487 attttcgtattttgaatgtaaccagtttattctggtcgtgataagtctgttggtaattgc 1546
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1441 attttcgtattttgaatgtaaccagtttattctggtcgtgataagtctgttggtaattgc 1500
Query: 1547 tcatgataactgaattaatctgcctgtattaggctaaccttcatggacaagctattgtat 1606
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1501 tcatgatatctgaattaatctgcctgtattaggctaaccttcatggacaagctattgtat 1560
Query: 1607 ttggtgcaaccttgtggtgtatgtgaattgaatgtatgatggtgttgtggtgtgtgagct 1666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1561 ttggtgcaaccttgtggtgtatgtgaattgaatgtatgatggtgttgtggtgtgtgagct 1620
Query: 1667 atgctagcttc 1677
|||||||||||
Sbjct: 1621 atgctagcttc 1631
Database: est
Posted date: Jul 14, 2011 2:25 PM
Number of letters in database: 8,280,457
Number of sequences in database: 9484
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Sequences: 9484
Number of Hits to DB: 230,001
Number of extensions: 5219
Number of successful extensions: 5219
Number of sequences better than 1.0e-10: 1
Number of HSP's gapped: 5219
Number of HSP's successfully gapped: 1
Length of query: 1825
Length of database: 8,280,457
Length adjustment: 17
Effective length of query: 1808
Effective length of database: 8,119,229
Effective search space: 14679566032
Effective search space used: 14679566032
X1: 11 (21.8 bits)
X2: 15 (29.7 bits)
X3: 50 (99.1 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 34 (67.9 bits)